تفاوت کلیدی بین وکتورهای درج و جایگزینی در این است که وکتور درج توانایی وارد کردن طول متوسط DNA خارجی را دارد در حالی که وکتور جایگزین این توانایی را دارد که طول های بیشتری از DNA خارجی را در خود جای دهد.
ناقل های فاژ باکتریوفاژهایی هستند که برای شبیه سازی استفاده می شوند. دو نوع ناقل فاژ وجود دارد. آنها بردار درج و بردار جایگزین هستند. همچنین تمام ناقل های فاژ از ژن های غیر ضروری تشکیل شده اند. با این حال، برای تسهیل درج DNA خارجی جدید، این ژن ها باید از فاژها حذف شوند.
بردار درج چیست؟
اول از همه، بردار درج ساده ترین شکل بردارهای شبیه سازی لامبدا است. در واقع، این نوعی ناقل فاژ است که دارای یک مکان محدود منحصر به فرد است که در ژنوم ناقل در موقعیت DNA اختیاری معرفی شده است. علاوه بر این، DNA فاژ بدون حذف باقی می ماند. این عدم حذف DNA فاژ، اندازه درج‌ها (DNA خارجی) را که قرار است در داخل ناقل کلون شوند، کاهش می‌دهد. علاوه بر این، این وکتورها در شبیه سازی و بیان cDNA مفید هستند. GT10، GT11 و Zap نمونه هایی از این بردار هستند.
شکل 01: فاژ لامبدا
بردار درج از یک سایت شناسایی واحد تشکیل شده است.عملکرد اصلی این وکتور ایجاد کتابخانه های cDNA مشتق شده از توالی های mRNA یوکاریوتی است. علاوه بر این، تنها می‌تواند طول‌های DNA خارجی بین 05-11 کیلوبایت را در خود جای دهد. همچنین، دارای یک محل برش منحصر به فرد برای درج DNA خارجی است.
بردارهای جایگزین چیست؟
بردار جایگزین یا ناقل جانشین نوعی از وکتور فاژ است که از حذف ناحیه میانی "قطعه پرکننده" DNA فاژ ایجاد می شود. درج DNA خارجی مورد نظر جایگزین DNA فاژ می شود.
شکل 02: بردار جایگزینی
بردارهای جایگزین در ایجاد کتابخانه های ژنومی مانند EMBL4 و Charon40 مهم هستند. این ناقل ها می توانند طول بیشتری از DNA خارجی را در محدوده طولی بین 08 تا 24 کیلوبایت در خود جای دهند.ناحیه پرکننده همچنین از ژنی تشکیل شده است که ناقل فاژ را در داخل میزبان باکتری غیرقابل دوام می کند.
شباهت‌های بین بردارهای درج و جایگزینی چیست؟
- بردارهای درج و جایگزینی ناقل فاژ هستند.
- هر دو ناقل درج های DNA خارجی را در خود جای می دهند.
- هر دو در ایجاد کتابخانه های DNA مفید هستند.
تفاوت بین بردارهای درج و جایگزینی چیست؟
درج در مقابل بردارهای جایگزین |
|
| ناقل درج نوعی از ناقل فاژ است که دارای یک مکان محدود در ژنوم فاژ در محل DNA اختیاری است. | وکتور جایگزین نوعی ناقل فاژی است که از حذف ناحیه میانی "قطعه پرکننده" DNA فاژ ایجاد شده است |
| اندازه درج قطعات | |
| 05-11 kb طول | 08-24 kb طول |
| Filler Fragment | |
| بدون قطعه پرکننده | قطعه پرکننده با یک درج خارجی جایگزین می شود |
| عملکرد | |
| مهم برای ایجاد کتابخانه های cDNA | مهم در ایجاد کتابخانه های ژنوم |
| نمونه‌ها | |
| GT10، GT11، و Zap نمونه هایی هستند | EMBL4 و Charon40 نمونه هایی هستند |
| سایت Cleavage | |
| یک سایت برش منحصر به فرد وجود دارد | محل برش حاوی ژن هایی است که برای چرخه لیتیک ضروری نیستند |
خلاصه - درج در مقابل بردارهای جایگزین
هر دو ناقل درج و جایگزینی دو نوع ناقل فاژ هستند. هر دو وکتور دارای مکان‌های محدودکننده هستند که تطبیق درج‌های DNA خارجی جدید را تسهیل می‌کنند. وکتورهای درج در ایجاد کتابخانه های cDNA مهم هستند در حالی که وکتورهای جایگزین در ایجاد کتابخانه های ژنومی مهم هستند. علاوه بر این، وکتورهای درج، درج های DNA با طول متوسط را در خود جای می دهند. اما وکتورهای جایگزین می توانند طول بیشتری از درج های DNA خارجی را در خود جای دهند. به طور کلی، این تفاوت کلیدی بین بردارهای درج و جایگزینی است.
