تفاوت کلیدی بین CGH و آرایه CGH در این است که CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی سنتی برای تجزیه و تحلیل تغییرات تعداد کپی در DNA نمونه آزمایشی است که وضوح پایین‌تری دارد، در حالی که آرایه CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی کاملاً خودکار است. تجزیه و تحلیل تنوع تعداد کپی در DNA نمونه آزمایشی که وضوح بالاتری دارد.
CGH و آرایه CGH دو تکنیک برای تشخیص تغییرات تعداد کپی در افراد هستند. تنوع تعداد کپی به بخش هایی از ژنوم اشاره دارد که تکرار می شوند. تعداد کپی بین افراد متفاوت است. تنوع تعداد کپی به طور کلی به دو گروه تقسیم می شود: تکرارهای کوتاه و تکرارهای طولانی.یکی از معروف‌ترین مثال‌ها برای تغییر تعداد کپی کوتاه، تکرار سه نوکلئوتید CAG در ژن هانتینگتین است. این باعث یک اختلال عصبی به نام هانتینگتین می شود. بهترین مثال برای تنوع تعداد کپی های طولانی، ژن آلفا آمیلاز است که باعث مقاومت به انسولین می شود. تنوع تعداد کپی را می توان با تکنیک هایی مانند FISH، CGH، و آرایه CGH شناسایی کرد.
CGH چیست؟
CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی سنتی برای آنالیز تنوع تعداد کپی در DNA یک نمونه آزمایشی در مقایسه با نمونه مرجع است. در مقایسه با تکنیک های خودکار وضوح کمتری دارد. هدف از این تکنیک مقایسه سریع و کارآمد دو نمونه DNA ژنومی است که از منابع مختلف ناشی می شوند.
شکل 01: CGH
روش شامل جداسازی DNA از دو منبع است: آزمایش و مرجع. سپس مرحله بعدی برچسب زدن مستقل نمونه‌های DNA آزمایشی و مرجع با فلوروفورهای رنگ‌های مختلف است. بعداً دو نمونه DNA دناتوره شدند تا نمونه های DNA تک رشته ای بدست آید. در نهایت، هیبریداسیون دو نمونه DNA حاصل در نسبت 1:1 به گسترش متافاز طبیعی کروموزوم ها انجام شد. تفاوت های کروموزومی را می توان با استفاده از میکروسکوپ فلورسانس و نرم افزار کامپیوتری بین دو منبع شناسایی کرد. علاوه بر این، روش CGH تنها قادر به تشخیص ناهنجاری های کروموزومی نامتعادل است.
Array CGH چیست؟
Array CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی کاملاً خودکار برای تجزیه و تحلیل تنوع تعداد کپی در DNA یک نمونه آزمایشی در مقایسه با نمونه مرجع است. وضوح بالاتری دارد و به منظور به حداقل رساندن محدودیت های CGH سنتی توسعه یافته است. Array CGH اصول CGH را با استفاده از ریزآرایه ها ترکیب می کند.این روش به جای استفاده از گسترش کروموزوم های متافاز، از اسلایدهایی با قطعات کوچک DNA به عنوان هدف استفاده می کند. این ریزآرایه ها با قرار دادن و بی حرکت کردن مقدار کمی از DNA (کاوشگر) روی یک تکیه گاه شیشه ای جامد ساخته شده اند. اندازه پروب ها می تواند از اولیگونوکلئوتید تا کروموزوم مصنوعی باکتریایی متفاوت باشد.
شکل 02: آرایه CGH
صرف نظر از پروب ها، روش اصلی آرایه CGH مشابه CGH است. هنگامی که پروب های حاوی ریزآرایه آماده شدند، دو نمونه DNA (آزمایش و مرجع) که با فلوروفورهای رنگ های مختلف برچسب گذاری شده اند، با هم مخلوط شده و به ریزآرایه اضافه می شوند. از آنجایی که DNA در نمونه ها به دلیل دناتوره شدن تک رشته ای است، این DNA با پروب های تک رشته ای آرایه شده هیبرید می شود. با استفاده از یک سیستم تصویربرداری دیجیتال، می توان تفاوت های کروموزومی بین دو منبع را شناسایی کرد.
شباهت‌های CGH و Array CGH چیست؟
- CGH و آرایه CGH دو تکنیک برای تشخیص تغییرات تعداد کپی هستند.
- آنها روش های سیتوژنتیک مولکولی هستند.
- هر دو روش ناهنجاری های کروموزومی نامتعادل را تشخیص می دهند.
- فلوروفورها در هر دو روش دخالت دارند.
- هر دو روش را می توان برای تشخیص اختلالات ژنتیکی به دلیل تنوع تعداد کپی استفاده کرد.
- آنها به طور گسترده در تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای استفاده می شوند.
تفاوت بین CGH و Array CGH چیست؟
CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی سنتی برای تجزیه و تحلیل تغییرات تعداد کپی در DNA یک نمونه آزمایشی است که وضوح پایین‌تری دارد، در حالی که آرایه CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی کاملاً خودکار برای تجزیه و تحلیل تنوع تعداد کپی در DNA یک نمونه آزمایشی است. که وضوح بالاتری دارد. بنابراین، این تفاوت اصلی بین CGH و آرایه CGH است.علاوه بر این، در CGH، نمونه‌های DNA آزمایشی و مرجع با گسترش متافاز طبیعی کروموزوم‌ها هیبرید می‌شوند، اما در آرایه CGH، نمونه‌های آزمایشی و DNA مرجع با پروب‌های DNA تثبیت‌شده حاوی ریزآرایه هیبرید می‌شوند.
اینفوگرافیک زیر تفاوت‌های بین CGH و آرایه CGH را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم فهرست می‌کند.
خلاصه - CGH در مقابل آرایه CGH
CGH و آرایه CGH دو تکنیک سیتوژنتیک مولکولی برای تشخیص ناهنجاری های کروموزومی نامتعادل هستند. آنها به طور گسترده در تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای استفاده می شوند. CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی سنتی برای تجزیه و تحلیل تغییرات تعداد کپی در DNA نمونه آزمایشی است که وضوح کمتری دارد. در مقابل، آرایه CGH یک روش سیتوژنتیک مولکولی کاملاً خودکار برای تجزیه و تحلیل تنوع تعداد کپی در DNA نمونه آزمایشی است که وضوح بالاتری دارد. بنابراین، این تفاوت بین CGH و آرایه CGH را خلاصه می کند.
