تفاوت اصلی بین پروب های DNA و RNA این است که پروب های DNA قطعاتی از DNA هستند که مکمل توالی های نوکلئوتیدی هدف هستند در حالی که پروب های RNA امتدادی از RNA تک رشته ای هستند که توالی های اسید نوکلئیک مکمل توالی های هدف هستند.
پروب یک توالی کوتاه مصنوعی از DNA یا RNA است که می تواند به صورت رادیواکتیو یا با مولکول های غیر رادیواکتیو برچسب گذاری شود. می تواند طولی بین 100 تا 1000 پایه داشته باشد. پروب ها در تشخیص توالی های نوکلئوتیدی هدف که مکمل توالی کاوشگر هستند مفید هستند. پس از اضافه شدن، کاوشگرها با توالی‌های مکمل یا توالی‌های هدف هیبرید می‌شوند و برای شناسایی توالی‌های هدف قابل مشاهده می‌شوند، زیرا حامل رادیواکتیویته هستند.پروب ها ابزارهای مولکولی مهمی برای بسیاری از زمینه های میکروبی و مولکولی مانند تشخیص بیماری های ژنتیکی، ویروس شناسی، آسیب شناسی قانونی، در آزمایش پدری، در انگشت نگاری DNA، RFLP، سیتوژنتیک مولکولی، هیبریداسیون درجا و غیره هستند.
پروب DNA چیست؟
پروب های DNAکشش های تک رشته ای DNA هستند. آنها می توانند برای تشخیص وجود توالی های اسید نوکلئیک مکمل (توالی های هدف) با هیبریداسیون استفاده شوند. هنگامی که یک کاوشگر DNA با توالی مکمل خود هیبرید می شود، یک هیبرید دو رشته ای را تشکیل می دهد. به منظور شناسایی آنها، پروب های DNA به طور کلی با رادیو ایزوتوپ ها، بیوتین، اپی توپ ها یا فلوروفورها برچسب گذاری می شوند. پروب های DNA نشاندار شده با بیوتین را می توان با آلکالین فسفاتاز نشاندار شده با استرپتاویدین با تعدادی روش آنزیمی و شیمیایی تشخیص داد.
شکل 01: کاوشگر DNA
توالی نوکلئوتیدی پروب DNA شناخته شده است. آنها دنباله های کوتاه با طول 100 تا 1000 جفت پایه هستند. پروب های DNA طولانی را می توان با فناوری DNA نوترکیب تولید کرد. آنها همچنین می توانند توسط PCR و شبیه سازی تولید شوند. در آزمایشگاه‌های میکروبیولوژی بالینی، پروب‌های DNA به آسانی برای تشخیص سریع بیماری‌های عفونی در دسترس هستند.
پروب RNA چیست؟
پروب های RNA امتداد تک رشته ای RNA هستند. آنها توالی های مکمل برای توالی های هدف در نمونه هستند. آنها معمولاً با RNA پلیمرازهای باکتریوفاژهای SP6، T7 یا T3 با رونویسی آزمایشگاهی DNA سنتز می شوند. پروب های RNA طولانی را می توان با رونویسی آزمایشگاهی از DNA پلاسمید خطی شده تولید کرد. به طور کلی، پروب های RNA قوی تر و محکم تر از پروب های DNA به توالی های مکمل خود متصل می شوند. مشابه پروب های DNA، پروب های RNA نیز می توانند در حین رونویسی برچسب گذاری شوند.
شباهت‌های بین پروب‌های DNA و RNA چیست؟
- هر دو پروب DNA و RNA توالی های نوکلئوتیدی تک رشته ای هستند.
- هر دو به طور مصنوعی طراحی و سنتز شده اند.
- علاوه بر این، آنها را می توان با رادیو ایزوتوپ ها، اپی توپ ها، بیوتین یا فلوروفورها برچسب گذاری کرد.
- آنها تمایل زیادی به یک توالی هدف خاص DNA یا RNA دارند.
- آنها در روش های مختلف بلاتینگ و هیبریداسیون درجا برای تشخیص توالی های اسید نوکلئیک هدف استفاده می شوند.
- هر دو نوع پروب را می توان با توالی های مکمل خود هیبرید کرد.
- همچنین در شناسایی میکروارگانیسم ها و تشخیص بیماری های عفونی، ارثی و سایر بیماری ها استفاده می شود.
تفاوت بین پروب های DNA و RNA چیست؟
پروب DNA یک کشش کوتاه از DNA است که مکمل توالی هدف است.از سوی دیگر، پروب RNA یک کشش تک رشته ای کوتاه از RNA است که مکمل توالی هدف است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین پروب های DNA و RNA است. علاوه بر این، پروب های DNA حاوی A، T، C و G هستند در حالی که پروب های RNA حاوی A، U، C و G هستند.
علاوه بر این، تفاوت بیشتر بین پروب های DNA و RNA پایداری ترمودینامیکی آنهاست. پروب های RNA پایداری ترمودینامیکی بیشتری را در مقایسه با پروب های DNA نشان می دهند.
در زیر اینفوگرافیک تفاوت های مهم بین پروب های DNA و RNA را نشان می دهد.
خلاصه - کاوشگرهای DNA در مقابل RNA
پروب قطعه کوچکی از DNA یا RNA است که برای تشخیص وجود یک توالی خاص در نمونه DNA یا RNA با هیبریداسیون مولکولی استفاده می شود. پروب های DNA قطعات DNA تک رشته ای کوتاه هستند در حالی که پروب های RNA توالی های RNA تک رشته ای کوتاه هستند.آنها توالی های شناخته شده هستند. پایداری ترمودینامیکی در پروب های RNA بیشتر از پروب های DNA است. پروب های RNA به توالی های مکمل خود محکم می چسبند تا پروب های DNA. بنابراین، این تفاوت بین پروب‌های DNA و RNA را خلاصه می‌کند.
