تفاوت اصلی بین پایان وابسته به Rho و پایان مستقل Rho در این است که در خاتمه وابسته به Rho، فاکتور Rho با رونوشت متصل می شود و رونویسی را با شکستن پیوندهای هیدروژنی بین الگو و رونوشت خاتمه می دهد، در حالی که پایان مستقل Rho رونویسی را با پایان می دهد. تولید یک ساختار حلقه مو و سپس منطقه غنی از U در رونوشت.
رونویسی یکی از دو مرحله بیان ژن است. این فرآیندی است که یک توالی mRNA را از اطلاعات ژنتیکی پنهان در توالی DNA ژن تولید می کند. رونویسی از طریق سه مرحله انجام می شود: شروع، ازدیاد طول و خاتمه.آنزیم RNA پلیمراز به دنباله پروموتر ژن متصل می شود و شروع به کاتالیز کردن سنتز رشته RNA می کند. تا زمانی که توالی پایان دهنده پیدا شود، RNA پلیمراز نوکلئوتیدها را اضافه می کند و رشته RNA را می سازد. در پروکاریوتها، ختم از طریق دو استراتژی ختم اصلی اتفاق می‌افتد: ختم وابسته به Rho و ختم مستقل Rho. فاکتور رو پروتئینی است که دارای فعالیت هلیکاز است.
خاتمه وابسته به Rho چیست؟
خاتمه وابسته به Rho یکی از دو نوع استراتژی خاتمه رونویسی است که در پروکاریوت ها رخ می دهد. فاکتور رو پروتئینی است که دارای فعالیت هلیکاز است.
شکل 01: خاتمه وابسته به Rho
پروتئین Rhoبا رونوشت RNA متصل می شود و در امتداد RNA پلیمراز در جهت 5'-3' حرکت می کند و جدا شدن پیوندهای هیدروژنی بین الگوی DNA و رونوشت RNA را تشویق می کند.وقتی فاکتور Rho به حباب رونویسی می رسد، هیبرید DNA/RNA را جدا می کند و رونوشت را از حباب رونویسی آزاد می کند. وقتی این اتفاق می‌افتد، رونویسی را خاتمه می‌دهد.
خاتمه مستقل Rho چیست؟
خاتمه مستقل رو دومین راهبردی است که رونویسی پروکاریوتی را خاتمه می دهد. معمولاً یک ناحیه پایان دهنده دارای یک توالی تکرار معکوس است. بلافاصله پس از توالی تکرار معکوس، یک منطقه غنی از آدنین (AAAA) وجود دارد. هنگامی که RNA پلیمراز به جلو حرکت می کند، یک توالی mRNA تولید می کند. از آنجایی که این دو ناحیه در ناحیه توالی تکرار معکوس مکمل یکدیگر هستند، به دلیل پیوند هیدروژنی، ساختار حلقه مویی را تشکیل می‌دهد. منطقه بعدی منطقه غنی U خواهد بود. ساختار سنجاق سر فعالیت RNA پلیمراز را متوقف می کند.
شکل 02: فسخ مستقل Rho
علاوه بر این، در مناطق غنی U، برهمکنش ضعیفی بین پایه های U رونویسی و پایه های A الگو وجود دارد. این پیوندهای ضعیف آدنین-اوراسیل، الگوی DNA و رونوشت RNA را بی ثبات می کند و از یکدیگر جدا می شود. در پایان، رونوشت از سایت رونویسی آزاد می شود.
شباهت‌های بین Rho Dependent و Rho Independent Termination چیست؟
- خاتمه وابسته به Rho و خاتمه مستقل Rho دو استراتژی اصلی پایان یافتن در پروکاریوت ها هستند.
- هر دو فرم رونوشت را از الگوی DNA آزاد می کنند تا رونویسی خاتمه یابد.
تفاوت بین Rho Dependent و Rho Independent Termination چیست؟
خاتمه وابسته به Rho توسط یک پروتئین Rho واسطه می شود در حالی که خاتمه مستقل Rho از طریق تشکیل یک ساختار حلقه سنجاق سر رخ می دهد.بنابراین، این تفاوت اصلی بین خاتمه وابسته به Rho و پایان مستقل Rho است. علاوه بر این، پروتئین Rho از انرژی ATP استفاده می کند در حالی که پایان مستقل Rho شامل پروتئین Rho نمی شود و از انرژی ATP استفاده نمی کند. بنابراین، این نیز یک تفاوت معنادار بین خاتمه وابسته به Rho و پایان مستقل Rho است.
اینفوگرافیک زیر مقایسه های بیشتری را در رابطه با تفاوت بین خاتمه وابسته به Rho و پایان مستقل Rho نشان می دهد.
خلاصه - خاتمه Rho Dependent در مقابل Rho Independent
خاتمه وابسته به Rho و خاتمه مستقل Rho دو مکانیسم اصلی خاتمه رونویسی هستند که در پروکاریوتها رخ می دهند. پروتئین Rho مسئول خاتمه رونویسی در پایان وابسته به Rho است.در مقابل، خاتمه مستقل Rho از طریق تشکیل ساختار حلقه سنجاق سر رخ می دهد. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین پایان Rho وابسته و Rho مستقل است.
