تفاوت اصلی بین ITS1 و ITS2 این است که ITS1 یک دی‌ان‌ای فضایی است که بین ژنهای 18S و 5.8S rRNA در یوکاریوتها قرار دارد، در حالی که ITS2 یک DNA فضایی است که بین ژنهای 5.8S و 28S rRNA در یوکاریوتها قرار دارد..
فضای رونویسی داخلی (ITS) دی‌ان‌ای فضایی است که معمولاً بین RNA ریبوزومی زیر واحد کوچک و ژنهای RNA ریبوزومی زیرواحد بزرگ در کروموزوم یا در ناحیه رونویسی شده مربوطه در مولکول رونوشت پیش‌ساز rRNA پلی سیسترونیک قرار دارد. در باکتری ها و باستانی ها، تنها یک ITS بین ژن های rRNA 16S و 23S وجود دارد. اما در یوکاریوت ها، دو DNA فاصله دهنده ITS وجود دارد: ITS1 (بین 18S و 5.ژن های 8S rRNA) و ITS2 (بین 5.8S و 28S rRNA). بنابراین، ITS1 و ITS2 دو دی‌ان‌ای فضایی هستند که بین ژنهای rRNA در یوکاریوتها یافت می‌شوند.
ITS1 چیست؟
ITS1 یک DNA فضایی است که بین ژنهای rRNA 18S و 5.8S در یوکاریوتها قرار دارد. ITS به قطعه‌ای از دی‌ان‌ای فضایی غیرعملکردی اطلاق می‌شود که بین ژنهای rRNA قرار دارد. ITS1 دارای تنوع طول بیشتری نسبت به ITS2 است. تغییرات طول ITS1 تقریباً (200-300bp) است. نشانگرهای ITS مانند ITS1 کارایی خود را در روشن کردن روابط فیلوژنتیکی بین گونه‌های مختلف ثابت کرده‌اند. علاوه بر این، DNA اسپیسر ITS1 نسبت به دی‌ان‌ای اسپیسر ITS2 کمتر حفاظت شده است. ساختارهای ITS1 فقط در واحدهای طبقه بندی بسیار کوچکتر حفظ می شوند. هر خوشه ریبوزومی یوکاریوتی همچنین شامل مناطقی به نام فاصله‌گذار رونویسی خارجی (ETS 5 و 3) است.
شکل 01: منطقه ITS1
DNA فاصله دهنده ITS1 بسیار نزدیک به 5'Spacer رونویسی خارجی (5' ETS) است. علاوه بر این، اگر کسی بخواهد ناحیه ITS1 را برای مطالعات روابط فیلوژنتیکی تقویت کند، باید از یک جفت پرایمر خاص (پرایمرهای معکوس و رو به جلو) برای این منظور استفاده کند. برای تقویت ناحیه ITS1، معمولاً از دو مجموعه پرایمر در پروتکل‌های PCR آزمایشگاه‌ها استفاده می‌شود. آنها ITS1 رو به جلو و ITS2 معکوس یا ITS1 فوروارد و ITS4 معکوس هستند.
ITS2 چیست؟
ITS2 یک DNA فضایی است که بین ژنهای 5.8S و 28S rRNA در یوکاریوتها قرار دارد. منطقه ITS2 نسبت به منطقه ITS1 دارای تغییرات طول کوتاه تری است. تغییرات طول ITS2 تقریباً (180-240bp) است. با این حال، منطقه ITS2 در بسیاری از واحدهای طبقه بندی نسبت به منطقه ITS1 حفظ شده است. مشخص می کند که تمام دنباله های ITS2 یک هسته مشترک از ساختار ثانویه دارند. علاوه بر این، 40٪ منطقه ITS2 در بین همه آنژیوسپروم ها حفظ شده است، در حالی که می توان 50٪ از منطقه ITS2 را در سطح خانواده و سطح بالاتر تراز کرد.
شکل 02: منطقه ITS2
صرف نظر از دامنه حفاظت، استفاده از منطقه ITS2 نیز بسیار محبوب است مانند منطقه ITS1 در مطالعات روابط فیلوژنتیک، به ویژه در بارکد DNA قارچ. برای تقویت ناحیه ITS2، معمولاً از یک مجموعه پرایمر خاص در پروتکل‌های PCR آزمایشگاه‌ها استفاده می‌شود. یعنی ITS1 فوروارد و ITS4 معکوس. اما هنگامی که پروتکل PCR از این مجموعه پرایمر استفاده می کند، منطقه ITS1 را همراه با منطقه ITS2 نیز تقویت می کند. علاوه بر این، DNA فاصله‌گذار ITS2 بسیار نزدیک به فاصله‌گذار رونویسی شده خارجی 3 (ETS) است.
شباهت بین ITS1 و ITS2
- ITS1 و ITS2 دو DNA فاصله‌دهنده هستند که بین ژنهای rRNA قرار دارند.
- آنها فقط در یوکاریوت ها وجود دارند.
- هر دو را می توان با استفاده از جفت پرایمرهای خاص تقویت کرد.
- هر دو در بلوغ rRNA به عنوان محصولات جانبی غیرعملکردی جدا می شوند.
- هر دو برای مطالعات روابط فیلوژنتیکی، به ویژه در بارکدگذاری DNA قارچی بسیار مهم هستند.
تفاوت بین ITS1 و ITS2
ITS1 یک DNA جداکننده است که بین ژنهای rRNA 18S و 5.8S در یوکاریوتها وجود دارد، در حالی که ITS2 یک DNA فاصله‌دهنده است که بین ژنهای 5.8S و 28S rRNA در یوکاریوتها قرار دارد. بنابراین، این تفاوت اصلی بین ITS1 و ITS2 است. علاوه بر این، ITS1 دارای تنوع طول بیشتری در مقایسه با ITS2 است. از سوی دیگر، ITS2 در مقایسه با ITS1 دارای تنوع طول کوتاه تری است. این تفاوت دیگری بین ITS1 و ITS2 است.
اینفوگرافیک زیر تفاوت های بین ITS1 و ITS2 را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم فهرست می کند.
خلاصه - ITS1 در مقابل ITS2
ناحیه رونویسی داخلی (ITS) یک قطعه غیرعملکردی از دی‌ان‌ای فضایی است که بین ژنهای rRNA قرار دارد. در باکتری ها و باستانی ها، تنها یک ناحیه ITS وجود دارد.اما در یوکاریوت ها دو ناحیه ITS وجود دارد: ITS1 و ITS2. ITS1 یک DNA جداکننده است که بین ژن های 18S و 5.8S rRNA در یوکاریوت ها قرار دارد، در حالی که ITS2 یک DNA فاصله دهنده است که بین ژن های 5.8S و 28S rRNA در یوکاریوت ها قرار دارد. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین ITS1 و ITS2 است.
