تفاوت اصلی بین آنزیم های محدودکننده EcoRI و HindIII در این است که EcoRI یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از E.coli جدا شده است، در حالی که HindIII یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از هموفیلوس آنفولانزا جدا شده است..
آنزیم محدود کننده یا اندونوکلئاز محدود کننده آنزیمی است که DNA را در مکان‌های شناسایی خاص (محل‌های محدودیت) درون مولکول DNA به قطعات می‌شکند. این آنزیم های محدود کننده در باکتری ها و باستانی ها یافت می شوند. آنها یک مکانیسم دفاعی در برابر ویروس های مهاجم ارائه می دهند. آنزیم های محدود کننده به طور کلی به پنج نوع مختلف طبقه بندی می شوند: نوع I، نوع II، نوع III، IV و نوع V. EcoRI و HindIII دو آنزیم محدود کننده هستند که به گروه آنزیم های محدود کننده نوع II تعلق دارند.
آنزیم های محدود کننده EcoRI چیست؟
EcoRI یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از گونه E.coli جدا شده است. این یک آنزیم محدود کننده است که مارپیچ های دوگانه DNA را در مکان های خاص به قطعات می شکافد. EcoRI نیز بخشی از سیستم محدودیت-اصلاح است. EcoRI اولین آنزیمی بود که در ابتدا از سویه RY13 گونه E. coli جدا شد. به عنوان یک آنزیم محدود کننده در زیست شناسی مولکولی استفاده می شود. EcoRI 4 انتهای چسبنده نوکلئوتیدی با 5 اینچ اورهانگ انتهایی AATT ایجاد می کند. EcoRI DNA را در توالی شناسایی خاص G↓AATTC برش می دهد. دارای توالی مکمل پالیندرومیک CTTAA↓G است. علاوه بر این، این آنزیم محدود کننده متعلق به زیر کلاس نوع II P (ویژگی پالیندرومیک) است. در ساختار اولیه خود، EcoRI حاوی موتیف PD. D/EXK در محل فعال خود، مانند بسیاری از آنزیم‌های محدودکننده دیگر است.
شکل 01: EcoRI
آنزیم محدودکننده EcoRI یک همودایمر 31 کیلو دالتون است. این شامل یک حوزه کروی از معماری α/β است. هر زیرواحد حاوی یک حلقه است که از حوزه کروی بیرون می‌آید و هنگام اتصال به اطراف DNA می‌پیچد. این آنزیم می تواند با توالی که به طور معمول برش می دهد متبلور شود. علاوه بر این، آنزیم محدودکننده EcoRI در طیف گسترده‌ای از تکنیک‌های ژنتیکی مولکولی، از جمله شبیه‌سازی، غربالگری DNA، و بخش‌های حذف DNA در شرایط آزمایشگاهی استفاده می‌شود.
آنزیم های محدودکننده HindIII چیست؟
HindIII یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از گونه های هموفیلوس آنفولانزا جدا شده است. توالی پالیندرومیک DNA AACCTT را در حضور کوفاکتور Mg2+ از طریق هیدرولیز می شکافد.جدا شدن این توالی خاص بین AA'S (5'A↓ACCTT3' و 3'TTCGA↓A5') منجر به برآمدگی 5' روی مولکول DNA به نام انتهای چسبنده می شود. این آنزیم در موجودات پروکاریوتی مانند باکتری ها یافت می شود. باکتری ها از این آنزیم به عنوان مکانیزم دفاعی در برابر ویروس هایی مانند باکتریوفاژها استفاده می کنند.
شکل 02: HindIII
از نظر ساختاری، HindIII یک همودایمر است. این شامل یک هسته ساختاری مشترک شامل چهار ورقه β و یک مارپیچ α منفرد است، مانند سایر انواع آنزیم های محدود کننده II. جرم مولکولی این آنزیم 34.9 کیلو دالتون است. علاوه بر این، HindIII در آزمایش‌های علوم بیولوژیکی مولکولی مدرن مانند توالی‌یابی و نقشه‌برداری DNA بسیار مفید است.
شباهت‌های بین آنزیم‌های محدودکننده EcoRI و HindIII چیست؟
- EcoRI و HindIII دو آنزیم محدودکننده متعلق به گروه آنزیم محدودکننده نوع II هستند.
- EcoRI و HindIII در اوایل دهه 1970 یافت شدند.
- EcoRI و HindIII هر دو حاوی موتیف توالی اسید آمینه PD.. D/EXK هستند.
- هر دو آنزیم محدودکننده برش بسیار خاص DNA را انجام می دهند.
- این آنزیم های محدودکننده به Mg2+ به عنوان یک کوفاکتور برای فعالیت خاص خود نیاز دارند.
- آنها پس از برش DNA انتهای چسبناک تولید می کنند.
- آنها اجزای بسیار مفیدی در تحقیقات بیولوژیکی مولکولی مدرن هستند.
تفاوت بین آنزیم های محدودکننده EcoRI و HindIII چیست؟
EcoRI یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از گونه E.coli جدا شده است، در حالی که HindIII یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از گونه های هموفیلوس آنفولانزا جدا شده است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین EcoRI و HindIII است.علاوه بر این، EcoRI DNA را در توالی شناسایی خاص G↓AATTC برش می دهد، در حالی که HindIII DNA را در توالی شناسایی خاص A↓ACCTT برش می دهد.
اینفوگرافیک زیر تفاوت‌های بین EcoRI و HindIII را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می‌دهد.
خلاصه - EcoRI در مقابل آنزیم های محدودکننده HindIII
EcoRI و HindIII دو آنزیم محدودکننده هستند که به زیر کلاس p نوع II تعلق دارند. آنها برش بسیار خاص DNA را انجام می دهند. EcoRI یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از گونه E.coli جدا شده است، در حالی که HindIII یک آنزیم محدود کننده نوع II است که از گونه های هموفیلوس آنفولانزا جدا شده است. بنابراین، این تفاوت بین EcoRI و HindIII را خلاصه می کند.
