تفاوت کلیدی بین VNTR و کاوشگر این است که VNTR یک توالی نوکلئوتیدی کوتاه است که به صورت تکرار پشت سر هم در ژنوم رخ می دهد در حالی که یک کاوشگر یک توالی کوتاه مصنوعی از DNA یا RNA است که می تواند به صورت رادیواکتیو نشاندار شود.
VNTR مخفف تکرار پشت سر هم اعداد متغیر است. این یک توالی نوکلئوتیدی کوتاه است که در تکرارهای پشت سر هم در ژنوم سازماندهی شده است. VNTR ها به طور طبیعی در ژنوم ما وجود دارند. پروب یک توالی DNA یا RNA کوتاه سنتز شده مصنوعی است. هر دو پروب و VNTR اسیدهای نوکلئیک یا توالی نوکلئوتیدی کوتاه هستند. آنها در تکنیک های مختلف بیولوژیکی مولکولی، به طور عمده در مطالعات پزشکی قانونی، استفاده بسیار زیادی دارند. VNTR و کاوشگر شباهتها و همچنین تفاوتهایی دارند. از این رو، مقاله تلاش می کند تا تفاوت بین VNTR و probe را برجسته کند.
VNTR چیست؟
VNTR یک توالی نوکلئوتیدی کوتاه است که به صورت تکرار پشت سر هم در ژنوم ما وجود دارد. VNTR ها در بسیاری از کروموزوم ها وجود دارند. علاوه بر این، VNTRها در بین افراد مختلف از نظر طول متفاوت هستند زیرا تعداد تکرارها در VNTR افراد مختلف متفاوت است. اساساً به دلیل آلل های به ارث رسیده از والدین آنها است. بنابراین، ما عمدتاً از VNTR ها برای شناسایی والدین (ارث) یا برای اهداف شخصی استفاده می کنیم. به طور مشابه، امکان استفاده از آنها در ژنتیک، پزشکی قانونی، تحقیقات بیولوژیکی و انگشت نگاری DNA نیز وجود دارد. بنابراین، VNTR یک ابزار مهم در زیست شناسی مولکولی است.
شکل 01: VNTR
در وراثت، ما داده های VNTR را با استفاده از دو اصل اساسی تجزیه و تحلیل می کنیم: تطبیق وراثت و تطبیق هویت. در طول تطابق وراثت، فرد باید یک آلل تطبیق با آلل هر یک از والدین داشته باشد. در طول تطابق هویت، هر دو آلل VNTR باید در مکان خاصی از ژنوم وجود داشته باشند.
کاوشگر چیست؟
در زمینه زیست شناسی مولکولی، کاوشگر یک قطعه DNA یا RNA مصنوعی سنتز شده با طول 100 تا 1000 باز است. ما می توانیم این کاوشگرها را به صورت رادیواکتیو برچسب گذاری کنیم. از این رو، ما از آنها در تشخیص توالی های نوکلئوتیدی هدف که مکمل توالی کاوشگر هستند استفاده می کنیم. هنگامی که ما پروب ها را به نمونه اضافه می کنیم، هیبریداسیون با توالی های مکمل یا دنباله های هدف انجام می شود و شناسایی توالی های هدف را برای ما آسان می کند. از آنجایی که کاوشگرها دارای رادیواکتیویته هستند، ما می توانیم آنها را به راحتی تشخیص دهیم.
شکل 02: کاوشگر
در علم پزشکی قانونی، ما معمولاً از کاوشگرها در تکنیک های پروفایل DNA مانند تشخیص نواحی تکراری کوتاه پشت سر هم، پلی مورفیسم های طول قطعه محدود و انگشت نگاری DNA استفاده می کنیم.
شباهتهای VNTR و Probe چیست؟
- اسیدهای نوکلئیک بلوک های سازنده VNTR و Probe هستند.
- ما از آنها در فرآیندهای شناسایی ژن استفاده می کنیم.
- همچنین، هر دو طول آنها متغیر است.
- آنها ابزار مهمی در مطالعات پزشکی قانونی، انگشت نگاری DNA، ژنتیک و غیره هستند.
تفاوت بین VNTR و Probe چیست؟
VNTR ناحیه ای از ژنوم است که به صورت تکرارهای پشت سر هم سازماندهی شده است در حالی که یک پروب یک توالی DNA یا RNA کوتاه است که به طور مصنوعی به منظور تشخیص توالی های هدف در یک نمونه سنتز شده است. بنابراین، این تفاوت اصلی بین VNTR و پروب است. همچنین، یک تفاوت مهم بین VNTR و کاوشگر این است که بر خلاف VNTR ها، ما می توانیم پروب ها را به صورت رادیواکتیو برچسب گذاری کنیم.
علاوه بر این، VNTR ها عمدتاً شناسایی والدین را انجام می دهند در حالی که پروب ها به شناسایی توالی های نوکلئوتیدی هدف در نمونه های DNA یا RNA که مکمل توالی کاوشگر هستند کمک می کنند. از این رو، این نیز یک تفاوت قابل توجه بین VNTR و پروب است.
اینفوگرافیک زیر اطلاعات بیشتری در مورد تفاوت بین VNTR و کاوشگر ارائه می دهد.
خلاصه – VNTR در مقابل Probe
کاربرد رایج VNTR و پروب در تکنیک های آنالیز مولکولی مانند مطالعات پزشکی قانونی و انگشت نگاری DNA است. هر دو از طول های متغیر تشکیل شده اند. با این حال، تفاوت کلیدی بین VNTR و کاوشگر این است که یک VNTR ناحیه ای از ژنوم است که با تکرارهای پشت سر هم مرتب شده است در حالی که یک پروب قطعه ای از DNA یا RNA است که می تواند به صورت رادیواکتیو نشاندار شود. علاوه بر این، VNTR ها در ژنوم وجود دارند. اما، پروب ها به طور مصنوعی سنتز می شوند و می توانند به صورت رادیواکتیو برچسب گذاری شوند تا توالی های نوکلئوتیدی هدف را در نمونه های DNA یا RNA که مکمل توالی موجود در کاوشگر هستند، شناسایی کنند. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین VNTR و پروب است.