تفاوت اصلی بین موتیف و دامنه این است که موتیف به طور مستقل پایدار نیست در حالی که دامنه به طور مستقل پایدار است.
پروتئین ها درشت مولکول های بیولوژیکی مهمی هستند که در بدن ما وجود دارند. از سوی دیگر، کد ژنتیکی یک ژن، توالی اسید آمینه یک پروتئین را تعیین می کند. علاوه بر این، پروتئین ها دارای ساختارهای اولیه، ثانویه و سوم هستند. ساختار اولیه توالی اسید آمینه زنجیره پلی پپتیدی است. هنگامی که زنجیره های پلی پپتیدی با یکدیگر تا می شوند، ساختار ثانویه پروتئین را تشکیل می دهد. مارپیچ های آلفا، صفحات بتا و ساختارهای فوق ثانویه متعلق به ساختارهای ثانویه هستند.گروه بندی خاصی از عناصر فوق ثانویه به عنوان نقوش پروتئینی شناخته می شوند. ساختار سوم پروتئین به ساختار سه بعدی آن اشاره دارد که عملکرد پروتئین را تعیین می کند. دامنه یک بخش چین خورده از یک مولکول پروتئین است که کروی است و عملکردی مجزا دارد. این ساختار عملکردی و سه بعدی پروتئین است.
موتیف چیست؟
موتیف گروه بندی خاصی از عناصر فوق ثانویه پروتئین ها مانند مارپیچ آلفا و ساختارهای بتا است. آنها نوعی الگوهای موجود در پروتئین های مختلف هستند. نقوش الگوهای تاشو عناصر ساختاری ثانویه و تعامل آنها را توصیف می کند. این الگوهای تاشو با پیوندهای مشابهی که در ساختارهای درجه سوم وجود دارند، تثبیت می شوند. با این حال، آنها به اندازه ساختارهای سوم پیچیده نیستند.
شکل 01: موتیف
آنها ترکیب ساده ای از ساختارهای ثانویه پروتئین ها هستند. موتیف به خودی خود پایدار نیست. علاوه بر این، موتیف ها ساختار پروتئین را توضیح می دهند اما عملکرد پروتئین را پیش بینی نمی کنند. نمونه‌هایی از نقوش پروتئین عبارتند از: موتیف بتا-آلفا-بتا، موتیف کلید یونانی، بشکه بتا، موتیف بتا-میاندر، و غیره.
دامنه چیست؟
دامنه یک واحد اساسی، عملکردی و سه بعدی پروتئین است. عملکرد خاصی را انجام می دهد. یک پروتئین واحد می تواند چندین حوزه مجزا داشته باشد. هر دامنه یک واحد مستقل است. این یک ساختار کروی است. مسئول یک عملکرد یا تعامل خاص است. از دامنه ها می توان برای فرضیه عملکرد یک پروتئین نامشخص استفاده کرد. هنگام تجزیه و تحلیل یک پروتئین، مهم است که در نظر گرفته شود زیرا دامنه ها واحدهای عملکردی پروتئین هستند.
شکل 02: سه دامنه مختلف پیرووات کیناز
دامنه ها ساختارهای بسیار پایدار و فشرده ای هستند. آنها را می توان به راحتی از سایر مناطق تشخیص داد. پیروات کیناز دارای سه حوزه متمایز است که در شکل 02 نشان داده شده است. طول دامنه می تواند متفاوت باشد و طول متوسط آن 100 اسید آمینه است. هر دامنه حاوی یک هسته آبگریز است که از واحدهای ساختاری ثانویه ساخته شده است. چندین حوزه در مجموع ساختار سوم یک پروتئین را می سازند.
شباهت‌های بین موتیف و دامنه چیست؟
- موتیف و دامنه واحدهای موجود در خود مولکول های پروتئین هستند.
- هنگام طبقه بندی خانواده های پروتئینی مفید هستند.
تفاوت بین موتیف و دامنه چیست؟
موتیف گروه بندی خاصی از عناصر فوق ثانویه پروتئین ها مانند مارپیچ آلفا و ساختارهای بتا است در حالی که دامنه واحد عملکردی یک پروتئین است.علاوه بر این، موتیف یک ساختار ثانویه است در حالی که دامنه مسئول ساختار سوم پروتئین است. علاوه بر این، دامنه برخلاف موتیف یک واحد مستقل است. همچنین دامنه عملکرد یک پروتئین را نشان می دهد در حالی که موتیف اینطور نیست. اینها تفاوت های اصلی بین موتیف و دامنه هستند. اینفوگرافیک زیر تفاوت بین موتیف و دامنه را به شکل جدول نشان می دهد.
خلاصه - موتیف در مقابل دامنه
موتیف آرایش ساختارهای ثانویه مولکول پروتئین است. برخلاف دامنه، معمولاً به خودی خود پایدار نیست. دامنه یک ساختار مستقل از یک پروتئین است. بنابراین، می تواند یک مولکول پروتئینی جزئی یا کامل باشد. این یک واحد عملکردی اساسی سه بعدی پروتئین است. علاوه بر این، یک عملکرد دارد و یک واحد مستقل است.موتیف می تواند بخشی از دامنه باشد. اما دامنه نمی تواند بخشی از یک موتیف باشد. این تفاوت بین موتیف و دامنه است.
