پلی پپتید در مقابل پروتئین
اسید آمینه یک مولکول ساده است که با C، H، O، N تشکیل شده و ممکن است S باشد. ساختار کلی زیر را دارد.
حدود 20 اسید آمینه رایج وجود دارد. همه آمینو اسیدها دارای یک گروه -COOH، -NH2 و a -H هستند که به کربن پیوند دارند. کربن یک کربن کایرال است و اسیدهای آمینه آلفا مهمترین آنها در دنیای بیولوژیکی هستند. گروه R از یک اسید آمینه به اسید آمینه دیگر متفاوت است. ساده ترین اسید آمینه با گروه R که H است گلیسین است. با توجه به گروه R، اسیدهای آمینه را می توان به آلیفاتیک، معطر، غیر قطبی، قطبی، دارای بار مثبت، بار منفی یا بدون بار قطبی و غیره طبقه بندی کرد.اسیدهای آمینه به صورت یون های زویتر در pH فیزیولوژیکی 7.4 وجود دارند. آمینو اسیدها بلوک های سازنده پروتئین ها هستند. هنگامی که دو اسید آمینه به یکدیگر می پیوندند و یک دی پپتید تشکیل می دهند، ترکیب در یک گروه -NH2 از یک اسید آمینه با گروه -COOH یک اسید آمینه دیگر انجام می شود. یک مولکول آب حذف می شود و پیوند تشکیل شده به عنوان پیوند پپتیدی شناخته می شود.
پلی پپتید
زنجیره ای که زمانی تشکیل می شود که تعداد زیادی اسید آمینه به یکدیگر متصل شوند به عنوان پلی پپتید شناخته می شوند. پروتئین ها از یک یا چند مورد از این زنجیره های پلی پپتیدی تشکیل شده اند. ساختار اولیه پروتئین به عنوان پلی پپتید شناخته می شود. از دو پایانه زنجیره پلی پپتیدی، انتهای N جایی است که گروه آمینه آزاد است، و پایانه c جایی است که گروه کربوکسیل آزاد است. پلی پپتیدها در ریبوزوم ها سنتز می شوند. توالی اسید آمینه در زنجیره پلی پپتیدی توسط کدون های mRNA تعیین می شود.
پروتئین
پروتئین ها یکی از مهم ترین انواع ماکرومولکول ها در موجودات زنده هستند.پروتئین ها را می توان با توجه به ساختارشان به پروتئین های اولیه، ثانویه، سوم و چهارم تقسیم کرد. توالی اسیدهای آمینه (پلی پپتید) در یک پروتئین ساختار اولیه نامیده می شود. هنگامی که ساختارهای پلی پپتیدی به ترتیبات تصادفی جمع می شوند، به عنوان پروتئین های ثانویه شناخته می شوند. در ساختارهای سوم، پروتئین ها ساختار سه بعدی دارند. هنگامی که چند نیمه پروتئین سه بعدی به یکدیگر متصل می شوند، پروتئین های چهارتایی را تشکیل می دهند. ساختار سه بعدی پروتئین ها به پیوندهای هیدروژنی، پیوندهای دی سولفیدی، پیوندهای یونی، برهمکنش های آبگریز و سایر برهمکنش های بین مولکولی درون اسیدهای آمینه بستگی دارد. پروتئین ها نقش های مختلفی را در سیستم های زنده ایفا می کنند. آنها در تشکیل ساختارها شرکت می کنند. به عنوان مثال، ماهیچه ها دارای فیبرهای پروتئینی مانند کلاژن و الاستین هستند. آنها همچنین در بخش‌های ساختاری سخت و سفت مانند ناخن، مو، سم، پر و غیره یافت می‌شوند. پروتئین‌های بیشتری در بافت‌های همبند مانند غضروف‌ها یافت می‌شوند. به غیر از عملکرد ساختاری، پروتئین ها یک عملکرد محافظتی نیز دارند.آنتی بادی ها پروتئین هستند و از بدن ما در برابر عفونت های خارجی محافظت می کنند. تمام آنزیم ها پروتئین هستند. آنزیم ها مولکول های اصلی هستند که تمام فعالیت های متابولیک را کنترل می کنند. علاوه بر این، پروتئین ها در سیگنال دهی سلولی شرکت می کنند. پروتئین ها بر روی ریبوزوم ها تولید می شوند. سیگنال تولید پروتئین از ژن های موجود در DNA به ریبوزوم منتقل می شود. آمینو اسیدهای مورد نیاز می تواند از رژیم غذایی باشد یا در داخل سلول سنتز شود. دناتوره شدن پروتئین منجر به باز شدن و از هم گسیختگی ساختارهای ثانویه و سوم پروتئین ها می شود. این می تواند به دلیل گرما، حلال های آلی، اسیدها و بازهای قوی، مواد شوینده، نیروهای مکانیکی و غیره باشد.
تفاوت بین پلی پپتید و پروتئین چیست؟
• پلی پپتیدها توالی اسید آمینه هستند، در حالی که پروتئین ها توسط یک یا چند زنجیره پلی پپتیدی ساخته می شوند.
• پروتئین ها وزن مولکولی بالاتری نسبت به پلی پپتیدها دارند.
• پروتئین ها دارای پیوندهای هیدروژنی، پیوندهای دی سولفیدی و سایر برهمکنش های الکترواستاتیکی هستند که بر ساختار سه بعدی آن بر خلاف پلی پپتیدها حاکم است.
