تفاوت کلیدی بین تداخل RNA و الیگونوکلئوتید ضد حس این است که تداخل RNA تکنیکی است که شامل سرکوب توالی خاص بیان ژن توسط یک RNA دو رشته‌ای است در حالی که الیگونوکلئوتید ضد حس تکنیکی که شامل سرکوب توالی خاص بیان ژن توسط یک اولیگونوکلئوتید DNA تک رشته ای است.
خاموش کردن یا سرکوب ژن راهی برای تنظیم بیان ژن در یک سلول بیولوژیکی برای جلوگیری از بیان یک ژن خاص است. به طور معمول، هنگامی که ژن ها خاموش می شوند، بیان آنها کاهش می یابد. در مقابل، زمانی که ژن ها حذف می شوند، به طور کامل از ژنوم ارگانیسم پاک می شوند. بنابراین، هیچ بیانی نخواهد داشت.گاهی اوقات، خاموش کردن ژن، همان شکست ژن در نظر گرفته می شود. دلیل آن این است که روش های خاموش کردن ژن مانند RNAi، الیگونوکلئوتید آنتی سنس و CRISPR که برای خاموش کردن ژن ها استفاده می شوند باعث کاهش بیان ژن حداقل 70 درصد می شوند. تداخل RNA و الیگونوکلئوتیدهای آنتی سنس دو تکنیک مهم خاموش کردن ژن هستند.
تداخل RNA چیست؟
تداخل RNA (RNAi) یک فرآیند بیولوژیکی است که در آن مولکول‌های RNA دو رشته‌ای سرکوب توالی خاص بیان ژن را انجام می‌دهند. اندرو فایر و کریگ سی. ملو در سال 2006 جایزه نوبل پزشکی را برای کار استثنایی خود در زمینه تداخل RNA در کرم نماتد: Caenorhabditis elegans دریافت کردند. این تحقیق پیشگام در مورد تداخل RNA اولین بار توسط آنها در سال 1998 منتشر شد. معمولاً مسیر RNAi در بسیاری از موجودات یوکاریوتی از جمله حیوانات یافت می شود.
شکل 01: تداخل RNA
دو مولکول مرکزی، microRNA (miRNA) و RNA تداخلی کوچک (siRNA)، در مسیر RNAi نقش دارند. آنزیمی به نام دایسر این مسیر را القا می کند. دایسر RNA دو رشته ای بلند را به قطعات دو رشته ای کوتاه می شکافد (21 نوکلئوتید siRNA). سپس هر siRNA به دو RNA تک رشته ای معروف به رشته مسافر و رشته راهنما باز می شود. رشته مسافری تخریب می شود در حالی که رشته راهنما در مجتمع خاموش کننده القایی RNA (RISC) گنجانده شده است. در RISC، جفت‌های رشته‌ای را با mRNA مکمل هدایت می‌کند، که Argonaute (Ago2)، جزء کاتالیزوری مجموعه RISC را تحریک می‌کند. بعداً، Argonaute مولکول mRNA را می شکافد. برخلاف siRNA، microRNA (miRNA) ناحیه ترجمه‌نشده 3 mRNA را هدف قرار می‌دهد که در آنجا با مکمل ناقص متصل می‌شوند. این امر دسترسی mRNA به ریبوزوم ها را برای ترجمه مسدود می کند.
الیگونوکلئوتید آنتی سنس چیست؟
الیگونوکلئوتید آنتی سنس تکنیکی است که شامل سرکوب توالی خاص بیان ژن توسط یک اولیگونوکلئوتید DNA تک رشته ای است. این تکنیک ضدحس درمانی نیز نامیده می شود. این نوعی درمانی است که از الیگونوکلئوتیدهای ضد حس (ASOs) برای هدف قرار دادن RNA پیام رسان (mRNA) استفاده می کند. الیگونوکلئوتیدهای آنتی سنس بیان mRNA را با استفاده از مکانیسم‌های مختلفی مانند پوسیدگی pre mRNA به واسطه ریبونوکلئاز H، انسداد فضایی مستقیم و مدولاسیون محتوای اگزون از طریق اتصال محل اتصال به mRNA پیش از آن تغییر می‌دهند.
شکل 02: الیگونوکلئوتید ضد حس
چندین الیگونوکلئوتید آنتی سنس توسط ایالات متحده و اتحادیه اروپا برای درمان بیماری تایید شده اند.علاوه بر این، الیگونوکلئوتیدهای آنتی سنس قبلاً به عنوان درمانی برای بسیاری از بیماری‌ها از جمله بیماری باتن، رتینیت سیتومگالوویروس، دیستروفی عضلانی دوشن، سندرم شیلومیکرونمی خانوادگی، هیپرکلسترولمی خانوادگی، آمیلوئیدوز ارثی با واسطه ترانس تیرتین، و آمیلوئیدوز اسپینال تایید شده‌اند.
شباهت های بین تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس چیست؟
- تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس دو تکنیک مهم خاموش کردن ژن هستند.
- هر دو تکنیک مولکول های mRNA را هدف قرار می دهند.
- آنها تکنیک های توالی خاص هستند.
- هر دو روش به عنوان درمان برای بسیاری از بیماری ها استفاده می شوند.
- هر دو بیان ژن را مهار می کنند.
تفاوت بین تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس چیست؟
تداخل RNA تکنیکی است که شامل سرکوب توالی خاص بیان ژن توسط یک RNA دو رشته ای است در حالی که الیگونوکلئوتید آنتی سنس تکنیکی است که شامل سرکوب بیان ژن توسط یک الیگونوکلئوتید DNA تک رشته ای است.بنابراین، این تفاوت کلیدی بین تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس است.
اینفوگرافیک زیر تفاوت بین تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس را به شکل جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می دهد.
خلاصه - تداخل RNA در مقابل الیگونوکلئوتید آنتی سنس
تکنیک های خاموش کردن ژن بیان ژن سلولی را کاهش می دهد. تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس دو تکنیک مهم خاموش کردن ژن هستند. تداخل RNA تکنیکی است که شامل سرکوب توالی خاص بیان ژن توسط یک RNA دو رشته ای است در حالی که الیگونوکلئوتید آنتی سنس تکنیکی است که شامل سرکوب بیان ژن توسط یک الیگونوکلئوتید DNA تک رشته ای است. بنابراین، این تفاوت بین تداخل RNA و الیگونوکلئوتید آنتی سنس را خلاصه می کند.
