تفاوت اصلی بین ژن کاندید و GWAS این است که رویکرد ژن کاندید تنوع ژنتیکی را در تعداد کمی از ژنهای از پیش تعیینشده مورد بررسی بررسی میکند در حالی که GWAS کل ژنوم را برای یک تنوع ژنتیکی مشترک در پشت یک بیماری خاص بررسی میکند.
رویکرد ژن کاندید و مطالعات ارتباط گسترده ژنوم (GWAS) دو روشی هستند که برای تشخیص استعداد ژنتیکی به بیماریها مهم هستند. رویکرد ژن کاندید بر اساس تعداد کمی از ژن های از پیش تعیین شده است در حالی که GWAS بر اساس آزمایش کل ژنوم است. از این رو، رویکرد ژن کاندید نیاز به دانش قبلی از ژنهای مرتبط با بیماری، بر خلاف GWAS دارد.
ژن کاندیدا چیست؟
رویکرد ژن کاندید یکی از تکنیک هایی است که ارتباط بین تنوع ژنتیکی در ژن های از پیش تعیین شده مورد علاقه و فنوتیپ ها یا وضعیت های بیماری را بررسی می کند. در این رویکرد، آگاهی قبلی از تأثیر عملکردی بیولوژیکی ژن بر صفت یا بیماری مورد نظر ضروری است. بر اساس این دانش، تعداد کمی از ژن ها برای تنوع ژنتیکی انتخاب و تجزیه و تحلیل می شوند.
شکل 01: رویکرد ژن کاندید
انتخاب ژن ها بر اساس ارتباط بیولوژیکی، فیزیولوژیکی و عملکردی با بیماری مورد نظر در این رویکرد انجام می شود. این رویکرد اغلب به عنوان یک مطالعه مورد شاهدی طراحی می شود.
GWAS چیست؟
GWAS مخفف Genome-Wide Association Study است.همچنین به مطالعات ارتباط کل ژنوم اشاره دارد. این مطالعات عمدتاً بر مطالعات مشاهدهای متمرکز هستند. آنها انواع ژنتیکی افراد مختلف را که معمولاً با یک صفت خاص مرتبط هستند تجزیه و تحلیل می کنند. کل ژنوم برای تجزیه و تحلیل GWAS مهم است.
GWAS یک ابزار مهم در تجزیه و تحلیل پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی مرتبط با شرایط مختلف بیماری است. این یک مطالعه مقایسه ای از پلی مورفیسم های مختلف تک نوکلئوتیدی در یک جمعیت گسترده است. نمونه مورد مطالعه GWAS بسیار بالا است. از این رو، قالب یک مطالعه کوهورت مقطعی را نیز به خود می گیرد.
شکل 02: GWAS
اولین مطالعه GWAS با توجه به انفارکتوس میوکارد و تجزیه و تحلیل ژن های مرتبط با انفارکتوس میوکارد انجام شد. در حال حاضر GWAS نقش مهمی در تعیین زمینه ژنتیکی بیماریهای پیچیده با علت ناشناخته دارد.
شباهتهای بین ژن کاندید و GWAS چیست؟
- هر دو رویکرد ژن کاندید و GWAS تکنیک هایی هستند که ارتباط ژنتیکی بین ژنوتیپ و فنوتیپ بیماری را تجزیه و تحلیل می کنند.
- هر دو رویکرد به درک اساس ژنتیکی استعداد ابتلا به بیماری کمک می کنند.
تفاوت بین ژن کاندید و GWAS چیست؟
رویکرد ژن کاندید بر اساس ژن های کاندید یا ژن های از پیش تعیین شده است، در حالی که GWAS بر اساس کل ژنوم است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین ژن کاندید و GWAS است. همچنین در رویکرد ژن کاندید، انتخاب ژن ضروری است در حالی که در GWAS نیازی به آن نیست.
علاوه بر این، رویکرد ژن کاندید نیاز به دانش قبلی در مورد ژن های مرتبط با بیماری دارد، در حالی که برای GWAS لازم نیست.
اینفوگرافیک زیر مقایسه دقیق تری در رابطه با تفاوت بین ژن کاندید و GWAS ارائه می دهد.
خلاصه - ژن کاندیدا در مقابل GWAS
ژن کاندید و GWAS دو مطالعه مرتبط با ژن هستند. رویکرد ژن کاندید بر تنوع ژنتیکی مرتبط با بیماری در تعداد کمی از ژنهای از پیش تعیینشده تمرکز دارد. در مقابل، GWAS تنوع ژنتیکی مرتبط با بیماری را در کل ژنوم بررسی می کند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین ژن کاندید و GWAS است. هر دو روش در درک اساس ژنتیکی استعداد ابتلا به بیماری مهم هستند.