تفاوت کلیدی – VNTR در مقابل STR
مطالعات DNA در درک و تعیین روابط فیلوژنتیکی، تشخیص بیماری های ژنتیکی و نقشه برداری از ژنوم ارگانیسم ها مفید است. چندین تکنیک مرتبط با آنالیز DNA برای شناسایی یک ژن خاص یا یک توالی DNA در مخزن DNA ناشناخته استفاده می شود. آنها به عنوان نشانگرهای ژنتیکی شناخته می شوند. نشانگرهای ژنتیکی در زیست شناسی مولکولی برای شناسایی تنوع ژنتیکی بین افراد و گونه ها استفاده می شود. تکرار پشت سر هم اعداد متغیر (VNTR) و تکرار پشت سر هم کوتاه (STR) دو نوع نشانگر ژنتیکی هستند که پلی مورفیسم را در بین افراد نشان می دهند. هر دو نوع DNA تکراری غیر کد کننده هستند که تکرارهای پشت سر هم هستند.آنها در کروموزوم ها به صورت سر تا دم چیده شده اند. VNTR بخشی از ژنوم است که در آن توالی نوکلئوتیدی کوتاه چندین بار تکرار می شود. STR بخش دیگری از DNA در ژنوم است که به صورت واحدهای تکرار شونده متشکل از دو تا سیزده نوکلئوتید در صد بار سازماندهی شده است. تفاوت اصلی بین VNTR و STR تعداد نوکلئوتیدها در یک توالی تکرار شونده است. واحدهای تکرار شونده VNTR شامل 10 تا 100 نوکلئوتید است در حالی که واحد تکرار شونده STR از 2 تا 13 نوکلئوتید تشکیل شده است. VNTR و STR به طور گسترده در مطالعات پزشکی قانونی استفاده می شوند.
VNTR چیست؟
تکرار پشت سر هم توالی کوتاهی از DNA است که به صورت سر تا دم در یک مکان کروموزومی خاص تکرار می شود. هیچ توالی یا نوکلئوتید دیگری در تکرار پشت سر هم وجود ندارد. چندین نوع تکرار پشت سر هم در ژنوم وجود دارد. VNTR نوعی تکرار پشت سر هم در میان آنهاست که دارای واحدهای تکرار شونده شامل 10 تا 100 نوکلئوتید است. VNTR نوعی ماهواره کوچک است. این تکرارهای پشت سر هم در بسیاری از کروموزوم ها یافت می شوند.آنها در ژنوم انسان پراکنده شده اند و عمدتاً در نواحی زیر تلومر کروموزوم ها قرار دارند.
VNTR ها پلی مورفیسم تکرار پشت سر هم را در بین افراد نشان می دهند. طول VNTR در یک مکان خاص از کروموزوم در بین افراد به دلیل تنوع در تعداد واحدهای تکراری سازماندهی شده در آن بخش DNA بسیار متغیر است. بنابراین، VNTR می تواند به عنوان یک ابزار قدرتمند در شناسایی افراد مورد استفاده قرار گیرد و تجزیه و تحلیل VNTR در بسیاری از زمینه ها از جمله ژنتیک، تحقیقات زیست شناسی، پزشکی قانونی و انگشت نگاری DNA مورد استفاده قرار می گیرد. VNTRها اولین نشانگرهای ژنتیکی بودند که برای تعیین کمیت پیوند مغز استخوان مورد استفاده قرار گرفتند. VNTRها همچنین اولین نشانگرهای چندشکل مورد استفاده در پروفایل DNA در پزشکی قانونی بودند.
شکل 01: تنوع VNTR در شش فرد
تجزیه و تحلیل VNTR از طریق پلی مورفیسم طول قطعه محدود و به دنبال هیبریداسیون جنوبی انجام می شود. از این رو، به یک نمونه DNA نسبتاً بزرگ نیاز دارد. تفسیر پروفایل VNTR نیز مشکل ساز است. به دلیل این محدودیت ها، استفاده از VNTR در ژنتیک قانونی محدود شده است و آنالیز STR جایگزین آن شده است.
STR چیست؟
STR یک بخش DNA بسیار تکراری است که از دو تا سیزده واحد تکرار کننده نوکلئوتیدی تشکیل شده است که به صورت پشت سر هم سازماندهی شده اند. STR مشابه VNTR است. اما از VNTR از تعداد نوکلئوتیدها در یک توالی تکرار شونده و تعداد تکرارها متفاوت است. STR نوعی ریزماهواره است.
