تفاوت بین بنزوناز و DNase

2024 نویسنده: Alex Aldridge | [email protected]. آخرین اصلاح شده: 2023-12-17 13:37

تفاوت کلیدی – بنزوناز در مقابل DNase

تجزیه اسیدهای نوکلئیک برای بسیاری از تکنیک های زیست شناسی مولکولی مهم است. این به طور گسترده ای در فناوری DNA نوترکیب برای خلاص شدن از شر قطعات ناخواسته DNA و RNA استفاده می شود. آنزیم های تجزیه کننده اسید نوکلئیک به عنوان نوکلئاز شناخته می شوند و بر اساس عملکرد مورد نیاز می توانند انواع مختلفی داشته باشند. نوکلئازهایی که DNA را تجزیه می کنند به عنوان DNase شناخته می شوند در حالی که آنهایی که RNA را تجزیه می کنند RNase شناخته می شوند. این آنزیم ها بیشتر در آزمایش های آزمایشگاهی استفاده می شوند که در آن آزمایش های مولکولی آزمایشگاهی برای جداسازی DNA، RNA یا پروتئین های خالص انجام می شود. بنزونازها نوعی نوکلئاز هستند که هم DNA و هم RNA را تجزیه می کنند در حالی که DNase ها فقط DNA را تجزیه می کنند.این تفاوت اصلی بین Benzonase و DNase است.

بنزوناز چیست؟

بنزوناز یک اندونوکلئاز دستکاری شده ژنتیکی از Serratia marcescens است. این آنزیم در مقیاس صنعتی در میزبان های E. coli تولید می شود. بنزوناز قادر به جداسازی DNA دو رشته ای، DNA خطی، DNA حلقوی و RNA تک رشته ای است. بنابراین بنزوناز از نظر تجاری مهم است. آنزیم بنزوناز یک دایمر پروتئینی است که دارای 245 اسید آمینه یکسان، 30 کیلو دالتون زیر واحد با دو پیوند دی سولفید ضروری است. بنزوناز اسیدهای نوکلئیک را در انتهای 5 دقیقه خود می شکافد و باعث ایجاد قطعاتی با انتهای 5 آزاد می شود. بنزوناز می تواند اسیدهای نوکلئیک را در هر دنباله ای جدا کند اما مناطق غنی از GC را ترجیح می دهد.

بنزوناز در -20 ^{0C ذخیره می شود. pH بهینه برای فعالیت آنزیم 8.0 تا 9.2 است. کاربردهای بنزوناز شامل آماده سازی نمونه برای الکتروفورز ژل دو بعدی پروتئین است که در آن بنزوناز اسیدهای نوکلئیک متصل شده را حذف می کند و آلاینده های اسید نوکلئیک را از آماده سازی های پروتئین نوترکیب حذف می کند.همچنین برای کاهش ویسکوزیته عصاره های پروتئینی و جلوگیری از تجمع سلول ها در یک مخلوط سلولی استفاده می شود.}

DNase چیست؟

DNase یک نوکلئاز، آنزیم هیدرولیتیک است که فقط قادر به بریدن DNA دو رشته ای است. دو نوع اصلی از DNase وجود دارد: DNase I و DNase II. DNase I در شکاف DNA دو رشته ای برای تولید پلی نوکلئوتیدهایی با انتهای آزاد 5 شرکت می کند. DNase II در جدا کردن DNA دو رشته‌ای برای تولید رشته‌های پلی نوکلئوتیدی با انتهای آزاد یا برآمدگی ۳ اینچ نقش دارد.

