تفاوت اصلی بین NGS و WGS این است که توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) یک فناوری توالی‌یابی نسل دوم موازی است که توان عملیاتی بالا، کم هزینه و سریع است، در حالی که توالی‌یابی کل ژنوم (WGS) یک روش جامع برای تجزیه و تحلیل کل DNA ژنومی یک سلول در یک زمان با استفاده از تکنیک های توالی یابی مانند توالی یابی سنگر، رویکرد شاتگان یا توالی یابی NGS با توان عملیاتی بالا.
در چند دهه اخیر، به دلیل کشف تکنیک های توالی یابی سریع و ابزارهای بیوانفورماتیک، درک ژنوم انسان و سایر حیوانات به شدت افزایش یافته است. تکنیک‌های توالی‌یابی مرسوم مانند توالی‌یابی سانگر محدودیت‌های خود را داشتند، که نیازمند توسعه روش‌های توالی‌یابی سریع جدید مانند توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) و توالی‌یابی نانوحفره بود.تکنیک توالی یابی کل ژنوم (WGS) یک رویکرد جدید است که قبلاً در بسیاری از پروژه های تحقیقاتی ژنومی، مانند پروژه 100000 ژنومی توسط Genomic England، انگلستان استفاده می شود. بنابراین، NGS و WGS دو روش توالی‌یابی هستند که در حال حاضر در بسیاری از پروژه‌های ژنومی گنجانده شده‌اند.
NGS چیست؟
NGS (توالی‌یابی نسل بعدی) یک فناوری توالی‌یابی نسل دوم موازی گسترده است که توان عملیاتی بالا، هزینه کم و سریع دارد. هیچ تعریف دقیقی برای توالی نسل بعدی وجود ندارد. اما ما به وضوح می توانیم آن را از تکنیک های متداول توالی یابی مبتنی بر مویرگی متمایز کنیم. توالی یابی نسل بعدی امکان تعیین توالی یک مولکول DNA با اندازه کلی بزرگتر از 1 میلیون جفت باز را در یک آزمایش واحد فراهم می کند. این سرعت بی‌سابقه و گزینه‌های توان عملیاتی بالا را ارائه می‌دهد، مانند اجازه دادن به توالی‌یابی DNA چند فرد به طور همزمان. این امر با کوچک کردن حجم واکنش های توالی یابی فردی به دست می آید. علاوه بر این، این همچنین اندازه ابزارها را محدود می‌کند و هزینه معرف‌ها در هر واکنش را به حداقل می‌رساند.
شکل 01: سکوهای NGS
NGS یک روش توالی خوانی کوتاه است که قبلاً زمینه تحقیقات بیولوژیکی را متحول کرده است. علاوه بر این، NGS در زمینه‌های مختلفی مانند توالی‌یابی ژنوم de novo، توالی‌یابی کل ژنوم، تجزیه و تحلیل رونویسی، توالی‌یابی RNA کوچک و میکرو RNA، توالی‌یابی مجدد هدفمند و توالی‌یابی کل اگزوم استفاده می‌شود.
WGS چیست؟
WGS (توالی یابی کل ژنوم) یک روش جامع برای تجزیه و تحلیل کل DNA ژنومی یک سلول در یک زمان با استفاده از تکنیک های توالی یابی مانند توالی یابی Sanger، رویکرد شاتگان یا توالی یابی NGS با توان بالا است. همچنین به عنوان توالی ژنوم کامل یا توالی ژنوم کامل نیز شناخته می شود. توالی یابی کل ژنوم مستلزم توالی یابی تمام DNA کروموزومی یک ارگانیسم و همچنین DNA در میتوکندری و برای گیاهان، DNA موجود در کلروپلاست در یک زمان است. WGS دانشمندان را قادر می سازد تا توالی دقیق تمام حروف تشکیل دهنده مجموعه کامل DNA را بخوانند. انتظار می رود WGS با استفاده از پلت فرم NGS انقلابی در راه اندازی بالینی ایجاد کند.
شکل 02: WGS در مقابل توالی تفنگ ساچمهای سلسله مراتبی
توالی یابی کل ژنوم در سال 2014 به مراقبت های بالینی معرفی شد. علاوه بر این، کاربرد WGS شامل توالی یابی ژن در سطح SNP برای مشخص کردن انواع عملکردی در مطالعات مرتبط، مداخله درمانی در پزشکی شخصی، زیست شناسی تکاملی، تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای است. ، مطالعات جهش ها و بازآرایی ها، مطالعات مرتبط با انواع نادر، و پیش بینی حساسیت بیماری و پاسخ دارویی.
شباهت‌های بین NGS و WGS چیست؟
- NGS و WGS دو تکنیک توالی یابی هستند.
- هر دو تکنیک یا DNA یا RNA را توالی یابی می کنند.
- این تکنیک ها جدید و قابل اعتماد هستند.
- هر دو در تشخیص بیماری ها و کشف داروها استفاده می شوند.
تفاوت بین NGS و WGS چیست؟
NGS یک فناوری توالی یابی نسل دوم موازی است که توان عملیاتی بالا، کم هزینه و سریع دارد، در حالی که WGS یک روش جامع برای تجزیه و تحلیل کل DNA ژنومی یک سلول در یک زمان با استفاده از تکنیک های توالی یابی است. به عنوان توالی سنگر، رویکرد تفنگ ساچمه ای یا توالی یابی NGS با توان عملیاتی بالا. بنابراین، این تفاوت اصلی بین NGS و WGS است. علاوه بر این، NGS فقط از روش های توالی یابی نسل دوم تشکیل شده است در حالی که WGS از روش های توالی یابی نسل های اول، دوم و سوم تشکیل شده است.
جدول زیر تفاوت‌های بین NGS و WGS را به شکل جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می‌دهد.
خلاصه - NGS در مقابل WGS
در دهه های گذشته، تکنیک های مختلف توالی یابی به طور معمول در تحقیقات مولکولی معاصر استفاده شده است. و حتی آنها ابزارهای بسیار قدرتمندی برای بسیاری از کاربردهای بالینی هستند. NGS و WGS دو روش توالی‌یابی هستند که در حال حاضر در بسیاری از پروژه‌های ژنومی گنجانده شده‌اند. NGS یک فناوری توالی یابی نسل دوم است که توان عملیاتی بالا، کم هزینه و سریع است. از سوی دیگر، WGS روشی برای تجزیه و تحلیل کل DNA ژنومی یا DNA کامل ژنومی یک سلول در یک زمان واحد با استفاده از تکنیک های توالی یابی مانند توالی یابی سنگر، رویکرد شاتگان یا توالی یابی NGS با توان بالا است. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین NGS و WGS است.
