تفاوت اصلی بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید این است که جداسازی DNA ژنومی استخراج DNA ژنومی را هدف قرار می دهد در حالی که جداسازی DNA پلاسمید استخراج DNA پلاسمید باکتری را هدف قرار می دهد.
جداسازی DNA یک فرآیند شیمیایی است که برای جداسازی DNA از گونه های مختلف یا از نمونه های مختلف استفاده می شود. جداسازی DNA در تکنیک‌های زیست‌شناسی مولکولی پایین‌دست، مانند الکتروفورز ژل، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز و تکنیک‌های توالی‌یابی DNA، مهم است. بنابراین، جداسازی DNA یک فرآیند شیمیایی ضروری در مطالعات بیولوژیکی مولکولی است. بر اساس هدف تحقیق، گاهی اوقات نیاز به جداسازی DNA ژنومی است.علاوه بر این، برخی از مطالعات بر جداسازی DNA پلاسمید از باکتری ها تمرکز دارند. جداسازی DNA ژنومی فرآیند جداسازی DNA ژنومی از نمونه پروکاریوتی یا یوکاریوتی است. مراحل جداسازی بسته به نوع سلولی که DNA در آن جداسازی می شود متفاوت است. جداسازی پلاسمید DNA فرآیند جداسازی DNA پلاسمید از یک سلول باکتری است. در مقایسه با جداسازی DNA ژنومی، فرآیند کلی در جداسازی DNA پلاسمید پیچیده است.
جداسازی DNA ژنومی چیست؟
جداسازی DNA ژنومی فرآیند استخراج DNA ژنومی کامل یک موجود زنده است. این فرآیند خاص شامل سه رویداد اصلی است. آنها عبارتند از لیز سلولی یا لیز هسته ای، تجزیه پروتئین یا پروتئولیز و رسوب DNA ژنومی. مرحله لیز ممکن است بسته به نوع سلول متفاوت باشد. در پروکاریوت ها، از آنجایی که دیواره سلولی پپتیدوگلیکان وجود دارد، اولین قدم باید تجزیه دیواره سلولی باشد. از سوی دیگر، در یوکاریوت ها، مرحله لیز شامل تجزیه غشای پلاسمایی و غشای هسته ای برای خارج کردن DNA به بیرون است.در مقابل، مراحل خاصی برای لیز کردن دیواره سلولی گیاه و قارچ ضروری است.
شکل 01: جداسازی DNA ژنومی
در نتیجه، هنگامی که مرحله لیز کامل شد، در نهایت DNA به مایع رویی می آید. به طور همزمان، تجزیه پروتئین نیز در محلول به دلیل افزودن پروتئیناز K انجام می شود. مرحله بعدی جداسازی DNA ژنومی و پروتئین های تجزیه شده از یکدیگر است. از این رو، پروتئین های تخریب شده با رسوب جدا می شوند و به DNA ژنومی اجازه می دهند در مایع رویی باقی بماند. پس از رسوب گیری پروتئین ها، DNA ژنومی را می توان رسوب داد و مجدداً در یک بافر مناسب معلق کرد تا زمانی که برای آزمایش نیاز باشد.
DNA ژنومی که یک DNA خطی است حاوی تمام اطلاعات ژنتیکی یک موجود زنده است.به عبارت دیگر، ژنوم ماده وراثتی یک موجود زنده است که مسئول تمام فعالیت های ساختاری و عملکردی سلول است. از هر دو توالی DNA کد کننده و غیر کد کننده تشکیل شده است. هنگام جداسازی DNA ژنومی، کل ژنوم ارگانیسم را شامل می شود.
جداسازی DNA پلاسمید چیست؟
جداسازی DNA پلاسمید یک فرآیند خاص و پیچیده تر جداسازی DNA است. پلاسمیدها DNA خارج کروموزومی هستند که در اکثر سلول های باکتریایی وجود دارند. آنها DNA حلقوی غیرفعال هستند که از باکتری ها برای زنده ماندن در شرایط محیطی سخت حمایت می کنند. DNA پلاسمید متشکل از ژن‌های مقاوم خاصی است که مزایای بیشتری مانند مقاومت آنتی‌بیوتیکی، خواص حدت‌زایی و خواص سمی برای باکتری‌ها فراهم می‌کند.
