تفاوت اصلی بین MLVA و MLST در این است که MLVA از چندشکلی توالی‌های DNA به طور پشت سر هم تکرار شده برای مشخص کردن گونه‌های میکروبی استفاده می‌کند، در حالی که MLST از چندشکلی توالی‌های DNA قطعات داخلی چندین ژن خانه‌دار برای مشخص کردن گونه‌های میکروبی استفاده می‌کند.
تایپ میکروبی معمولاً برای تعیین منبع و مسیرهای عفونت استفاده می شود. شیوع بیماری را تایید یا رد می کند. تایپ میکروبی همچنین انتقال متقاطع پاتوژن های مرتبط با مراقبت های بهداشتی را ردیابی می کند و سویه های خطرناک را تشخیص می دهد. علاوه بر این، تایپ میکروبی اثربخشی اقدامات کنترل گونه‌های میکروبی بیماری‌زا را ارزیابی می‌کند. MLVA و MLST دو تکنیک بیولوژیکی مولکولی هستند که در تایپ میکروبی استفاده می‌شوند.
MLVA چیست؟
تجزیه و تحلیل VNTR جایگاه چندگانه (MLVA) یک روش بیولوژیکی مولکولی است که از پلی مورفیسم توالی های DNA به طور پشت سر هم تکرار شده برای مشخص کردن گونه های میکروبی استفاده می کند. این روشی است که برای آنالیز ژنتیکی گونه‌های میکروبی خاص استفاده می‌شود.
در طول اولین مرحله MLVA، هر جایگاه VNTR هدفمند با PCR با پرایمرهای خاص ناحیه جانبی تقویت می شود. سپس قطعات به‌دست‌آمده با الکتروفورز روی یک ترتیب‌دهنده مویرگی اندازه‌گیری می‌شوند. ژنوتیپ کردن هر مکان و نتایج گردآوری شده از هر نمونه امکان شناسایی یک میکروارگانیسم را که گونه های آن شناخته شده است را فراهم می کند. همچنین امکان شناسایی زیرگونه از طریق تایپ آللی و مقایسه با پایگاه های داده MLVA را فراهم می کند.
شکل 01: MLVA
این روش MLVA انتخابی تر از روش MLST است. علاوه بر این، روش MLVA نیازی به مرحله تعیین توالی DNA ندارد. بنابراین، تمایز زیرگونه‌های نزدیک یا گونه‌های کلونال را ممکن می‌سازد.
MLST چیست؟
تایپ توالی چند لوکوس (MLST) تکنیکی است که از چندشکلی توالی‌های DNA قطعات داخلی چندین ژن خانه‌دار برای مشخص کردن گونه‌های میکروبی استفاده می‌کند. MLST یک تکنیک در آنالیز ژنتیکی برای تایپ کردن مکان های متعدد است.
شکل 02: MLST
این نوعی از تایپ توالی است که به عنوان یک تکنیک مرجع برای تشخیص گونه های مختلف گونه های میکروبی استفاده می شود. این روش مبتنی بر توالی یابی ژن های خانه داری است.ژن های خانه داری معمولاً پروتئین های ضروری عوامل میکروبی مانند یک باکتری را رمزگذاری می کنند. این توالی از ژن های خانه داری دارای ویژگی خاصی هستند که در طول زمان یک پلی مورفیسم پایدار ارائه می دهند. بنابراین، تفاوت در توالی ژن های خانه دار به اندازه کافی برای تشخیص سویه ها از یکدیگر کافی است. علاوه بر این، اولین طرح MLST که توسعه یافت نایسریا مننژیتیدیس، عامل ایجاد کننده مننژیت مننگوکوکی و سپتی سمی بود. از زمان معرفی، MLST نه تنها برای پاتوژن های انسانی بلکه برای پاتوژن های گیاهی نیز استفاده شده است.
شباهت‌های بین MLVA و MLST چیست؟
- MLVA و MLST دو تکنیک بیولوژیکی مولکولی هستند که در تایپ میکروبی استفاده می شوند.
- هر دو تکنیک را می توان برای تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک میکروبی استفاده کرد.
- هر دو تکنیک مبتنی بر چندشکلی ژنتیکی هستند.
- آنها را می توان برای تشخیص بیماری های انسانی ایجاد کننده پاتوژن های میکروبی استفاده کرد.
- هر دو تکنیک باید توسط زیست شناسان مولکولی ماهر انجام شود.
تفاوت بین MLVA و MLST چیست؟
MLVA تکنیکی است که از پلی مورفیسم توالی های DNA به طور پشت سر هم تکرار شده برای مشخص کردن گونه های میکروبی استفاده می کند. در همین حال، MLST تکنیکی است که از پلی‌مورفیسم توالی‌های DNA قطعات داخلی ژن‌های چندگانه خانه‌دار برای مشخص کردن گونه‌های میکروبی استفاده می‌کند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین MLVA و MLST است. علاوه بر این، روش MLVA انتخابی تر از روش MLST است.
اینفوگرافیک زیر تفاوت‌های بین MLVA و MLST را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می‌دهد.
خلاصه - MLVA در مقابل MLST
MLVA و MLST دو تکنیک بیولوژیکی مولکولی هستند که در تایپ میکروبی استفاده می شوند. MLVA از پلی‌مورفیسم توالی‌های DNA به طور پشت سر هم تکرار شده برای مشخص کردن گونه‌های میکروبی استفاده می‌کند، در حالی که MLST از پلی‌مورفیسم توالی‌های DNA قطعات داخلی ژن‌های چندگانه خانه‌داری برای توصیف گونه‌های میکروبی استفاده می‌کند.بنابراین، این تفاوت اصلی بین MLVA و MLST است.
