تفاوت اصلی بین پیوند سیس و ترانس در این است که پیوند سیس یک مکانیسم درون مولکولی است که اینترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان هستند، در حالی که ترانس اسپلایسینگ یک مکانیسم بین مولکولی است که اینترون ها یا اوترون ها را حذف می کند. به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان نیستند.
پیرایش RNA نوعی پردازش RNA قبل از سنتز پروتئین است. در این فرآیند، رونوشت RNA پیش از پیام رسان تازه ساخته شده به یک RNA پیام رسان بالغ تبدیل می شود. RNA پیام رسان بالغ به تولید یک مولکول پروتئین کمک می کند. در طول اتصال RNA، اینترون ها (مناطق غیر کد کننده) حذف می شوند و اگزون ها (مناطق کد کننده) به یکدیگر متصل می شوند تا mRNA بالغ را بسازند.پیوند سیس و ترانس دو نوع مکانیسم پیوند RNA هستند.
Cis Splicing چیست؟
Cis splicing یک مکانیسم درون مولکولی است که اینترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان هستند. پیوند معمولی سیس یک مولکول RNA واحد را پردازش می کند. پیوند سیس، فرآیند پیرایش معمولی پیش mRNA است که توسط اسپلایسئوزوم ها انجام می شود. در اینترون، یک محل اهداکننده (انتهای 5 اینترون)، یک محل شاخه (نزدیک انتهای اینترون 3) و یک مکان گیرنده (3 انتهای اینترون) برای اتصال بسیار ضروری هستند. محل پیوند دهنده شامل یک توالی ثابت GU در انتهای 5 اینترون است. محل گیرنده اتصال در انتهای 3 اینترون دارای یک توالی AG ثابت است. در بالادست توالی AG ناحیه ای به نام ناحیه پیریمیدین (مسیر پلی پیریمیدین) وجود دارد. بیشتر در بالادست از مسیر پلی پیریمیدین، یک نقطه انشعاب وجود دارد که شامل یک نوکلئوتید آدنوزین است. این نوکلئوتید در تشکیل لاریات نقش دارد.
شکل 01: اتصال Cis و Trans
اسپلایسئوزوم های اصلی U1، U2، U4، U5 و U6 هستند. در این میان U1 و U2 بسیار مهم هستند. در اتصال cis، U1 به محل اتصال 5' و U2 به نقطه انشعاب نزدیک به محل اتصال 3' متصل می شود. U5/U4/U6 اگزون ها را در محل 5’ متصل می کند و U6 به U2 متصل می شود. بعداً U1 منتشر شد. U5 از اگزون به اینترون جابجا می شود و U6 در محل اتصال 5' متصل می شود. علاوه بر این، U4 نیز منتشر شده است. U6/U2 ترانس استریفیکاسیون را کاتالیز می کند و انتهای 5 اینترون را به نوکلئوتید A روی اینترون متصل می کند. این باعث تشکیل لاریات می شود. در تشکیل یک لاریات، U5 اگزون را در محل اتصال 3' متصل می کند و محل 5' شکاف می دهد. در مرحله نهایی اسپلایسینگ، U2/U5/U6 به لاریات متصل می‌مانند و محل 3’ بریده می‌شود. علاوه بر آن، اگزون ها با استفاده از هیدرولیز ATP در این فاز پیوند می شوند.
ترنس اسپلایسینگ چیست؟
ترانس اسپلایسینگ یک مکانیسم بین مولکولی است که اینترون ها یا اوترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان نیستند. در ترانس اسپلایسینگ، روی مولکول pre mRNA محل اتصال 5 اینچی برای اتصال پروتئین U1 وجود ندارد. درعوض، RNA سرپیچ اتصال (SL) برای توالی در اوررون ترانس اسپلایس می شود.
شکل 02: پیوند ترانس
Outron ناحیه ای از pre mRNA بین کلاهک 5 و محل پیوند ترانس است. با این حال، پروتئین U2 معمولاً به محل اتصال 3' متصل می شود. پس از حذف اوترون، اگزون رهبر اتصال (SL) به اگزون اول در pre mRNA متصل می شود. علاوه بر این، ترانس اسپلایسینگ مکانیزمی است که در میکروارگانیسم های خاصی مانند پروتیست های کلاس Kinetoplastae برای بیان ژن مشاهده می شود.
شباهت‌های بین Cis و Trans Splicing چیست؟
- Cis و trans splicing دو نوع مکانیسم پیوند RNA هستند.
- در هر دو مکانیسم، اینترون ها حذف می شوند.
- همچنین، در هر دو مکانیسم، اگزون ها برای تشکیل mRNA بالغ به هم متصل می شوند.
- هر دو مکانیسم در یوکاریوت ها یافت می شوند.
- این مکانیسم ها در پروکاریوت ها وجود ندارند.
تفاوت بین Cis و Trans Splicing چیست؟
Cis یک مکانیسم درون مولکولی است که اینترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان هستند، در حالی که ترانس اسپلایسینگ یک مکانیسم بین مولکولی است که اینترون ها یا اوترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی که در داخل همان RNA نیستند می پیوندد. رونوشت. بنابراین، این تفاوت اصلی بین اتصال سیس و ترانس است. علاوه بر این، در اتصال سیس، اینترون ها برای تشکیل mRNA بالغ حذف می شوند. از سوی دیگر، در ترانس اسپلایسینگ، اینترون ها یا اوترون ها برای تشکیل mRNA بالغ حذف می شوند.
اینفوگرافیک زیر تفاوت‌های بین اتصال cis و trans را به شکل جدولی برای مقایسه کنار هم فهرست می‌کند.
خلاصه - Cis vs Trans Splicing
پیچیدن RNA شکلی از پردازش RNA قبل از فرآیند سنتز پروتئین است. پیوند سیس و ترانس دو نوع مکانیسم پیوند RNA هستند که در یوکاریوت ها یافت می شوند. پیوند سیس یک مکانیسم درون مولکولی است که اینترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان هستند، در حالی که ترانس اسپلایسینگ یک مکانیسم بین مولکولی است که اینترون ها یا اوترون ها را حذف می کند و به اگزون هایی می پیوندد که در رونوشت RNA یکسان نیستند. بنابراین، این بحث در مورد تفاوت بین اتصال cis و trans به پایان می رسد.
