تفاوت اصلی بین Cosmid و Phagemid در نوع توالی‌هایی است که در آن وجود دارد. یک Cosmid حاوی یک سایت cos و یک پلاسمید است. بنابراین، این یک ناقل ترکیبی است در حالی که فاژمید یک پلاسمید است که حاوی منشا F1 همانند سازی فاژ F1 است.
کازمیدها و فاژمیدها برای اهداف شبیه سازی، به ویژه برای شبیه سازی قطعات بزرگتر DNA استفاده می شوند. اینها به طور گسترده ای به ویژه در شبیه سازی ژن های مسئول تولید پروتئین های مختلف استفاده می شوند. کازمیدها و فاژمیدها یا به تنهایی به عنوان پلاسمید تکثیر می شوند یا در ذرات ویروسی بسته بندی می شوند و سپس تکثیر می شوند.
Cosmid چیست؟
A Cosmid که به عنوان یک پلاسمید هیبریدی نامیده می شود، شامل مکان های cos استخراج شده از ذرات فاژ لامبدا و یک پلاسمید است.این مکان‌های cos قطعات بلند DNA با 200 جفت پایه هستند. از این رو، آنها دارای انتهای چسبنده یا چسبنده هستند که به پلاسمید اجازه می دهد تا در DNA ویروسی قرار گیرد. بنابراین، مکان‌های cos برای بسته‌بندی DNA حیاتی هستند.
سه سایت cos وجود دارد؛
- سایت cosN - در بریدن رشته DNA با فعالیت ترمیناز نقش دارد
- سایت cosB – درگیر برگزاری ترمیناز است.
- سایت cosQ - در جلوگیری از تخریب DNA توسط DNaseها نقش دارد.
شکل 01: Cosmid
همچنین، Cosmids می توانند DNA تک رشته ای یا DNA دو رشته ای را با استفاده از یک منشا مناسب برای همانندسازی تکثیر کنند. کازمیدها معمولاً حاوی ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی به عنوان نشانگرهایی برای انتخاب ترانسفورماتورها هستند.بنابراین، استفاده از یک کازمید به عنوان یک ناقل می‌تواند شبیه‌سازی را تسهیل کند و سپس هضم آنزیم محدود کننده ناقل می‌تواند این قطعات را استخراج کند.
فاژمید (فاسمید) چیست؟
Phagemid که به عنوان Phasmid نیز نامیده می شود، نوعی ناقل ترکیبی نیز هست. فاژمید حاوی منشاء خاصی از همانندسازی است که به عنوان مبدا تکرار f1 نامیده می شود. منشا f1 همانندسازی از یک فاژ f1 استخراج می‌شود.
فاژمید می تواند DNA تک رشته ای و دو رشته ای را تکثیر کند. همانندسازی می تواند به صورت پلاسمید در حالی که در حال تکثیر مستقل است انجام شود یا می تواند در ذرات فاژ بسته بندی شود و در نهایت میزبان باکتری E coli را آلوده کند. هنگام آلوده کردن سلول های E coli، فاژ f1 نیاز به حضور پیلوس دارد. از این رو، جنس پیلی در طول بسته بندی آزمایشگاهی فاژمیدها مهم است.
شباهت های بین Cosmid و Phagemid چیست؟
- هر دو Cosmid و Phagemid ناقل های شبیه سازی هستند که در فناوری DNA نوترکیب استفاده می شوند.
- Cosmid و Phagemid می توانند DNA تک رشته ای و دو رشته ای را تکثیر کنند.
- هر دو می توانند همانند پلاسمیدها تحت تکثیر مستقل قرار گیرند.
- Cosmid و Phagemid می توانند در شرایط آزمایشگاهی بسته بندی شوند و سلول های باکتریایی را آلوده کنند.
- هر دو Cosmid و Phagemid برای شبیه‌سازی به منشا مناسبی برای همانندسازی نیاز دارند.
تفاوت بین Cosmid و Phagemid چیست؟
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid یک ناقل ترکیبی است که حاوی یک سایت cos و یک پلاسمید است. | فاژمید یک پلاسمید است که حاوی منشا F1 تکثیر فاژ F1 است. |
| حضور Cos Sites | |
| سایت های Cos در cosmid وجود دارند و برای بسته بندی در شرایط آزمایشگاهی ضروری هستند. | سایت های Cos در فاژمید وجود ندارند. |
| وجود F1 Origin of Replication | |
| در cosmid، منشا fi همانندسازی ممکن است وجود داشته باشد یا نباشد. | منشا تکثیر F1 در فاژمید وجود دارد. |
| وجود ژن های مقاوم به آنتی بیوتیک | |
| ژن‌های مقاوم به آنتی‌بیوتیک در کیهان‌ها برای شناسایی ترانسفورم‌ها از غیر تبدیل‌کننده‌ها وجود دارند. | ژن های مقاوم به آنتی بیوتیک در فاژمیدها وجود ندارند. |
| نیاز به بسته بندی In Vitro | |
| نیاز به سایت cos دارد. | نیاز به پیلوس جنسی دارد. |
خلاصه - Cosmid vs Phagemid
Cosmid و Phagemid ناقل های شبیه سازی هستند که در فناوری DNA نوترکیب استفاده می شوند. Cosmids بردارهای ترکیبی هستند که حاوی انتهای چسبناک خاصی هستند که به عنوان سایت های cos شناخته می شوند. بسته بندی in vitro به این سایت های cos نیاز دارد. در حالی که فاژمیدها پلاسمیدهایی هستند که دارای منشاء همانندسازی f1 هستند که از فاژ f1 استخراج شده است. هم کازمید و هم فاژمید می توانند همانندسازی مستقل یا بسته بندی در شرایط آزمایشگاهی به سلول های باکتریایی انجام دهند. اینها تفاوت های مهم بین کازمید و فاژمید هستند.