شکل 02: جداسازی DNA پلاسمید
جداسازی DNA پلاسمید همچنین شامل سه فرآیند اصلی است. لیز سلولی، پروتئینولیز و رسوب DNA. اگرچه مکانیسم بیوشیمیایی جداسازی شبیه به جداسازی DNA ژنومی است، این فرآیند پیچیده تر از آن است. فرآیند لیز سلولی مهمترین فرآیند در این روش است. مهمتر از همه، DNA ژنومی و DNA پلاسمید نباید با یکدیگر مخلوط شوند. بنابراین، فرآیند لیز بسیار خفیف‌تر در فرآیند جداسازی DNA پلاسمید گنجانده می‌شود. از این رو، در اکثر روش های جداسازی DNA پلاسمید از مواد شوینده استفاده می شود. سدیم دودسیل سولفات برای لیز سلولی.
شباهت‌های بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید چیست؟
- DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید بر استخراج DNA ارگانیسم تمرکز دارد.
- همچنین، هر دو فرآیند کلی یکسانی را دنبال می کنند که شامل لیز سلولی، تخریب پروتئین و رسوب DNA می شود.
- علاوه بر این، DNA حاصل از هر دو فرآیند برای فرآیندهای پایین دست مهم است.
- علاوه بر این، هر دو فرآیند جداسازی شامل مراحل خالص‌سازی و ذخیره‌سازی DNA در شرایط ذخیره‌سازی مشخص می‌شوند.
- علاوه بر این، پروتئیناز K در هر دو روش برای تجزیه پروتئین ها استفاده می شود.
تفاوت بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید چیست؟
جداسازی DNA ژنومی بر استخراج کل DNA ژنومی ارگانیسم هدف متمرکز است در حالی که جداسازی DNA پلاسمیدی بر جداسازی DNA پلاسمید از گونه های خاص باکتری متمرکز است. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید است. علاوه بر این، تفاوت دیگر بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید در روش است. جداسازی DNA ژنومی در مقایسه با جداسازی DNA پلاسمید، فرآیند پیچیده تری است. از این رو، هنگام جداسازی DNA پلاسمید، لازم است اقدامات احتیاطی برای جلوگیری از اختلاط DNA ژنومی و پلاسمید با یکدیگر انجام شود.
اطلاعات زیر جزئیات بیشتری در مورد تفاوت بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید ارائه می دهد.
خلاصه - DNA ژنومی در مقابل جداسازی DNA پلاسمید
جداسازی DNA یک فرآیند مهم در تکنیک های زیست شناسی مولکولی است. دو نوع DNA وجود دارد که عبارتند از DNA ژنومی و DNA پلاسمید (DNA خارج کروموزومی). بر اساس نیاز، برخی از روش‌ها برای جداسازی DNA ژنومی انجام می‌شوند در حالی که برخی از رویه‌ها بر جداسازی تنها DNA پلاسمید از باکتری متمرکز هستند. از این رو، مراحل درگیر در هر دو فرآیند کمی با یکدیگر متفاوت است. با این حال، روند کلی در هر دو جداسازی یکسان است. DNA جدا شده از هر دو فرآیند در فرآیندهای پایین دستی مانند شبیه سازی، الکتروفورز ژل و واکنش های زنجیره ای پلیمراز کاربرد زیادی دارد.در پایان پروتکل جداسازی DNA ژنومی، کل DNA ژنومی ارگانیسم را می توان به عنوان محصول نهایی جدا کرد در حالی که در پایان پروتکل جداسازی DNA پلاسمید، DNA پلاسمید باکتری مربوطه را می توان به عنوان محصول نهایی جدا کرد. بنابراین، این تفاوت بین DNA ژنومی و جداسازی DNA پلاسمید است.
