تفاوت کلیدی بین dATP و ddATP این است که dATP سنتز DNA را خاتمه نمی دهد در حالی که ddATP قادر به پایان دادن به سنتز DNA است. این به این دلیل است که ddATP دارای یک اتم H متصل به موقعیت 3' قند پنتوز است در حالی که dATP دارای یک گروه OH است که به موقعیت 3' متصل است.
dNTP ها بلوک های سازنده DNA هستند. چهار نوع dNTP با توجه به بازهای پورین یا پیریمیدین وجود دارد که یکی از آنها dATP است. پایه نیتروژنی dATP آدنوزین است. ddNTP ها نوکلئوتیدهایی هستند که در توالی یابی Sanger استفاده می شوند. چهار نوع ddNTP وجود دارد. ddATP یک ddNTP است.
dATP چیست؟
دئوکسی آدنوزین تری فسفات یک نوکلئوتید است که بلوک ساختمانی DNA است.آنزیم DNA پلیمراز از dATP به عنوان بستری برای سنتز DNA استفاده می کند. dATP دارای سه جزء است: یک مولکول قند دئوکسی ریبوز، یک آدنوزین و سه گروه فسفات. بنابراین، یک تری فسفات نوکلئوزیدی پورین است. فرمول شیمیایی dATP عبارت است از C10H16N5O۱۲ P3، و جرم مولکولی آن 491.182 است.
شکل 01: dATP
dATP از نظر اجزای قندی با ATP (آدنوزین تری فسفات) متفاوت است. ATP دارای قند ریبوز است. جفت بازهای dATP با نوکلئوتید اوراسیل در طول رونویسی. علاوه بر مشارکت در سنتز DNA، dATP می تواند به عنوان یک مولکول انتقال دهنده انرژی برای حفظ زنده ماندن سلول نیز عمل کند. سطح بالای dATP در بدن سمی است زیرا می تواند به عنوان یک مهارکننده غیررقابتی برای آنزیم ریبونوکلئوتید ردوکتاز عمل کند.می تواند منجر به اختلال در عملکرد سیستم ایمنی شود.
ddATP چیست؟
Dideoxyadenosine Triphoaphate یا ddATP یکی از چهار نوع نوکلئوتید مورد استفاده در روش توالی یابی سانگر است. از نظر ساختاری، ddATP نیز دارای سه جزء مشابه dATP است. آنها یک پایه آدنین، یک قند دئوکسی ریبوز و سه فسفات هستند.
شکل 02: ddATP
بر خلاف dATP، ddATP فاقد گروه OH در موقعیت 3' قند پنتوز است تا پیوند فسفودی استری با نوکلئوتید مجاور تشکیل دهد و طول زنجیره را ادامه دهد. اتم H در موقعیت 3 دارد. بنابراین، هنگامی که ddATP گنجانده شد، سنتز DNA به پایان می رسد. این اصل اساسی توالی سنگر است. بنابراین، ddATP به عنوان یک بازدارنده افزایش طول زنجیره در توالی یابی Sanger عمل می کند. چهار لوله در توالی یابی Sanger استفاده می شود و ddATP به یک لوله اضافه می شود.
شباهت‌های بین dATP و ddATP چیست؟
- dATP و ddATP نوکلئوتید هستند.
- هر دو از آدنین، دئوکسی ریبوز و سه فسفات تشکیل شده اند.
- آنها ترکیبات آلی هستند.
- هر دو dATP و ddATP در توالی سانگر به لوله‌ها اضافه می‌شوند.
تفاوت بین dATP و ddATP چیست؟
dATP دارای یک گروه OH در موقعیت 3' قند پنتوز است در حالی که ddATP فاقد گروه OH در موقعیت 3' قند پنتوز است. علاوه بر این، dATP یک مونومر است که در سنتز DNA استفاده می شود، در حالی که ddATP برای پایان دادن به افزایش طول زنجیره در طول توالی سنجی Sanger استفاده می شود. بنابراین، این تفاوت اصلی بین dATP و ddATP است. علاوه بر این، dATP می تواند پیوندهای فسفودی استری ایجاد کند در حالی که ddATP نمی تواند پیوندهای فسفودی استری را تشکیل دهد.
اینفوگرافیک زیر تفاوت های بیشتری را بین dATP و ddATP به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می دهد.
خلاصه - dATP در مقابل ddATP
به طور خلاصه، dATP پیش ساز سنتز DNA است در حالی که ddATP یک نوکلئوتید است که برای پایان دادن به سنتز DNA در توالی یابی Sanger استفاده می شود. علاوه بر این، dATP دارای یک گروه OH در موقعیت 3' قند پنتوز است و اجازه تشکیل یک پیوند فسفودی استر با نوکلئوتید بعدی را می دهد. در همین حال، ddATP فاقد گروه OH در موقعیت 3ʹ است. از این رو، قادر به ایجاد پیوند فسفودی استری با نوکلئوتید بعدی نیست. در نتیجه، توالی DNA ازدیاد شدن خود را متوقف می کند. بنابراین، این تفاوت بین dATP و ddATP را خلاصه می کند.
