تفاوت کلیدی بین فاکتور سیگما و فاکتور رو در این است که فاکتور سیگما پروتئینی است که برای شروع رونویسی در باکتری ها لازم است در حالی که فاکتور رو پروتئینی است که برای خاتمه رونویسی در باکتری ها لازم است.
فاکتور سیگما و فاکتور rho دو عامل مهم برای رونویسی باکتری هستند. رونویسی باکتریایی فرآیندی است که در آن قطعه ای از DNA باکتری در یک رشته جدید mRNA (RNA پیام رسان) کپی می شود. این فرآیند توسط آنزیمی به نام RNA پلیمراز کاتالیز می شود. باکتری ها به شدت به رونویسی و ترجمه متکی هستند تا به محیط خود به درستی پاسخ دهند. RNA پلیمراز باکتریایی از یک هسته و یک ساختار هولوآنزیمی تشکیل شده است. هسته شامل زیر واحدهای β، β'، α و 2ω است در حالی که هولوآنزیم حاوی فاکتور سیگما است. علاوه بر این، یک فاکتور کمکی برای RNA پلیمراز که به عنوان فاکتور rho شناخته می شود نیز برای رونویسی باکتری بسیار مهم است.
Sigma Factor چیست؟
فاکتور سیگما یا عامل اختصاصی پروتئینی است که برای شروع رونویسی در باکتری ها لازم است. این یک عامل شروع رونویسی باکتریایی است. این عامل اتصال آنزیم RNA پلیمراز را به ناحیه خاصی از DNA به نام ناحیه پروموتر در طول رونویسی امکان پذیر می کند. فاکتور سیگما به طور معمول با فاکتور رونویسی آرکی B و فاکتور رونویسی یوکاریوتی TF11B همولوگ است. علاوه بر این، فاکتور سیگما خاص یک ژن مشخص بسته به ژن و سیگنال های محیطی متفاوت است. پروموترها توسط RNA پلیمراز بسته به فاکتور سیگما مرتبط با آن انتخاب می شوند.
شکل 01: فاکتور سیگما
فاکتور سیگما را می توان در کلروپلاست گیاهان به عنوان بخشی از پلیمراز رمزگذاری شده با پلاست (PEP) نیز یافت. فاکتور سیگما و RNA پلیمراز در مجموع به عنوان هولوآنزیم RNA پلیمراز شناخته می شود. وزن مولکولی فاکتور سیگما حدود 70 کیلو دالتون است. پس از شروع رونویسی، فاکتور سیگما از مجموعه جدا می شود. سپس RNA پلیمراز تا پایان رونویسی به ازدیاد طول ادامه می‌دهد.
Rho Factor چیست؟
فاکتور Rho یک پروتئین پروکاریوتی است که در خاتمه رونویسی نقش دارد. فاکتور Rho معمولاً به محل توقف پایان دهنده رونویسی متصل می شود. این سایت یک ناحیه در معرض RNA تک رشته ای در نزدیکی چارچوب خواندن باز در توالی های ضعیف گوانین غنی از سیتوزین است.این یک پروتئین رونویسی ضروری در پروکاریوت ها است. در Escherichia coli، فاکتور rho تقریباً 274.6 کیلو دالتون هگزامر زیر واحدهای یکسان است. هر زیر واحد دارای یک دامنه اتصال RNA و حوزه هیدرولیز ATP است. علاوه بر این، عملکرد عامل rho فعالیت هلیکاز است.
شکل 02: Rho Factor
فاکتور Rho به مولکول RNA متصل می شود و سپس از فعالیت ATPase خود برای تامین انرژی برای انتقال مولکول های RNA استفاده می کند. فاکتور رو جابجایی را تا رسیدن به ناحیه مارپیچ RNA-DNA انجام می دهد، جایی که ساختار دوبلکس هیبریدی (RNA-DNA) را باز می کند. این فرآیند RNA پلیمراز را در محل پایان متوقف می کند و فرآیند رونویسی را خاتمه می دهد.
شباهت‌های بین Sigma Factor و Rho Factor چیست؟
- فاکتور سیگما و فاکتور rho دو عامل مهم برای رونویسی باکتری هستند.
- هر دو فقط در پروکاریوتها وجود دارند.
- آنها پروتئین هایی هستند که از اسیدهای آمینه تشکیل شده اند.
- هر دو پروتئین های اتصال دهنده به اسیدهای نوکلئیک هستند.
- پروکاریوت ها برای تولید mRNA که می تواند پروتئین های عجیب و غریب بسازد و به آنها کمک کند به طور خاص به محیط خود پاسخ دهند، به شدت به این عوامل متکی هستند.
تفاوت بین Sigma Factor و Rho Factor چیست؟
فاکتور سیگما پروتئینی است که برای شروع رونویسی در باکتری ها لازم است، در حالی که فاکتور rho پروتئینی است که برای پایان دادن به رونویسی در باکتری ها لازم است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین فاکتور سیگما و فاکتور rho است. علاوه بر این، فاکتور سیگما یک پروتئین اتصال به DNA است، در حالی که فاکتور rho یک پروتئین اتصال دهنده RNA است.
اینفوگرافیک زیر تفاوت‌های بین فاکتور سیگما و فاکتور rho را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می‌دهد.
خلاصه - Sigma Factor در مقابل Rho Factor
رونویسی فرآیندی است که در آن اطلاعات موجود در DNA در یک مولکول جدید به نام mRNA (RNA پیام رسان) کپی می شود. این m-RNA در نهایت در تولید یک پروتئین خاص نقش دارد. فاکتور سیگما و فاکتور rho دو عامل مهم برای رونویسی باکتری هستند. آنها پروتئین هستند. فاکتور سیگما در شروع رونویسی در باکتری ها شرکت می کند. عامل Rho مسئول خاتمه رونویسی در باکتری ها است. بنابراین، این خلاصه ای از تفاوت بین فاکتور سیگما و عامل rho است.
