تفاوت کلیدی - Phusion در مقابل Taq Polymerase
DNA پلیمرازها آنزیم هایی هستند که به طور گسترده در تکنیک های زیست شناسی مولکولی مورد استفاده قرار می گیرند و همچنین به طور طبیعی در همه موجوداتی که تحت تکثیر DNA هستند وجود دارند. آنها آنزیم های کلیدی پلیمریزاسیونی هستند که در طول همانندسازی دخالت دارند. DNA پلیمراز قادر است نوکلئوتیدها را به انتهای آزاد 3 رشته DNA اضافه کند و در نتیجه باعث گسترش یک رشته جدید شود. در حال حاضر، با توجه به پیشرفتهای زیستشناسی مولکولی در تشخیص بیماریها و کاربردهای صنعتی، ساخت پلیمرازهایی با خواص مفید مختلف اهمیت دارد. این باعث افزایش دقت روش می شود و آن را به یک تکنیک سریع تر تبدیل می کند. Phusion و Taq polymerase دو آنزیم پلیمراز پایدار حرارتی تولید شده تجاری هستند که در کاربردهای مولکولی خاص مورد استفاده قرار می گیرند. Phusion یک DNA پلیمراز جدا شده از Pyrococcus furiosus است و عمدتاً در آزمایشهای شبیهسازی برای افزایش وفاداری استفاده میشود. Taq DNA Polymerase یک DNA پلیمراز استاندارد است که در واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) استفاده می شود و از باکتری مقاوم در برابر حرارت جدا می شود. ترموس آبی. تفاوت اصلی بین این دو آنزیم در منبع میکروارگانیسم است. Phusion از اکسترموفیل Pyrococcus furiosus جدا می شود در حالی که Taq polymerase از ترموفیل Thermus aquaticus جدا می شود.
Phusion چیست؟
Phusion DNA polymerase یک پلیمراز جدید است که با جداسازی آنزیم از Pyrococcus furiosus، که یک آرکی اکسترموفیل است، تولید میشود. این میکروب ها در شرایط دمای بسیار بالا زندگی می کنند و در نتیجه پلیمراز را به پلیمراز بسیار پایدار در برابر حرارت تبدیل می کنند. Phusion polymerase برای به دست آوردن وفاداری فوق العاده نسبت به پلیمرازهای متداول مقاوم در برابر حرارت استفاده می شود. تاق پلیمراز.فوژن پلیمراز قادر به تقویت الگوهای بلند تا 7.5 کیلوبایت DNA ژنومی است. ظرفیت بهینه پلیمریزاسیون Phusion polymerase در 720 C است. Phusion همچنین در شبیه سازی محصولات برای توالی یابی، تجزیه و تحلیل بیان و تجزیه و تحلیل جهش استفاده می شود.
Phusion DNA پلیمراز دارای فعالیت اگزونوکلئاز 3 - 5 است. این امکان تصحیح رشته جدید سنتز شده را پس از سنتز فراهم می کند. از این رو، عدم تطابق نوکلئوتیدی به راحتی قابل ترمیم است. بنابراین میزان خطای کمتری دارد. مزایای کلی فوژن پلیمراز عبارتند از:
- وفاداری فوق العاده
- سرعت بالا و کاهش زمان تمدید
- واکنش های قوی و به حداقل بهینه سازی نیاز دارد
- بازدهی بالا
شکل 01: Phusion
عیب اصلی فوژن پلیمراز این است که در حضور دئوکسی یوریدین تری فسفات (dUTP) مهار می شود. هنگامی که dUTP ها در مخلوط واکنش انباشته می شوند، ممکن است فعالیت های فوژن پلیمراز را مهار کنند. با درمان مخلوط واکنش با dUTPase قبل از افزودن آنزیم از این امر جلوگیری می شود. در حال حاضر، یک نوع مقاوم در برابر dUTP از Phusion polymerase معروف به Pfu Turbo به جای Phusion polymerase به عنوان یک درمان برای این مشکل استفاده می شود.
Taq Polymerase چیست؟
اختراع Taq DNA polymerase انقلابی در زمینه زیست شناسی مولکولی ایجاد کرده است. این یک مشکل عمده در تقویت DNA را حل کرد. Taq DNA polymerase یک آنزیم پلیمراز پایدار در برابر حرارت است که از باکتری ترموفیل Thermus aquaticus استخراج و جدا شده است. کشف این آنزیم منجر به ایجاد PCR می شود. این آنزیم امکان استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز را در تکثیر DNA به جای تکنیک های شبیه سازی پر زحمت معمولی فراهم کرده است. PCR در حال حاضر در تشخیص مولکولی، زمینه های کشاورزی و صنعتی با بسیاری از تغییرات جدید اضافه شده به تکنیک استفاده می شود.
