تفاوت اصلی بین FISH و CGH در این است که FISH یک تکنیک مولکولی است که توالی DNA خاصی را روی کروموزوم با استفاده از پروب های نشاندار شده با فلورسنت تشخیص می دهد، در حالی که CGH یکی دیگر از روش های سیتوژنتیک مولکولی است که تغییرات در DNA ژنومی را تشخیص می دهد..
تجزیه و تحلیل سیتوژنتیک نقش مهمی در پزشکی در تشخیص ناهنجاری های کروموزومی مانند آنیوپلوئیدی ها، حذف ها، تکرارها و بازآرایی ها و غیره ایفا می کند. ناهنجاری های کروموزومی در نهایت منجر به بیماری های ژنتیکی مانند سرطان، ناباروری، سندرم داون، سندرم کلاین فلتر، سندرم، لوسمی و غیره. روش های سیتوژنتیک مولکولی مختلفی برای تشخیص نقایص و بیماری های ذکر شده در بالا وجود دارد.در میان آنها، FISH (هیبریداسیون فلورسنت در محل) و CGH (هیبریداسیون ژنومی مقایسه ای) دو تکنیک هیبریداسیون قدرتمند هستند. با این حال، هر دو روش جوانب مثبت و منفی دارند.
ماهی چیست؟
FISH یک تکنیک هیبریداسیون اسید نوکلئیک است که بر روی بخشی یا بخشی از بافت، در کل بافت یا سلول ها انجام می شود. این یک روش مبتنی بر پروب است. این تکنیک به تئوری جفت شدن بازهای مکمل واتسون کریک بستگی دارد که منجر به هیبریدهای DNA - DNA یا هیبریدهای DNA - RNA می شود که بنابراین می توانند ژن های جهش یافته را شناسایی کنند یا می توانند ژن مورد نظر را شناسایی کنند. علاوه بر این، این تکنیک از توالی‌های DNA تک‌رشته‌ای، توالی‌های DNA دو رشته‌ای، توالی‌های RNA تک‌رشته‌ای یا الیگونوکلئوتید مصنوعی تهیه‌شده با استفاده از ترجمه نیک به‌عنوان پروب‌هایی استفاده می‌کند که مکمل توالی‌های ژن مورد نظر هستند. همچنین مهم ترین ویژگی این تکنیک، برچسب زدن پروب ها با رنگ های فلورسانس است. بنابراین، پروب ها با قسمت های مکمل کروموزوم متصل می شوند و تشخیص آن را آسان می کنند.
علاوه بر این، FISH یک روش بسیار حساس و خاص است. از این رو، این یک تکنیک رایج در تحقیقات و تشخیص بدخیمی های خونی و تومورهای جامد است. اما، FISH وضوح پایینی را نشان می دهد. همچنین برای طراحی توالی های کاوشگر به دانش قبلی در مورد ناهنجاری هدف نیاز است.
شکل 01: FISH
کاربردهای زیادی از FISH، عمدتاً در تشخیص مولکولی بیماری های عفونی برای شناسایی حضور پاتوژن ها و تأیید پاتوژن از طریق تشخیص مولکولی وجود دارد. علاوه بر این، FISH یک تکنیک متداول در زمینه‌های زیست‌شناسی رشد، کاریوتایپ و آنالیز فیلوژنتیکی و نقشه‌برداری فیزیکی کروموزوم‌ها است.
CGH چیست؟
هیبریداسیون مقایسه ای ژنومی (CGH) یکی دیگر از روش های سیتوژنتیک مولکولی مبتنی بر DNA است که می تواند تغییرات توالی های DNA ژنومی را تشخیص دهد.این روش یک روش پیشرفته است که می تواند تغییرات کروموزوم و ژن را برای تشخیص تغییرات یا تغییرات در توالی های DNA ژنومی تجزیه و تحلیل کند. علاوه بر این، CGH نیاز به جداسازی و تکه تکه شدن DNA از نمونه تجربی و نمونه مرجع دارد. سپس نمونه ها باید با استفاده از دو رنگ فلورسنت مختلف (معمولاً قرمز و سبز) برچسب گذاری شوند. بعداً، هر دو نمونه مخلوط شده و برای هیبریداسیون رقابتی مجاز می‌شوند. مرحله نهایی تجزیه و تحلیل نمونه ها برای تغییرات در DNA مانند تکرار ژن، از دست دادن ژن و غیره است. به ویژه، تفاوت تعداد کپی DNA بین نمونه آزمایش و نمونه کنترل را اندازه گیری می کند.
شکل 02: CGH
نسخه دیگری از CGH اکنون در دسترس است. این یک روش پیشرفته تر از CGH معمولی است. این تکنیکی به نام CGH مبتنی بر آرایه یا aCGH است. aCGH امکان شناسایی دقیق حذف‌های ژن یا توالی را در هزاران توالی در یک آزمایش واحد فراهم می‌کند.
شباهت های بین FISH و CGH چیست؟
- FISH و CGH دو تکنیک مولکولی هستند.
- FISH و CGH هر دو به هیبریداسیون اسید نوکلئیک متکی هستند.
- همچنین، هر دو تکنیک به کاوشگرهای طراحی شده برای شناسایی اهداف DNA خاص نیاز دارند.
- ما از آنها برای تشخیص قبل و بعد از زایمان بیماری های ژنتیکی استفاده می کنیم.
- علاوه بر این، هم FISH و هم CGH ابزار بسیار قدرتمندی برای مطالعه تغییرات ژنومی هستند.
- آنها از رنگ های فلورسنت برای برچسب زدن پروب ها استفاده می کنند.
تفاوت بین FISH و CGH چیست؟
FISH یک روش هیبریداسیون درجا است که از پروب های فلورسنت برای شناسایی توالی های DNA خاص استفاده می کند، در حالی که CGH یک تکنیک هیبریداسیون مولکولی است که تغییرات توالی های DNA ژنومی را تشخیص می دهد. بنابراین، این تفاوت اصلی بین FISH و CGH است.
علاوه بر این، FISH برای طراحی توالی های کاوشگر به دانش قبلی از ناهنجاری هدف نیاز دارد، در حالی که CGH به دانش قبلی نیاز ندارد. همچنین، یک تفاوت دیگر بین FISH و CGH این است که FISH وضوح محدودی را نشان می دهد در حالی که aCGH وضوح بالایی را نشان می دهد.
اینفوگرافیک زیر تفاوت بین FISH و CGH را خلاصه می کند.
خلاصه - FISH در مقابل CGH
FISH و CGH دو تکنیک سیتوژنتیک مولکولی هستند که تشخیص توالی ژن مورد نظر را تسهیل می کنند. FISH با استفاده از پروب های نشاندار شده با فلورسنت، تشخیص توالی DNA خاص روی کروموزوم را تسهیل می کند در حالی که CGH تشخیص تغییرات در DNA ژنومی را تسهیل می کند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین FISH و CGH است.
