تفاوت اصلی بین شین دالگارنو و توالی کوزاک این است که توالی شین دالگارنو یک محل اتصال ریبوزومی در RNA پیام رسان باکتریایی و باستانی است، در حالی که توالی کوزاک محل شروع ترجمه پروتئین در اکثر RNA های پیام رسان یوکاریوتی است..
Shine Dalgarno و Kozak دنباله ای هستند که برای شروع ترجمه بسیار مهم هستند. در زیست‌شناسی مولکولی، ترجمه فرآیندی است که طی آن ریبوزوم‌ها در سیتوپلاسم پروتئین‌ها را پس از فرآیند رونویسی سنتز می‌کنند. در ترجمه، یک mRNA (RNA پیام رسان) در یک ریبوزوم رمزگشایی می شود تا زنجیره اسید آمینه خاصی در خارج از هسته تولید کند.به طور معمول، یک ریبوزوم فرآیند رمزگشایی را با تسهیل اتصال توالی های آنتی کدون tRNA مکمل به کدون های mRNA القا می کند. ترجمه در سه مرحله انجام می شود: شروع، طولانی شدن و خاتمه.
دنباله شاین دالگارنو چیست؟
توالی Shine Dalgarno یک محل اتصال ریبوزومی در RNA پیام رسان باکتریایی و آرکی است. معمولاً در حدود 8 پایه بالادست کدون شروع AUG قرار دارد. این توالی RNA با تراز کردن ریبوزوم با کدون شروع mRNA به جذب ریبوزوم ها به RNA پیام رسان کمک می کند. بنابراین، سنتز پروتئین را آغاز می کند. یک بار پس از استخدام، tRNA می تواند اسیدهای آمینه را به ترتیبی که توسط کدون های mRNA دیکته می شود، اضافه کند. این توالی خاص در باکتری ها رایج است اما در باستان شناسی نادرتر است. علاوه بر این، در رونوشت های کلروپلاست و میتوکندری نیز وجود دارد. دنباله شاین دالگارنو اولین بار توسط دانشمندان استرالیایی جان شاین و لین دالگارنو پیشنهاد شد. دنباله اجماع شش پایه AGGAGG است. به عنوان مثال، در اشرشیاکلی توالی AGGAGGU است.
شکل 01: سکانس شین دالگارنو
انتخاب محل شروع (AUG) به تعامل بین زیر واحد 30S ریبوزوم و الگوی mRNA بستگی دارد. ناحیه غنی از پیریمیدین در جزء 16srRNA زیرواحد 30S به ناحیه غنی از پورین معروف به دنباله Shine Dalgarno در بالادست کدون شروع AUG در mRNA متصل می شود. علاوه بر این، در طول تشکیل کمپلکس آغازین، این توالی‌های نوکلئوتیدی مکمل جفت می‌شوند تا یک ساختار RNA دو رشته‌ای را تشکیل دهند. این امر اتصال mRNA به یک ریبوزوم را تسهیل می کند به گونه ای که کدون آغازین در محل P ریبوزوم قرار می گیرد.
دنباله کوزاک چیست؟
توالی Kozak محل شروع ترجمه پروتئین در اکثر mRNA یوکاریوتی است.به این دنباله توالی اجماع کوزاک نیز می گویند. توالی کوزاک توالی بهینه برای شروع ترجمه در یوکاریوت ها است. این توالی یک جنبه جدایی ناپذیر از تنظیم پروتئین است. همچنین برای سلامت کلی سلول بسیار مهم است. با میانجیگری مونتاژ ریبوزوم و شروع ترجمه، به تصحیح ترجمه پروتئین از پیام های ژنتیکی کمک می کند.
شکل 02: دنباله کوزاک
این دنباله به افتخار دانشمندی که آن را کشف کرد، مریلین کوزاک نامگذاری شد. او آن را از طریق تجزیه و تحلیل دقیق توالی های ژنومی DNA کشف کرد. دنباله کوزاک 5 اینچ (gcc) gccRccAUGG-3 است. حروف بزرگ نشان دهنده پایه های حفظ شده هستند، در حالی که حروف کوچک نشان دهنده پایه های متغیر مشترک هستند. R یک پورین (آدنین یا گوانین) را نشان می دهد که همیشه در این مکان قرار دارد.
شباهت های بین Shine Dalgarno و Kozak Sequence چیست؟
- Shine Dalgarno و Kozak توالی دو دنباله اجماع هستند که در شروع ترجمه بسیار مهم هستند.
- هر دو توالی RNA هستند.
- زیر واحد کوچکتر ریبوزوم به هر دو دنباله متصل می شود.
- هر دو توالی مونتاژ مناسب ریبوزوم و شروع ترجمه را واسطه می کنند.
- آنها جنبه های جدایی ناپذیر تنظیم پروتئین و سلامت کلی سلولی هستند.
تفاوت بین Shine Dalgarno و Kozak Sequence چیست؟
توالی Shine Dalgarno یک محل اتصال ریبوزومی است که در RNA پیام رسان باکتریایی و باستانی یافت می شود، در حالی که توالی Kozak یک مکان شروع ترجمه پروتئین است که در اکثر RNA های پیام رسان یوکاریوتی یافت می شود. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین سکانس Shine Dalgarno و Kozak است. علاوه بر این، دنباله Shine Dalgarno 5'AGGAGGU3' است در حالی که دنباله Kozak 5' (gcc) gccRccAUGG-3' است.
اینفوگرافیک زیر تفاوت های بین Shine Dalgarno و دنباله Kozak را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم فهرست می کند.
خلاصه – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
توالی‌های Shine Dalgarno و Kozak دو توالی RNA توافقی هستند که برای مونتاژ ریبوزوم و شروع ترجمه بسیار مهم هستند. توالی شین دالگارنو یک محل اتصال ریبوزومی در RNA پیام رسان باکتریایی و باستانی است، در حالی که توالی کوزاک محل شروع ترجمه پروتئین در اکثر RNA های پیام رسان یوکاریوتی است. بنابراین، این تفاوت بین دنباله Shine Dalgarno و Kozak را خلاصه می کند.