شکل 02: Taq Polymerase
Taq DNA پلیمراز در محدوده دمایی بهینه بین 720C تا 800C عمل می کند. Taq DNA پلیمراز به یک فاکتور کمکی نیاز دارد. منیزیم برای عملکرد آن Taq پلیمراز توانایی تصحیح 3'-5' را ندارد، بنابراین، میزان خطای Taq DNA پلیمراز در مقایسه با انواع جدیدتر DNA پلیمرازها مانند Phusion polymerase و غیره بالا است. اما محبوبیت Taq DNA پلیمراز همچنان باقی است. در سراسر جهان علم به دلیل راحتی و انعطاف پذیری آنزیم یکسان است.
شباهت های بین Phusion و Taq polymerase چیست؟
- هر دو آنزیم Phusion و Taq polymerase آنزیم های پلیمریزاسیونی هستند که قادر به افزودن نوکلئوتیدها به انتهای آزاد 3 این رشته DNA هستند.
- هر دو پلیمراز Phusion و Taq برای شروع پلیمریزاسیون به دنباله آغازگر نیاز دارند.
- هر دو پلیمراز Phusion و Taq در حرارت پایدار هستند.
- هر دو پلیمراز Phusion و Taq در مکانیسم های PCR برای تقویت DNA استفاده می شوند.
- هنگام افزودن پلیمراز به مخلوط واکنش، هر دو پلیمراز Phusion و Taq در آخر اضافه می شوند تا از کارایی آنزیم اطمینان حاصل شود.
- هر دو پلیمراز Phusion و Taq به صورت تجاری برای اهداف آزمایشی زیست شناسی مولکولی سنتز می شوند.
- هر دو پلیمراز Phusion و Taq برای تکمیل عملکرد خود به کوفاکتور نیاز دارند.
تفاوت بین Phusion و Taq Polymerase چیست؟
Phusion در مقابل Taq Polymerase |
|
Phusion یک DNA پلیمراز جدا شده از Pyrococcus furiosus است و عمدتاً در آزمایشهای شبیهسازی برای افزایش وفاداری استفاده میشود. | Taq DNA Polymerase یک DNA پلیمراز استاندارد است که در واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) استفاده می شود و از باکتری مقاوم در برابر حرارت، Thermus aquaticus، جدا شده است. |
منبع ارگانیسم | |
Phusion از باستانی اکستروموفیل - Pyrococcus furiosus استخراج شده است. | این آثار ادبی از دوره استعمار تا دوره استعمار زدایی را در بر می گیرند. |
قابلیت اثبات خواندن | |
3' – 5' توانایی خواندن اثباتی در Phusion وجود دارد. | 3' - 5' توانایی خواندن اثبات در Taq polymerase وجود ندارد. |
وفاداری | |
وفاداری بالا با Phusion وجود دارد. | Taq پلیمراز وفاداری کم را نشان می دهد. |
تقویت | |
Phusion قادر است قطعات طولانی DNA را تقویت کند. | Taq پلیمراز قادر است قطعات DNA بسیار کوتاه تری را تقویت کند. |
dUTP مسمومیت | |
عمل Phusion توسط انباشت عجیب مهار می شود. | Taq پلیمراز توسط dUPT مهار نمی شود. |
خلاصه - Phusion در مقابل Taq polymerase
Phusion و Taq DNA پلیمراز دو پلیمراز پایدار حرارتی هستند که در تکنیک های PCR استفاده می شوند. Phusion یک پلیمراز جدا شده از extremophile، Pyrococcus furiosus است، در حالی که، Taq از باکتری مقاوم در برابر حرارت Thermus aquaticus جدا شده است.کشف Taq DNA پلیمراز منجر به اختراع PCR شد. Phusion مزایای زیادی نسبت به Taq دارد که باعث شده است Phusion گزینه بهتری در تولید DNA با وفاداری بالا باشد. با این حال، Taq polymerase هنوز به عنوان آنزیم استاندارد پلیمراز در PCR استفاده می شود. این تفاوت بین فوژن و تاک پلیمراز است.