تفاوت کلیدی - Exome در مقابل رونوشت
یک ژن حاوی مناطق کد کننده و غیر کد کننده درون آن است. توالی های کد کننده به عنوان اگزون و توالی های غیر کد کننده به عنوان اینترون شناخته می شوند. توالی نوکلئوتیدی اگزون های یک ژن نشان دهنده کد ژنتیکی ژن برای سنتز پروتئین خاص است. از این رو اگزون ها در مولکول mRNA باقی می مانند. کل ناحیه اگزون ژنوم به اگزوم معروف است و بخش مهمی از ژنوم است. کد ژنتیکی ژن ها به کد ژنتیکی مولکول mRNA تبدیل می شود که برای تولید پروتئین مورد نیاز است. کل مولکول‌های mRNA که در یک سلول یا جمعیت سلولی رونویسی می‌شوند به عنوان رونوشت شناخته می‌شوند.تفاوت اصلی بین اگزوم و رونوشت در این است که اگزوم نشان دهنده توالی نواحی اگزون ژنوم است در حالی که ترانسکریپتوم نشان دهنده کل mRNA یک سلول یا بافت در یک زمان معین است.
Exome چیست؟
ژن ها از اگزون ها، اینترون ها و توالی های تنظیمی تشکیل شده اند. اگزون ها نواحی ژنی هستند که در طول رونویسی به توالی mRNA رونویسی می شوند. اینترون ها و سایر مناطق غیر کد کننده در طول رونویسی حذف می شوند. توالی نوکلئوتیدی اگزون ها کد ژنتیکی ژنی را که پروتئین خاصی را که کدگذاری می کند سنتز می کند، تعیین می کند. فقط اگزون ها در mRNA یک پروتئین باقی می مانند. مجموعه اگزون ها در ژنوم به عنوان اگزوم ارگانیسم شناخته می شود. این نشان دهنده بخشی از ژنوم است که در ژن ها بیان می شود. در انسان، اگزوم 1 درصد از ژنوم را تشکیل می دهد. این بخش کد کننده پروتئین ژنوم انسان است.
شکل 01: Exome
Transcriptome چیست؟
رونوشت مجموعه ای از تمام رونوشت های کد کننده و غیر کد کننده پروتئین (RNA) در یک بافت معین است. ترانسکریپتوم مجموعه ای از کل مولکول های mRNA است که توسط ژن ها در یک سلول یا یک بافت بیان می شود. رونوشت یک سلول را می توان با رونوشت یک نوع سلول دیگر تغییر داد. رونوشت نیز پویا است - با گذشت زمان در پاسخ به محرک های داخلی و خارجی تغییر می کند. حتی در همان بافت یا در همان نوع سلول، رونوشت می تواند پس از چند دقیقه تغییر کند.
ترانسکریپتوم با اگزوم یک ارگانیسم متفاوت است. رونوشت فقط شامل توالی های اگزوم بیان شده است. اگرچه اگزوم یک سلول یکسان می ماند، رونوشت در بین سلول ها متفاوت است زیرا بیان ژن برای همه سلول ها یا بافت ها یکسان نیست. تنها ژن های ضروری در سلول ها و بافت های مختلف بیان می شوند.بیان ژن یک فرآیند خاص بافت یا سلول است. توسط عوامل مختلفی از جمله عوامل محیطی تنظیم می شود. بنابراین، رونوشت می تواند با شرایط محیطی خارجی متفاوت باشد.
Transcriptome به عنوان پیش ساز برای مطالعات پروتئومیکس استفاده می شود. تمام پروتئین ها از توالی های mRNA مشتق می شوند. تغییرات ترجمه می تواند منجر به تغییرات در پروتئین ها شود. با این حال، رونوشت اطلاعات اساسی مهمی را برای مطالعات پروتئومی فراهم می کند.
شکل 02: رونوشت سلول های بنیادی جنینی
تفاوت بین Exome و Transcriptome چیست؟
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome مجموعه ای از ناحیه کد کننده پروتئین از ژن ها است. | Transcriptome مجموعه ای از تمام RNA رونویسی شده از جمله mRNA است. |
| نمونه | |
| Exome با استفاده از نمونه DNA مورد مطالعه قرار می گیرد. | ترانسکریپتوم با استفاده از نمونه RNA مورد مطالعه قرار می گیرد. |
| روش مطالعه | |
| توالی اگزوم کل روش مطالعه اگزوم است. | توالی RNA روشی برای مطالعه رونوشت است. |
خلاصه - Exome در مقابل رونوشت
اگزون ها توالی کد کننده ژن ها هستند و توالی mRNA پروتئین ها را تعیین می کنند. مجموعه ای از این توالی های کد کننده (اگزون ها) به عنوان اگزوم ارگانیسم شناخته می شود. ژن ها قبل از ساخت پروتئین به مولکول های mRNA رونویسی می شوند. کل مولکول های mRNA یک سلول یا یک بافت در هر زمان معین به عنوان رونوشت شناخته می شود.ترانسکریپتوم ژن هایی را نشان می دهد که در هر زمان به طور فعال در mRNA بیان می شوند. ترانسکریپتوم مختص سلول و بافت است و بر شرایط محیطی تأثیر می گذارد. این تفاوت بین exome و رونوشت است.