تحلیل STR در اندازه گیری تعداد دقیق واحدهای تکراری نقش دارد. STRها در بین افراد بسیار متغیر هستند، مشابه VNTها. پروفایل های STR از فردی به فرد دیگر متفاوت است. بنابراین، تجزیه و تحلیل STR در زیست شناسی مولکولی برای مقایسه جایگاه های خاص روی DNA از دو یا چند نمونه استفاده می شود. از این رو STRها به عنوان نشانگرهای ژنتیکی قدرتمند در زیست شناسی مولکولی در نظر گرفته می شوند.این یک ابزار عالی برای شناسایی افراد به دلیل درجه پلی مورفیسم بالا و طول نسبتا کوتاه آنها است.
در حال حاضر، STR ها متداول ترین ابزار تجزیه و تحلیل چند شکلی ژنتیکی در ژنتیک قانونی هستند. بیشتر موارد پزشکی قانونی شامل تجزیه و تحلیل چند شکلی STR است. جایگاه های STR در سراسر ژنوم پخش شده اند. هزاران STR در کروموزوم ها قرار دارند که می توانند در تجزیه و تحلیل پزشکی قانونی استفاده شوند. تجزیه و تحلیل STR مانند تجزیه و تحلیل VNTR شامل پلی مورفیسم طول محدود نمی شود. تجزیه و تحلیل STR DNA را با آنزیم های محدود کننده قطع نمی کند. پروب های خاصی برای اتصال نواحی مورد نظر بر روی DNA استفاده می شود و با استفاده از تکنیک PCR، طول STR تعیین می شود.
شکل 02: تنوع STR بین نمونه ها
شباهت‌های VNTR و STR چیست؟
- VNTR و STR DNA غیر کدکننده هستند.
- هر دو تکرار پشت سر هم هستند.
- هر دو به دلیل تفاوت در طول بخش DNA، چندشکلی را در بین افراد نشان می دهند.
- هر دو به عنوان نشانگرهای ژنتیکی قدرتمند در چاپ انگشت DNA و مطالعات پزشکی قانونی استفاده می شوند.
تفاوت بین VNTR و STR چیست؟
VNTR در مقابل STR |
|
| VNTR یک DNA تکراری غیرکدکننده است که دارای یک توالی نوکلئوتیدی کوتاه است که به صورت پشت سر هم تکرار می شود. | STR یک بخش DNA بسیار تکراری است که از دو تا سیزده واحد تکرار شونده نوکلئوتیدی تشکیل شده است که به صورت پشت سر هم سازماندهی شده اند. |
| سایز | |
| VNTR بزرگتر از STR است. | STRها کوچکتر از VNTRها هستند. |
| تعداد نوکلئوتیدها در توالی تکراری | |
| واحد تکرار شونده VNTR از 10 تا 100 نوکلئوتید تشکیل شده است. | واحد تکرار شونده STR از 2 تا 13 نوکلئوتید تشکیل شده است. |
خلاصه – VNTR در مقابل STR
VNTR و STR دو نشانگر ژنتیکی قدرتمندی هستند که در زیست شناسی مولکولی، به ویژه در زمینه ژنتیک قانونی مورد استفاده قرار می گیرند. VNTR یک نوع مینی ماهواره و STR یک ریزماهواره است. VNTR و STR DNA غیر کد کننده و بسیار تکراری هستند. آنها تکرارهای پشت سر هم هستند. ساختار کلی VNTR و STR یکسان است. با این حال، تعداد نوکلئوتیدها در توالی تکرار شونده و طول آن متفاوت است. VNTR دارای توالی های تکرار شونده از 10 تا 100 نوکلئوتید است. STR دارای توالی های تکرار شونده متشکل از 2 تا 13 نوکلئوتید است. این تفاوت بین VNTR و STR است.
دانلود نسخه PDF VNTR در مقابل STR
می توانید نسخه PDF این مقاله را دانلود کنید و طبق یادداشت های نقل قول برای اهداف آفلاین از آن استفاده کنید. لطفاً نسخه PDF را از اینجا دانلود کنید تفاوت بین VNTR و STR.