DNase I

DNase I در pH بهینه بین ۷.۰ تا ۸.۰ عمل می کند. فعالیت آنزیم به بسیاری از کوفاکتورهای یونی بستگی دارد که عبارتند از: Ca²⁺، Mg²⁺ یا Mn^{2+.فعالیت Mg}2+ ^{و Mn}2+ ^{عملکرد DNase I را تعیین می کند. در حضور Mg} 2+^{، DNase I هر رشته dsDNA را به طور مستقل جدا می کند. این به صورت تصادفی انجام می شود. در مقابل، در حضور Mn}2+، ^{آنزیم هر دو رشته DNA را تقریباً در یک مکان می شکافد.این شکاف منجر به تولید دو نوع قطعه DNA می شود. یک نوع با انتهای صاف و نوع دیگر با یک یا دو نوکلئوتید.}

شکل 02: DNase

DNase II

DNase II در pH بهینه 4.5-5.0 عمل می کند و یون های فلزی دو ظرفیتی برای فعالیت آن مورد نیاز است، مشابه DNase I. مکانیسم DNase II از سه مرحله اصلی شناخته شده است.

1. شکستگی های تک رشته ای چندگانه در ستون فقرات DNA القا می شود.
2. نوکلئوتیدها و الیگونوکلئوتیدهای محلول در اسید تولید می شوند.
3. تغییر غیرخطی هایپرکرومیک در آخرین مرحله رخ می دهد.

مهارکننده‌های اصلی آنزیم DNase شامل شل‌کننده‌های فلزی، فلزات واسطه و مواد شیمیایی مانند سدیم دودسیل سولفات و β – مرکاپتواتانول هستند.

کاربردهای اصلی DNase شامل تهیه عصاره‌های RNA و عصاره‌های پروتئینی بدون DNA و حذف DNA الگو در طول آزمایش‌های رونویسی در شرایط آزمایشگاهی است.

شباهت‌های بین بنزوناز و DNase چیست؟

• هر دو آنزیم هیدرولیتیک هستند.
• هر دو هسته هستند.
• هر دو با شکستن پیوندهای فسفودی استر اسیدهای نوکلئیک شرکت می کنند.
• هر دو برای حفظ فعالیت آنزیم به pH و دمای نگهداری بهینه نیاز دارند.
• مهارکننده‌های آنزیم‌ها شامل عوامل کیلیت‌کننده، فلزات واسطه و مواد شیمیایی شوینده هستند.
• کاربردها عمدتاً بر به دست آوردن عصاره با خلوص بالا از DNA، RNA و پروتئین ها متمرکز هستند.
• هر دو آنزیم را می توان از طریق مهندسی ژنتیک تولید کرد.

تفاوت بین بنزوناز و DNase چیست؟

بنزوناز در مقابل DNase
بنزوناز آنزیمی است که قادر به بریدن DNA دو رشته ای، DNA خطی، DNA حلقوی و RNA است.	DNase آنزیمی است که قادر به بریدن DNA دو رشته ای است.
سوبسترا برای آنزیم
هم DNA و هم RNA سوبستراهای بنزوناز هستند.	DNA بستر DNase است.
ساختار
محدوده pH بهینه بنزوناز 7.0 -8.0 است.	محدوده pH بهینه DNase I 7.0 - 8.0 و DNase II 4.5 - 5.0 است.

خلاصه - بنزوناز در مقابل DNase

آنزیم های نوکلئاز به طور گسترده در روش های تجربی مختلف با توجه به زیست شناسی مولکولی و مهندسی ژنتیک استفاده می شود.بنزوناز و DNase دو نوع نوکلئاز هستند. بنزوناز در تجزیه DNA و RNA نقش دارد در حالی که DNase در برش DNA دو رشته ای نقش دارد. این تفاوت اساسی بین بنزوناز و DNase است. در حال حاضر، هر دو نوع نوکلئاز از طریق فناوری DNA نوترکیب تولید می‌شوند که آنزیم‌هایی با کیفیت بالاتر تولید می‌کنند که برای حداکثر تولید بهینه شده‌اند.

دانلود نسخه PDF Benzonase vs DNase

می توانید نسخه PDF این مقاله را دانلود کنید و طبق یادداشت نقل قول برای اهداف آفلاین از آن استفاده کنید. لطفاً نسخه PDF را از اینجا دانلود کنید تفاوت بین بنزوناز و DNase