تفاوت اصلی بین پروتئومیکس هدفمند و غیرهدفمند این است که هدف پروتئومیکس هدف اندازه گیری فراوانی یک پروتئین خاص است در حالی که پروتئومیکس هدفمند پروتئین خاصی را هدف قرار نمی دهد.
پروتئومیکس یک مطالعه در مقیاس بزرگ پروتئین ها، ساختارها و عملکرد آنها است. کل مکمل پروتئین را در یک سلول، بافت یا یک ارگانیسم تحت شرایط خاص مطالعه می کند. دو نوع پروتئومیکس به عنوان پروتئومیکس هدفمند و پروتئومیکس غیرهدف وجود دارد.
پروتئومیکس هدفمند چیست؟
همانطور که از نامش مشخص است، پروتئومیکس هدفمند یک پروتئین خاص یا یک پپتید را در مخلوط پیچیده ای از پروتئین ها برای تجزیه و تحلیل هدف قرار می دهد.سپس حضور و کمیت آن پروتئین خاص از پیش انتخاب شده را تجزیه و تحلیل می کند. این روش فقط برای یک نمونه یا در چند نمونه امکان پذیر است. این روش حتی برای گروه خاصی از پروتئین ها مناسب است. این منجر به داده های دقیق تر، کمی و حساس تر می شود. علاوه بر این، طیف‌سنجی جرمی همراه با پروتئومیک‌های هدفمند اندازه‌گیری‌های قابل اعتمادتری را تولید می‌کند. این روش از طیف‌سنج جرمی چهار قطبی سه‌گانه (QQQ) برای آنالیز خود استفاده می‌کند.
شکل 01: Proteomics
پروتئومیکس هدفمند روش مناسبی است اگر می خواهید بررسی کنید که آیا هدف ناک داون واقعاً نابود شده است یا زمانی که می خواهید یک پروتئین/پپتید خاص را در سرم خون، مایع مغزی یا لیزات سلولی و غیره تعیین کنید. اگر می‌خواهید بررسی کنید که آیا پروتئین خاصی در بین نمونه‌ها یا در طول آزمایش زمانی متفاوت بیان می‌شود، از آن استفاده کنید.
پروتئومیکس بدون هدف چیست؟
پروتئومیکس بدون هدف، همانطور که از نام آن ذکر شده است، پروتئین یا پپتید خاصی را برای تجزیه و تحلیل آن هدف قرار نمی دهد. پروتئومیکس کشف نام دیگر پروتئومیکس بدون هدف است. در واقع، این یک تحلیل «جهانی» تر است. به طور کلی، انجام پروتئومیکس غیر هدفمند برای پاسخ به این سوال است که "در این نمونه یا چند نمونه چه پروتئین یا پروتئین وجود دارد؟". این روش به عنوان پروتئومیک های هدفمند حساس نیست. اما می تواند بسیاری از پروتئین ها از جمله پروتئین های جدید را شناسایی و اندازه گیری کند. پروتئومیکس بدون هدف می تواند اندازه گیری های کمی و کیفی ایجاد کند.
شباهت‌های بین پروتئومیکس هدفمند و غیرهدف چیست؟
- هر دو پروتئومیک هدفمند و غیرهدف پروتئین ها را در نمونه ها اندازه گیری می کنند.
- آنها در آنالیز پروتئوم مهم هستند.
- این روش ها از طیف سنجی جرمی استفاده می کنند.
تفاوت بین پروتئومیکس هدفمند و غیرهدف چیست؟
اولاً، پروتئومیکس هدفمند، تعیین حضور و کمیت یک پروتئین یا پپتید خاص در مخلوط پیچیده پروتئین ها است. در مقابل، پروتئومیکس بدون هدف، مطالعه کمی و کیفی پروتئین های موجود در نمونه یا نمونه ها بدون هدف قرار دادن پروتئین خاصی است. پروتئومیکس هدفمند با پروتئین های از پیش انتخاب شده یا هدفمند انجام می شود در حالی که پروتئومیکس هدفمند برای کشف انواع پروتئین ها در این نمونه انجام می شود. علاوه بر این، پروتئومیکس هدفمند نسبت به پروتئومیکس هدفمند حساس تر است.
خلاصه – هدفمند در مقابل پروتئومیکس بدون هدف
به طور خلاصه، پروتئومیکس هدفمند و غیر هدفمند دو نوع مطالعه پروتئینی هستند. همانطور که از نام آنها پیداست، پروتئومیکس هدفمند پروتئین خاصی را هدف قرار می دهد در حالی که پروتئومیکس هدفمند پروتئین خاصی را هدف قرار نمی دهد.این تفاوت بین پروتئومیک های هدفمند و غیر هدفمند است.
