تفاوت اصلی بین پیوند دهنده و آداپتور در این است که یک پیوند دهنده انتهای منسجم ندارد در حالی که یک آداپتور یک انتهای منسجم دارد.
بستن DNA فرآیند اتصال دو مولکول DNA به یکدیگر و تشکیل پیوندهای فسفودی استر است. آنزیمی به نام DNA لیگاز این واکنش را کاتالیز می کند. این یکی از مراحل حیاتی در زمینه‌های بیولوژیکی مولکولی مدرن مانند فناوری DNA نوترکیب و شبیه‌سازی DNA است. راندمان بستن به انتهای مولکول‌های DNA بستگی دارد. دو نوع انتهای DNA به عنوان انتهای چسبنده و انتهای بلوط وجود دارد. راندمان بستن با انتهای چسبنده نسبت به انتهای صاف بالا است. اگر مولکول‌های DNA هدف دارای انتهای صاف باشند، مولکول‌هایی به نام آداپتور یا پیوند دهنده مفید خواهند بود.آداپتورها و پیوند دهنده ها مولکول های الیگونوکلئوتیدی سنتز شده شیمیایی هستند که به بستن DNA کمک می کنند. آنها سایت های محدودیت داخلی نیز دارند. آداپتور دارای یک انتهای چسبنده و یک انتهای صاف است، در حالی که پیوند دهنده دارای دو انتهای صاف است.
لینکر چیست؟
لینکر یک توالی الیگونوکلئوتیدی سنتز شده شیمیایی است که دو رشته ای است. لینکر دو انتهای صاف دارد. پیوند دهنده برای بستن مولکول های DNA که دارای انتهای صاف به ناقل ها هستند استفاده می شود. این شامل یک یا چند سایت محدودیت داخلی است. این سایت‌های محدودکننده به‌عنوان مکان‌های شناسایی برای آنزیم‌های محدودکننده کار می‌کنند.
شکل 01: پیوند دهنده
پس از بستن، DNA دوباره با آنزیم های محدود کننده برای تولید انتهای منسجم محدود می شود. پیوند دهنده های EcoRI و sal-I پیوند دهنده ها معمولاً مورد استفاده قرار می گیرند.
آداپتور چیست؟
آداپتور یک توالی الیگونوکلئوتیدی دو رشته ای است که برای پیوند دادن دو مولکول DNA به یکدیگر استفاده می شود. این یک دنباله کوتاه با یک انتهای صاف و یک انتهای چسبنده یا منسجم است. بنابراین، از یک دم تک رشته ای در یک انتها تشکیل شده است که کارایی بستن DNA را افزایش می دهد.
شکل 02: بستن DNA توسط آداپتور
علاوه بر این، آداپتور دارای سایت‌های محدودیت داخلی است. بنابراین، پس از بستن، DNA را می توان با آنزیم های محدود کننده مناسب محدود کرد تا یک پایانه بیرون زده جدید ایجاد شود. یکی از معایب آداپتورها این است که دو آداپتور می توانند با جفت شدن پایه با خودشان دیمر تشکیل دهند. با درمان آنها با آنزیمی به نام آلکالین فسفاتاز می توان از این امر جلوگیری کرد.
شباهت‌های بین Linker و Adaptor چیست؟
- هم پیوند دهنده و هم آداپتور توالی های الیگونوکلئوتیدی کوتاه دو رشته ای هستند.
- آنها دارای سایت های محدودیت داخلی هستند.
- علاوه بر این، آنها مولکول های DNA سنتز شده شیمیایی هستند و مولکول های مصنوعی هستند.
- آنها می توانند دو مولکول DNA را به هم پیوند دهند.
- پس از بستن پیوند دهنده ها و آداپتورها، DNA دوباره با آنزیم های محدود کننده محدود می شود تا انتهای چسبنده ایجاد شود.
تفاوت بین Linker و Adaptor چیست؟
A linker یک الیگونوکلئوتید دوبلکس کوتاه سنتز شده شیمیایی با دو انتهای صاف است. آداپتور یک الیگونوکلئوتید دوبلکس کوتاه سنتز شده شیمیایی با یک انتهای چسبنده و یک انتهای صاف است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین پیوند دهنده و آداپتور است. علاوه بر این، آداپتورها می توانند دایمرها را تشکیل دهند، در حالی که پیوند دهنده ها دایمر تشکیل نمی دهند. بنابراین، این یکی دیگر از تفاوت های مهم بین پیوند دهنده و آداپتور است.
در زیر خلاصه ای از تفاوت های بین پیوند دهنده و آداپتور به صورت جدولی آمده است.
خلاصه - لینکر در مقابل آداپتور
لینکر و آداپتور دو نوع اولیگونوکلئوتید سنتز شده شیمیایی هستند که در بستن DNA انتهایی مفید هستند. لینکر دارای دو انتهای صاف است، در حالی که آداپتور دارای یک انتهای صاف و یک انتهای منسجم است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین پیوند دهنده و آداپتور است. آنها مولکول های دو رشته ای هستند که دارای مکان های محدودیت داخلی هستند. آنها به طور گسترده در فناوری DNA نوترکیب و شبیه سازی DNA استفاده می شوند.
