تفاوت اصلی بین الیگوپپتید و پلی پپتید این است که الیگوپپتیدها حاوی مقدار کمی باقیمانده اسید آمینه هستند، در حالی که پلی پپتیدها حاوی تعداد زیادی باقیمانده اسید آمینه هستند.
اصطلاح الیگوپپتیدها و پلی پپتیدها در دسته پروتئین ها قرار می گیرند. پپتیدها زنجیره کوتاهی از اسیدهای آمینه هستند. اسیدهای آمینه از طریق پیوندهای پپتیدی به یکدیگر متصل می شوند. بنابراین می توان این پپتیدها را بر اساس تعداد اسیدهای آمینه موجود در این پپتیدها دسته بندی کرد. به عنوان مثال، دی پپتیدها، تری پپتیدها، تتراپپتیدها، الیگوپپتیدها و پلی پپتیدها.
Oligopeptide چیست؟
یک الیگوپپتید زنجیره ای از اسیدهای آمینه است که حاوی تعداد کمی اسید آمینه در هر مولکول است.ما اغلب این مولکول ها را «پپتیدها» به عنوان یک اصطلاح کلی می نامیم. تعداد باقی مانده های اسید آمینه موجود در این مولکول های پپتیدی می تواند بین دو تا بیست اسید آمینه باشد. الیگوپپتیدها همچنین می توانند شامل برخی از اشکال پپتید کوچک مانند دی پپتیدها، تری پپتیدها و غیره باشند. برخی از نمونه های رایج الیگوپپتیدهای طبیعی عبارتند از میکروویریدین، سیانوپپتولین ها، میکروسیستین ها و غیره.
شکل 01: ساختار یک تری پپتید
این الیگوپپتیدها توسط پپتیدهای غیر ریبوزومی سنتازها یا NRPS تولید می شوند. اما چند استثنا وجود دارد. به عنوان مثال، سیکلامیدها و میکروویریدین از طریق مسیرهای ریبوزومی سنتز می شوند. فرآیند جداسازی الیگوپپتیدها شامل غنی‌سازی، خالص‌سازی و شناسایی اولیگوپپتید است. برای فرآیند شناسایی، می‌توانیم از کروماتوگرافی ژل، HPLC، طیف‌سنجی جرمی HPLC، کروماتوگرافی تبادل یونی و غیره استفاده کنیم.
پلی پپتید چیست
پلی پپتید زنجیره ای از باقی مانده های اسید آمینه است که حاوی تعداد زیادی اسید آمینه است. یک پروتئین حاوی یک یا چند زنجیره پلی پپتیدی است. در این زنجیره های پلی پپتیدی، اسیدهای آمینه از طریق پیوندهای پپتیدی که نوعی پیوند شیمیایی کووالانسی هستند، به یکدیگر متصل می شوند. هر زنجیره پلی پپتیدی شامل دو پایانه N ترمینال و C ترمینال است. ترمینال N آمینو ترمینال است که به یک گروه آمینه آزاد ختم می شود، در حالی که ترمینال C ترمینال کربوکسیل است که به یک گروه کربوکسیل آزاد ختم می شود. توالی اسیدهای آمینه موجود در یک پپتید توسط کدون های موجود در mRNA تعیین می شود که در تولید پلی پپتید یا پروتئین از طریق ترجمه رشته الگو نقش دارند.
با توجه به تعداد و آرایش پلی پپتیدها در یک پروتئین، چهار نوع ساختار اصلی پروتئین به شرح زیر وجود دارد:
- ساختار اولیه - ساختار اولیه یک پروتئین شامل یک زنجیره پلی پپتیدی منفرد است که دارای پل های دی سولفیدی بین برخی از اسیدهای آمینه در همان زنجیره است که یک ساختار چین خورده ایجاد می کند.
- ساختار ثانویه - ساختار ثانویه یک پروتئین دارای دو شکل اصلی است: ساختار آلفا-مارپیچ و ساختار صفحه بتا.
شکل 02: ساختار مارپیچ آلفا
- ساختار سوم - این یک ساختار شبکه بسیار تا شده است. این ساختار بسیار مهم است زیرا عملکرد یک پروتئین را تعیین می کند.
- ساختار کواترنر - این یک ساختار بسیار پیچیده از دو یا سه زنجیره پلی پپتیدی است که به یکدیگر مرتبط هستند.
تفاوت بین الیگوپپتید و پلی پپتید چیست؟
الیگوپپتیدها و پلی پپتیدها دو دسته متفاوت از پروتئین ها هستند. آنها بسته به تعداد باقی مانده های اسید آمینه موجود در مولکول های پروتئین با یکدیگر متفاوت هستند.بنابراین، تفاوت اصلی بین اولیگوپپتید و پلی پپتید این است که الیگوپپتیدها حاوی مقدار کمی باقیمانده اسید آمینه هستند، در حالی که پلی پپتیدها حاوی تعداد زیادی باقیمانده اسید آمینه هستند.
اینفوگرافیک زیر تفاوت بین الیگوپپتید و پلی پپتید را خلاصه می کند.
خلاصه - الیگوپپتید در مقابل پلی پپتید
الیگوپپتیدها و پلی پپتیدها دو دسته متفاوت از پروتئین ها هستند. آنها بسته به تعداد باقی مانده اسیدهای آمینه موجود در این مولکول های پروتئینی با یکدیگر متفاوت هستند. یعنی تفاوت اصلی بین اولیگوپپتید و پلی پپتید در این است که الیگوپپتیدها حاوی مقدار کمی باقیمانده اسید آمینه هستند، در حالی که پلی پپتیدها حاوی تعداد زیادی باقیمانده اسید آمینه هستند.
