تفاوت اصلی بین خطوط و SINE در این است که LINEها (عنصرهای هسته ای پراکنده طولانی) نوعی از رتروترانسپوزون های طولانی تر غیر LTR هستند در حالی که SINE ها (عناصر هسته ای کوتاه در هم آمیخته) نوعی از رتروترانسپوزون های غیر LTR بسیار کوتاه تر هستند.
رتروترانسپوزون های غیر LTR حاوی تکرارهای پایانی طولانی (LTR) نیستند. با این حال، آنها حاوی ژن هایی برای ترانس کریپتاز معکوس، پروتئین اتصال RNA، نوکلئاز و دامنه ریبونوکلئاز H هستند. رتروترانسپوزون های غیر LTR تکرارهای کوتاهی دارند. این تکرارها دارای ترتیب معکوس پایه ها در کنار یکدیگر هستند. جدای از آن، رتروترانسپوزون های غیر LTR نیز دارای تکرارهای مستقیم در ترانسپوزون های LRT هستند.رتروترانسپوزون های غیر LTR به دو دسته LINE و SINE تقسیم می شوند.
خطوط چیست؟
خطوط(عناصر هسته‌ای دراز در هم آمیخته) رتروترانسپوزون‌های طولانی‌تر غیر LTR هستند. آنها در ژنوم یوکاریوت ها گسترده هستند. آنها معمولاً 21.1 درصد از ژنوم انسان را تشکیل می دهند. طول هر خط حدود 7000 جفت پایه است. خطوط می توانند به mRNA رونویسی کنند و به پروتئینی تبدیل شوند که می تواند به عنوان آنزیم ترانس کریپتاز معکوس عمل کند. این ترانس کریپتاز معکوس کپی DNA RNA LINEs را تولید می کند. این کپی‌های DNA را می‌توان در یک سایت جدید در ژنوم ادغام کرد.
شکل 01: خطوط و سینوس
ژنوم انسان فقط یک خط فراوان به نام LINE-1 دارد. عنصر LINE-1 حدود 6000 جفت پایه طول دارد. حدود 100000 عنصر LINE-1 کوتاه شده در ژنوم انسان وجود دارد.جهش تصادفی می تواند در خطوط رخ دهد. به دلیل جهش های تصادفی، خطوط می توانند تخریب شوند. آنها دیگر رونویسی یا ترجمه نمی شوند. علاوه بر این، خطوط به پنج گروه اصلی مانند L1، RTE، R2، I و جوکی گروه بندی می شوند. این پنج گروه بیشتر به 28 کلاس دیگر تقسیم می شوند.
خطوطمعمولاً از طریق مکانیزمی به نام مکانیسم رونویسی معکوس هدف اولیه (TPRT) منتشر می شوند. قرار دادن لاین ها باعث ایجاد بیماری های انسانی مانند هموفیلی A، سرطان، اختلالات مندلین و غیره می شود. هیپومتیلاسیون LINE ها همچنین باعث ایجاد انواع خاصی از سرطان می شود.
سینه چیست؟
SINEs (عناصر هسته‌ای کوتاه درهم) نوعی از رتروترانسپوزون‌های غیر LTR بسیار کوتاه‌تر هستند. طول آنها حدود 100 تا 700 جفت پایه است. SINE ها نیز عناصر DNA هستند که خود را در سراسر ژنوم یوکاریوتی از طریق واسطه های RNA تقویت می کنند. SINE حدود 13 درصد از ژنوم پستانداران را تشکیل می دهد. نواحی داخلی SINE ها از tRNA سرچشمه می گیرند. به شدت محافظت شده است.آنها اغلب در بسیاری از گونه های مهره داران و بی مهرگان وجود دارند. تنوع تعداد کپی و جهش در SINE ها را می توان برای ساخت طبقه بندی بر اساس فیلوژنی گونه ها گنجاند.
SINE ها را می توان به سه نوع اصلی گروه بندی کرد: CORE-SINE، V-SINE و AmnSINE. عنصر Alu رایج ترین SINE در پستانداران است. علاوه بر این، بیش از 50 بیماری انسانی مرتبط با درج SINE وجود دارد. هنگامی که آنها در داخل یا نزدیک اگزون ها قرار می گیرند، می توانند باعث اتصال نامناسب یا تغییر قاب خواندن شوند. این منجر به فنوتیپ های بیماری مانند سرطان سینه، سرطان روده بزرگ، لوسمی، هموفیلی، فیبروز کیستیک، سرطان روده بزرگ، بیماری دنت، نوروفیبروماتوز و غیره می شود.
شباهت های بین خطوط و سینوس چیست؟
- LINEs و SINE دو نوع رتروترانسپوزون غیر LTR هستند.
- هر دو منطقه پایانه طولانی (LTR) ندارند.
- هر دو عمدتاً فقط در یوکاریوت ها یافت می شوند.
- هر دو غیر خودمختار هستند.
تفاوت بین خطوط و سینوس چیست؟
خطوطرتروترانسپوزون های غیر LTR طولانی تر هستند، در حالی که SINE ها رتروترانسپوزون های غیر LTR بسیار کوتاه تر هستند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین LINE و SINE است. علاوه بر این، LINES برای آنزیم ترانس کریپتاز معکوس کد می کند، در حالی که SINE برای آنزیم ترانس کریپتاز معکوس کد نمی کند. بنابراین، این یکی دیگر از تفاوت‌های بین خطوط و سین‌ها است.
تفاوت های بیشتر بین خطوط و SINE در زیر به شکل جدولی برای مقایسه کنار هم فهرست شده است.
خلاصه - LINEs در مقابل SINEs
رتروترانسپوزون ها عمدتاً در همه یوکاریوت ها یافت می شوند اما در پروکاریوت ها وجود ندارند. تقریباً 37 درصد از ژنوم انسان حاوی رتروترانسپوزون است. رتروترانسپوزون ها عمدتاً دو نوع هستند: رتروترانسپوزون های LTR و Non-LTR. رتروترانسپوزون های غیر LTR حاوی تکرارهای انتهایی طولانی (LTR) نیستند که در رتروترانسپوزون های LTR وجود دارند.رتروترانسپوزون های غیر LTR بیشتر به دو دسته تقسیم می شوند: LINEs و SINE. خطوط رتروترانسپوزون های غیر LTR طولانی تر هستند، در حالی که SINE ها رتروترانسپوزون های غیر LTR بسیار کوتاه تر هستند. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین خطوط و SINE است.
