تفاوت اصلی بین پرایمر و پروموتر این است که پرایمر یک توالی DNA کوتاه سنتز شده تجاری است که در PCR برای تکثیر یک توالی DNA هدف استفاده می شود در حالی که پروموتر یک توالی DNA خاص است که یک محل اتصال اولیه مطمئن برای RNA فراهم می کند. پلیمراز و فاکتورهای رونویسی به منظور شروع رونویسی.
پرایمر و پروموتر دو نوع توالی DNA هستند. پرایمر قطعه کوچکی از DNA است که برای واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) لازم است. دارای توالی های نوکلئوتیدی کوتاه مکمل انتهای کناری رشته DNA است. دو نوع پرایمر وجود دارد، و آنها به عنوان نقطه شروع برای سنتز رشته های DNA جدید عمل می کنند.در مقابل، یک پروموتر یک توالی DNA خاص است که در بالادست محل شروع رونویسی یک ژن قرار دارد. این به طور مستقیم با اجزای مکانیسم رونویسی مانند RNA پلیمراز و فاکتورهای رونویسی به منظور کنترل رونویسی DNA تعامل دارد. بنابراین، RNA پلیمراز و سایر فاکتورهای رونویسی به دنباله پروموتر متصل می شوند و رونویسی را آغاز می کنند.
پرایمر چیست؟
پرایمرها توالی های DNA کوتاهی هستند که برای تکثیر توالی های DNA هدف طراحی شده اند. از نظر ساختاری، آنها دارای توالی های نوکلئوتیدی کوتاهی هستند که مکمل انتهای کناری رشته های دوتایی DNA هستند. آنها معمولاً حدود 20 نوکلئوتید طول دارند. در طی PCR، Taq پلیمراز افزودن نوکلئوتیدها را به توالی نوکلئوتیدی موجود کاتالیز می کند. از این رو، پرایمرها به عنوان نقطه شروع برای سنتز رشته های جدید عمل می کنند. Taq polymerase فقط در جهت 5 تا 3 عمل می کند. از این رو، سنتز DNA نیز در همان جهت 5 به 3 انجام می شود. از آنجایی که DNA دو رشته ای است، دو نوع پرایمر در PCR مورد نیاز است.آنها بر اساس جهت ازدیاد طول پرایمر در طول سنتز DNA، به عنوان پرایمر رو به جلو و پرایمر معکوس شناخته می شوند.
شکل 01: آغازگر
پرایمر فوروارد با رشته DNA آنتی سنس بازپخت می شود و سنتز + رشته ژن را در جهت 5 به 3 آغاز می کند. دارای یک توالی نوکلئوتیدی کوتاه است که مکمل انتهای کناری 3 این رشته آنتی سنس است. پرایمر معکوس با رشته حس بازپخت می شود و سنتز یک رشته مکمل از رشته کد کننده را آغاز می کند، که یک رشته از ژن در جهت 5 به 3 است. بنابراین، پرایمر معکوس مکمل انتهای 3 رشته کد کننده طراحی شده است. هر دو پرایمر معکوس و جلو برای تولید میلیون ها تا میلیاردها نسخه از مناطق خاصی از DNA که مورد هدف یا علاقه مند هستند، مهم هستند.
مبلغ چیست؟
پروموتر یک توالی DNA است که در بالادست یا در انتهای '5 محل شروع رونویسی یک ژن قرار دارد. این یک محل اتصال برای RNA پلیمراز و عناصر تنظیمی خاص به منظور شروع رونویسی ژن فراهم می کند. این یک توالی تنظیمی است که برای روشن یا خاموش کردن یک ژن لازم است. یک توالی نوکلئوتیدی خاص در پروموتر وجود دارد. می تواند 100-1000 جفت پایه داشته باشد. پروموتر جهت رونویسی را نشان می دهد. علاوه بر این، رشته حسی را نشان می‌دهد که باید رونویسی شود.
شکل 02: مروج یک ژن
سه نوع از عناصر پروموتر وجود دارد به عنوان پروموتر اصلی، پروموتر پروگزیمال و پروموتر دیستال. پروموتر هسته حداقل بخشی از پروموتر مورد نیاز برای شروع رونویسی است.در نزدیکی کدون شروع قرار دارد. جعبه TATA یک منطقه حفاظت شده است که در بسیاری از پروموترهای هسته یوکاریوتی یافت می شود. 25 تا 35 جفت باز در بالادست محل شروع رونویسی یافت می شود. پروموتر پروگزیمال بیشتر در بالادست پروموتر هسته یافت می شود. به طور کلی، 250 جفت باز در بالادست کدون شروع قرار دارد و حاوی عناصر تنظیم کننده اولیه است. پروموتر دیستال در بالادست پروموتر پروگزیمال یافت می شود و حاوی عناصر تنظیمی اضافی است. پروموترهای باکتریایی دارای دو عنصر توالی کوتاه در پروموترهای خود هستند. TATAAT توالی اجماع واقع در -10 پروموتر باکتریایی است در حالی که TTGACA توالی اجماع در 35- است. آنها به عنوان عنصر -10 و عنصر -35 شناخته می شوند.
شباهت های بین Primer و Promoter چیست؟
- پرایمر و پروموتر دو نوع توالی DNA هستند.
- آنها از توالی های نوکلئوتیدی تشکیل شده اند.
- هم پرایمر و هم پروموتر برای بیان ژن مهم هستند.
تفاوت بین پرایمر و پروموتر چیست؟
Primer یک توالی نوکلئوتیدی کوتاه است که برای تکثیر DNA هدف طراحی شده است. در مقابل، پروموتر یک توالی DNA تنظیمی خاص است که در بالادست محل شروع رونویسی یک ژن یافت می شود. بنابراین، این تفاوت اصلی بین پرایمر و پروموتر است. پرایمرها حدود 20 جفت پایه هستند در حالی که پروموتر می تواند 100-1000 جفت باز داشته باشد. از نظر عملکردی، پرایمرها به عنوان توالی های آغازین برای سنتز رشته جدید خدمت می کنند، در حالی که پروموترها رونویسی ژن را با ایجاد مکان های اتصال برای RNA پلیمراز و سایر عوامل رونویسی کنترل می کنند.
علاوه بر این، یک پروموتر به عنوان جهت رونویسی تعریف می شود و نشان دهنده رشته حسی یک ژن است. از نظر ساختاری، پرایمر یک توالی DNA کوتاه و تک رشته ای است در حالی که پروموتر یک توالی DNA دو رشته ای بلند است.
نمودار اطلاعاتی زیر مقایسه های بیشتری را در رابطه با تفاوت بین پرایمر و پروموتر نشان می دهد.
خلاصه - Primer در مقابل Promoter
پرایمرها توالی های نوکلئوتیدی کوتاهی هستند که مکمل انتهای کناری دو رشته DNA هدف هستند. در PCR از دو نوع پرایمر استفاده می شود. آنها به عنوان دنباله های آغازین برای سنتز رشته های جدید عمل می کنند. پرایمرها به صورت تجاری طراحی شده اند و توالی پایدار دما هستند. از سوی دیگر، پروموتر یک توالی تنظیمی از یک ژن است که در بالادست محل شروع رونویسی قرار دارد. مروج ها رونویسی ژن ها را کنترل می کنند. آنها مکان های اتصالی را برای RNA پلیمراز و فاکتورهای رونویسی برای شروع رونویسی فراهم می کنند. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین پرایمر و پروموتر است.
