تفاوت اصلی بین رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR در این است که رتروترانسپوزون های LTR نوعی از رتروترانسپوزون ها هستند که در ساختار خود دارای تکرارهای انتهایی طولانی هستند، در حالی که رتروترانسپوزون های غیر LTR نوعی از رتروترانسپوزون ها هستند که تکرارهای انتهایی طولانی ندارند. در ساختار آنها.
رتروترانسپوزون ها (عناصر قابل انتقال کلاس I یا ترانسپوزون ها از طریق واسطه های RNA) نوعی جزء ژنتیکی هستند که می توانند خود را در مکان های ژنومی مختلف کپی کرده و بچسبانند. آنها این کار را با تبدیل مجدد RNA به DNA از طریق فرآیندی به نام رونویسی معکوس با استفاده از یک واسطه انتقال RNA انجام می دهند.دو نوع اصلی رتروترانسپوزون ها به نام های رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR وجود دارد
رتروترانسپوزون های LTR چیست؟
رتروترانسپوزون های LTR نوعی از رتروترانسپوزون ها هستند که در ساختار خود تکرارهای انتهایی طولانی دارند. رشته های طولانی DNA تکراری را می توان در هر انتهای رتروترانسپوزون LTR یافت. اینها به عنوان تکرارهای طولانی ترمینال (LTR) شناخته می شوند. هر LTR چند صد جفت پایه طول دارد. رتروترانسپوزون های LTR معمولاً بیش از 5 کیلو باز طول دارند. علاوه بر این، بین تکرارهای طولانی ترمینال، ژن هایی وجود دارد که می توانند معادل ژن های رتروویروس gag و pol رونویسی شوند. این ژن‌ها با هم همپوشانی دارند تا پروتئازی را رمزگذاری کنند که به طور معمول رونوشت حاصل را به محصولات ژنی عملکردی پردازش می‌کند.
شکل 01: رتروترانسپوزون های LTR
ژن Gag از رتروترانسپوزون ها محصولی را می سازد که با رونوشت های دیگر رتروترانسپوزون ها مرتبط می شود تا ذرات ویروس مانند را تشکیل دهد. ژن Pol محصولاتی تولید می کند که شامل آنزیم هایی مانند ترانس کریپتاز معکوس، اینتگراز و دامنه های ریبونوکلئاز H است. آنزیم ترانس کریپتاز معکوس رونویسی معکوس DNA رتروترانسپوزون را انجام می دهد. آنزیم اینتگراز DNA رتروترانسپوزون را در DNA ژنوم یوکاریوتی ادغام می کند. دامنه های ریبونوکلئاز H در جدا کردن پیوندهای فسفودی استر بین واسطه های RNA مفید هستند. رتروترانسپوزون های LTR همچنین رونوشت هایی را با مکان های اتصال tRNA رمزگذاری می کنند تا بتوانند به راحتی رونویسی معکوس را انجام دهند. علاوه بر این، از آنجایی که رتروترانسپوزون حاوی اطلاعات ژنوم یوکاریوتی است، می‌تواند کپی‌هایی از خود را در سایر مکان‌های ژنومی درون یک سلول یوکاریوتی وارد کند.
رتروترانسپوزون های غیر LTR چیست؟
رتروترانسپوزون های غیر LTR نوعی از رتروترانسپوزون ها هستند که در ساختار خود تکرارهای انتهایی طولانی ندارند.مانند رتروترانسپوزون های LTR، رتروترانسپوزون های غیر LTR نیز حاوی ژن هایی برای ترانس کریپتاز معکوس، پروتئین اتصال دهنده RNA، نوکلئاز و گاهی اوقات ریبونوکلئاز H هستند. اما آنها فاقد تکرارهای طولانی ترمینال هستند. در عوض، آنها تکرارهای کوتاهی دارند که می توانند یک ترتیب معکوس از پایه ها در کنار یکدیگر داشته باشند. پروتئین های اتصال دهنده RNA به واسطه انتقال RNA متصل می شوند و نوکلئازها پیوندهای فسفودی استری بین نوکلئوتیدهای اسیدهای نوکلئیک را می شکنند.
شکل 02: رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR
اگرچه آنها رتروترانسپوزون هستند، اما نمی توانند رونویسی معکوس را با استفاده از یک واسطه RNA به همان روشی که رتروترانسپوزون های LTR انجام دهند. این به این دلیل است که رتروترانسپوزون های غیر LTR حاوی توالی هایی نیستند که به tRNA متصل شوند. از این رو، یک رتروترانسپوزون غیر LTR که به mRNA رونویسی شده و به پروتئین ترجمه می شود، به عنوان ترانس کریپتاز معکوس عمل می کند.ترانس کریپتاز معکوس یک کپی DNA از RNA رتروترانسپوزون غیر LTR می سازد که می تواند در یک مکان جدید در ژنوم ادغام شود. علاوه بر این، رتروترانسپوزون‌های غیر LTR به دو نوع تقسیم می‌شوند: LINEs (عناصر هسته‌ای پراکنده طولانی) و SINE (عناصر هسته‌ای کوتاه درهم).
شباهت های بین رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR چیست؟
- رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR دو نوع اصلی رتروترانسپوزون هستند.
- هر دو نوع حاوی ژن هایی برای آنزیم هایی مانند ترانس کریپتاز معکوس، پروتئین اتصال RNA، نوکلئاز و حوزه های ریبونوکلئاز H هستند.
- آنها را می توان در ژنوم انسان یافت.
- هر دو نوع از نظر تکاملی مهم هستند.
تفاوت بین رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR چیست؟
رتروترانسپوزون های LTR دارای تکرارهای انتهایی طولانی در ساختار خود هستند، در حالی که رتروترانسپوزون های غیر LTR فاقد تکرارهای انتهایی طولانی در ساختار خود هستند.بنابراین، این تفاوت اصلی بین رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR است. علاوه بر این، رتروترانسپوزون های LTR دارای تکرارهای مستقیم طولانی هستند که فقط یک دنباله از بازها هستند که خودشان را تکرار می کنند. از سوی دیگر، رتروترانسپوزون‌های غیر LTR دارای تکرارهای کوتاهی هستند که می‌توانند ترتیب معکوس پایه‌ها را در کنار یکدیگر داشته باشند.
اینفوگرافیک زیر تفاوت‌های بین رتروترانسپوزون‌های LTR و غیر LTR را به شکل جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می‌دهد.
خلاصه - LTR در مقابل رتروترانسپوزون های غیر LTR
LTR و رتروترانسپوزون های غیر LTR دو نوع اصلی رتروترانسپوزون هستند. رتروترانسپوزون های LTR دارای تکرارهای انتهایی طولانی در ساختار خود هستند، در حالی که رتروترانسپوزون های غیر LTR تکرارهای انتهایی طولانی در ساختار خود ندارند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین رتروترانسپوزون های LTR و غیر LTR است.
