تفاوت اصلی بین زیرواحد پروتئین و دامنه در این است که یک زیرواحد پروتئین یک زنجیره پلی پپتیدی جداگانه از یک پروتئین است که با زنجیره های پلی پپتیدی دیگر ترکیب می شود تا یک کمپلکس پروتئینی را تشکیل دهد در حالی که دامنه پروتئین یک ناحیه پیوسته از زنجیره پلی پپتیدی است. پروتئینی که اغلب به طور مستقل به یک واحد فشرده، محلی و نیمه مستقل تا می شود.
زیرواحد و دامنه پروتئین بخش های بسیار مهمی از پروتئین مولتیمری هستند. پروتئین ها پلیمرهایی هستند که از پلی پپتیدها ساخته می شوند. هر زنجیره پلی پپتیدی از یک مونومر به نام اسید آمینه ساخته می شود. یک پروتئین پیچیده شامل واحدهای ساختاری متمایز مانند زیر واحدها، دامنه ها، موتیف و چین است.این واحدهای ساختاری یک پروتئین پیچیده برای ساختار آن و در نهایت برای عملکرد آن بسیار مهم هستند.
یک زیرواحد پروتئین چیست؟
یک زیرواحد پروتئین یک زنجیره پلی پپتیدی جداگانه از یک پروتئین است که با زنجیره های پلی پپتیدی دیگر ترکیب می شود و یک کمپلکس پروتئینی را تشکیل می دهد. در زیست‌شناسی ساختاری، یک زیرواحد پروتئین یک مولکول پروتئینی منفرد است که با مولکول‌های پروتئین دیگر ترکیب می‌شود و یک کمپلکس پروتئینی را تشکیل می‌دهد. پروتئین های طبیعی دارای تعداد نسبتاً کمی زیر واحد مانند هموگلوبین و DNA پلیمراز هستند. بنابراین به آنها الیگومریک می گویند. سایر پروتئین ها از تعداد زیادی زیر واحد تشکیل شده اند، بنابراین آنها را به عنوان مولتی مری توصیف می کنند. به عنوان مثال، میکروتوبول ها و سایر پروتئین های اسکلت سلولی مولتیمر هستند. زیرواحدهای پروتئین مولتی مری ممکن است یکسان (همولوگ) یا کاملاً متفاوت (هترولوگ) باشند.
شکل 01: زیرواحد پروتئین
در برخی از پروتئین های مولتی مری، یک زیر واحد ممکن است یک زیر واحد کاتالیزوری باشد. از طرف دیگر، یکی دیگر یک زیر واحد نظارتی است. عملکرد زیرواحد کاتالیزوری کاتالیزور واکنش آنزیمی است در حالی که عملکرد زیر واحد تنظیمی باعث تسهیل یا مهار فعالیت آن می شود. آنزیمی که از هر دو زیر واحد کاتالیزوری و تنظیمی تشکیل شده است، معمولاً به عنوان هولوآنزیم نامیده می شود. به عنوان مثال، آنزیم کلاس I phosphoinositide 3-kinase دارای یک زیر واحد کاتالیزوری p110 و یک زیر واحد تنظیم کننده p85 است. علاوه بر این، یک پروتئین باید یک ژن برای هر زیر واحد داشته باشد. این به این دلیل است که یک زیر واحد از یک زنجیره پلی پپتیدی مجزا تشکیل شده است که دارای یک ژن کد کننده است.
دامنه پروتئین چیست؟
دامنه پروتئینی یک ناحیه پیوسته از زنجیره پلی پپتیدی یک پروتئین است که اغلب به طور مستقل به یک واحد فشرده، محلی و نیمه مستقل تا می شود.دامنه یک پروتئین همچنین به عنوان منطقه ای از زنجیره پلی پپتیدی پروتئین شناخته می شود که خود تثبیت می شود و مستقل از بقیه تا می شود. آنها یک واحد ساختاری و عملکردی متمایز در یک پروتئین هستند. به طور معمول، دامنه ها مسئول یک عملکرد خاص یا یک تعامل هستند که به نقش کلی پروتئین کمک می کند. به عنوان مثال، دامنه SH3 حدود 50 اسید آمینه باقی مانده است. آنها در طیف متنوعی از پروتئین ها، از جمله پروتئین های آداپتور، ففاتیدیلینوزیتول 3- کینازها، فسفولیپازها و میوزین ها وجود دارند. این دامنه های SH3 در برهمکنش های پروتئین-پروتئین نقش دارند.
شکل 02: دامنه های پروتئین
طول دامنه ها از 50 اسید آمینه تا 250 اسید آمینه متغیر است. کوتاه ترین دامنه ها، مانند انگشت روی، توسط یون های فلزی و پل های دی سولفید تثبیت می شوند.یک دامنه اغلب واحدهای عملکردی مانند دامنه EF-دستی کلسیمی کالمودولین تولید می کند. علاوه بر این، دامنه ها را می توان از طریق مهندسی ژنتیک بین یک پروتئین به پروتئین دیگر برای ساخت پروتئین های کایمریک مبادله کرد.
شباهت‌های بین زیر واحد پروتئین و دامنه چیست؟
- زیر واحد پروتئین و دامنه واحدهای ساختاری یک پروتئین چندمری هستند.
- هر دو از اسیدهای آمینه تشکیل شده اند.
- آنها به اصطلاح "زنجیره پلی پپتیدی" متصل هستند.
- علاوه بر این، هر دو برای عملکرد کلی پروتئین بسیار مهم هستند.
تفاوت بین زیرواحد پروتئین و دامنه چیست؟
یک زیرواحد پروتئین یک زنجیره پلی پپتیدی جداگانه از یک پروتئین است که با زنجیره های پلی پپتیدی دیگر ترکیب می شود و یک کمپلکس پروتئینی را تشکیل می دهد. از طرف دیگر، یک دامنه پروتئینی یک ناحیه پیوسته از زنجیره پلی پپتیدی یک پروتئین است که اغلب به طور مستقل به یک واحد فشرده، محلی و نیمه مستقل تا می شود.بنابراین، این تفاوت کلیدی بین زیر واحد پروتئین و دامنه است. علاوه بر این، یک زیرواحد پروتئین از نظر اندازه بزرگتر از دامنه پروتئین است.
جدول زیر تفاوت بین زیر واحد پروتئین و دامنه را به شکل جدولی خلاصه می کند.
خلاصه - زیرواحد پروتئین در مقابل دامنه
بلوک های سازنده پروتئین ها اسیدهای آمینه هستند. پروتئین ها از تراکم اسیدهای آمینه تشکیل می شوند. اندازه ساختارهای پروتئین از ده ها تا چندین هزار آمینو اسید متغیر است. ساختار پروتئین توسط برهمکنش های غیرکووالانسی مانند پیوندهای هیدروژنی، پیوندهای یونی، نیروهای واندروالس، پیوندهای آبگریز و برهمکنش های کووالانسی مانند پیوندهای دی سولفید تثبیت می شود. یک پروتئین پیچیده شامل واحدهای ساختاری متمایز مانند زیر واحدها، دامنه ها، موتیف و چین است. یک زیرواحد پروتئین یک زنجیره پلی پپتیدی جداگانه از یک پروتئین است که با زنجیره های پلی پپتیدی دیگر ترکیب می شود تا یک کمپلکس پروتئینی را تشکیل دهد. از سوی دیگر، دامنه پروتئین ناحیه‌ای از زنجیره پلی پپتیدی پروتئین است که خود تثبیت می‌شود و مستقل از بقیه تا می‌شود.بنابراین، این خلاصه تفاوت بین زیر واحد پروتئین و دامنه است.
