تفاوت کلیدی بین QTL و GWAS به نوع توالی های مورد استفاده در تجزیه و تحلیل بستگی دارد. QTL از جایگاه های ژن پیوندی برای تجزیه و تحلیل صفات فنوتیپی مرتبط با وراثت چند ژنی استفاده می کند در حالی که GWAS از توالی ژنوم کامل برای تجزیه و تحلیل پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی یک وضعیت خاص استفاده می کند.
نقشه های QTL و GWAS نقش مهمی در تجزیه و تحلیل ژنتیکی برای صفات مختلف دارند. علاوه بر این، آنها در تجزیه و تحلیل شرایط مختلف بیماری با علت ناشناخته مهم هستند. علاوه بر این، توالی در هر دو تکنیک نقش کلیدی ایفا می کند. این تکنیک‌ها را می‌توان با سایر تکنیک‌های توان عملیاتی بالا برای افزایش دقت و دقت همراه کرد.
QTL چیست؟
QTL مخفف Quantitative Trait Locus است. این ناحیه ای از DNA است که با یک صفت فنوتیپی مرتبط است. به طور کلی، QTL منجر به اثرات چند ژنی می شود. توزیع QTLها متفاوت است و تعداد QTLها درجه تنوع یک صفت فنوتیپی خاص را نشان می دهد. علاوه بر این، آنها معمولاً برای صفات زیربنایی پیوسته و نه صفات مجزا کد می‌کنند.
پس از شناسایی مناطق QTL، تعیین توالی یک ناحیه QTL خاص مهم است. علاوه بر این، برای آسان کردن تحقیقات و تحقیقات، توالی‌یابی و ذخیره‌سازی داده‌های توالی مناطق QTL مشترک با دخالت بیوانفورماتیک انجام می‌شود. ما این تکنیک را نقشه برداری QTL می نامیم. متعاقبا، یک پایگاه داده با توالی های ناحیه QTL ایجاد می شود.
شکل 01: اسکن QTL
علاوه بر این، کاربردهای توالی های QTL عمدتاً بر ابزار BLAST تکیه دارند، جایی که می توان شباهت توالی را تعیین کرد. در استنتاج روابط بین موجودات مهم است. علاوه بر این، در تعیین پیچیدگی یک فنوتیپ چند ژنی خاص مهم است. همچنین تکامل یک ویژگی خاص را تعیین می کند.
در حال حاضر، آنالیز QTL با سایر تکنیک‌های توان عملیاتی بالا مانند ریزآرایه‌های DNA ترکیب می‌شود. این در تجزیه و تحلیل بیان فنوتیپ مهم است. در حال حاضر، دانشمندان علاقه زیادی به توسعه پایگاه داده QTL دارند زیرا مناطق QTL مسئول بسیاری از صفات مهم گونه های مختلف هستند.
GWAS چیست؟
GWAS مخفف Genome Wide Association Study است. همچنین به کل مطالعات مرتبط با ژنوم اشاره دارد. این مطالعات عمدتاً بر مطالعات مشاهده‌ای متمرکز هستند. واریانت های ژنتیکی افراد مختلف که معمولاً با یک صفت خاص مرتبط هستند را تجزیه و تحلیل می کند. علاوه بر این، کل ژنوم برای تجزیه و تحلیل GWAS مهم است.
شکل 02: GWAS
GWAS یک ابزار مهم در تجزیه و تحلیل پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی مرتبط با شرایط مختلف بیماری است. این همچنین یک مطالعه مقایسه ای از پلی مورفیسم های مختلف تک نوکلئوتیدی در یک جمعیت گسترده است. علاوه بر این، نمونه مورد مطالعه GWAS بسیار بالا است. از این رو، قالب یک مطالعه کوهورت مقطعی را نیز به خود می گیرد.
علاوه بر این، اولین مطالعه GWAS با توجه به انفارکتوس میوکارد و تجزیه و تحلیل ژن‌های مرتبط با انفارکتوس میوکارد انجام شد. در حال حاضر GWAS نقش مهمی در تعیین زمینه ژنتیکی بیماری‌های پیچیده با علت ناشناخته دارد.
شباهت های QTL و GWAS چیست؟
- آنها برای تجزیه و تحلیل به داده های توالی DNA تکیه می کنند.
- هر دو با زمینه های ژنتیکی شخصیت های مختلف مرتبط هستند.
- علاوه بر این، آنها به ابزارهای بیوانفورماتیک برای استنباط و تفسیر نتایج نیاز دارند.
- آنها روی جمعیت های بزرگ انجام می شوند.
تفاوت QTL و GWAS چیست؟
QTL صفات فنوتیپی مرتبط با وراثت چند ژنی را با استفاده از جایگاه های ژنی مرتبط تجزیه و تحلیل می کند در حالی که GWAS پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی یک وضعیت خاص را با استفاده از توالی های ژنوم کامل تجزیه و تحلیل می کند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین QTL و GWAS است. نقشه برداری QTL نسبتاً یک تکنیک پیچیده تر از GWAS است زیرا به توالی یابی کل ژنوم نیاز دارد.
اینفوگرافیک زیر تفاوت بین QTL و GWAS را به صورت جدولی خلاصه می کند.
خلاصه – QTL در مقابل GWAS
نقشه برداری QTL و GWAS نقش عمده ای در تعیین پس زمینه ژنتیکی صفات فنوتیپی مختلف دارند. آنها همچنین در تجزیه و تحلیل زمینه ژنتیکی بیماری های مختلف کمک می کنند. نقشه برداری QTL ژن های پیوندی که مسئول صفات پیوسته هستند را نقشه برداری می کند و همچنین شامل نقشه برداری از ژن های توارث چند ژنی می شود. از سوی دیگر، GWAS با تجزیه و تحلیل کل ژنوم برای پلی‌مورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی انجام می‌شود. علاوه بر این، این امر در جمعیت بزرگتری اتفاق می افتد. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین QTL و GWAS است.
