تفاوت کلیدی بین شباهت و هویت در هم‌ترازی دنباله این است که شباهت شباهت (شباهت) بین دو دنباله در مقایسه است در حالی که هویت تعداد کاراکترهایی است که دقیقاً بین دو دنباله متفاوت مطابقت دارند.
بیوانفورماتیک یک رشته علمی میان رشته ای است که عمدتاً شامل زیست شناسی مولکولی و ژنتیک، علوم کامپیوتر، ریاضیات و آمار است. تراز توالی یک اصطلاح اصلی در بیوانفورماتیک است. این روشی است که در آن توالی‌های DNA، RNA یا پروتئین مرتب می‌شوند تا مناطق شباهت را شناسایی کنند که نتیجه رابطه عملکردی، ساختاری یا تکاملی بین توالی‌ها است.در پایان تراز، آنها به عنوان ردیف در یک ماتریس ارائه می شوند. به منظور تراز کردن کاراکترهای یکسان در ستون های متوالی، شکاف های درج شده بین باقی مانده ها وجود دارد.
شباهت چیست؟
شباهت در تراز توالی شباهت بین دو دنباله هنگام مقایسه است. این واقعیت به هویت سکانس ها بستگی دارد. شباهت میزان همسویی باقیمانده ها را نشان می دهد. از این رو، توالی های مشابه دارای خواص مشابهی هستند. در بیوانفورماتیک، شباهت ابزاری برای ارزیابی شباهت بین دو پروتئین است.
شکل 01: شباهت در چینش دنباله
دو مرحله اصلی برای فرآیند هم ترازی توالی وجود دارد. مرحله اولیه تراز زوجی است که با استفاده از الگوریتم هایی مانند BLAST، FastA و LALIGN به یافتن تراز بهینه بین دو دنباله (از جمله شکاف ها) کمک می کند.الگوریتم تطبیق حداقل تعداد عملیات ویرایش را پیدا می کند. in-dels و جایگزینی به منظور تراز کردن یک دنباله با دنباله دیگر. پس از تراز جفتی، لازم است دو پارامتر کمی از هر مقایسه زوجی بدست آید. آنها هویت و شباهت هستند.
هویت چیست؟
هویت در چینش دنباله تعداد کاراکترهایی است که دقیقاً بین دو دنباله مختلف مطابقت دارند. از این رو، شکاف ها هنگام ارزیابی هویت به حساب نمی آیند. اندازه‌گیری با توالی کوتاه‌تر در بین دو دنباله ارتباطی در نظر گرفته می‌شود. این به طور قابل توجهی نشان می دهد که در جایی که هویت دنباله متعدی نیست تأثیر دارد. اگر X=Y و Y=Z، آنگاه X لزوما برابر با Z نیست. این بر حسب اندازه‌گیری فاصله هویت استنتاج می‌شود.
شکل 02: هویت در تراز توالی
برای مثال، X دارای دنباله ای از AAGGCTT، Y دارای دنباله ای از AAGGC و Z دارای دنباله ای از AAGGCAT است. هویت بین X و Y 100٪ است {5 نوکلئوتید یکسان در دقیقه[طول(X)، طول(Y)]}. هویت بین Y و Z نیز 100٪ است. اما هویت بین X و Z فقط 85٪ است {(6 نوکلئوتید یکسان / 7)}.
شباهت‌های بین شباهت و هویت در چینش دنباله چیست؟
- هم شباهت و هم هویت دو اصطلاحی هستند که ما در تراز کردن دنباله استفاده می کنیم.
- همچنین، آنها به شباهت بین دو دنباله اشاره دارند.
- علاوه بر این، آنها را به عنوان یک مقدار درصد بیان می کنیم.
تفاوت بین شباهت و هویت در چینش دنباله چیست؟
شباهت در تراز، شباهت بین دو دنباله را هنگام مقایسه نشان می دهد، در حالی که هویت در هم ترازی دنباله میزان کاراکترهایی را که دقیقاً بین دو دنباله مختلف مطابقت دارند، نشان می دهد.بنابراین، این تفاوت کلیدی بین شباهت و هویت در چینش دنباله است.
خلاصه - شباهت در مقابل هویت در تراز توالی
هم ترازی توالی به شناسایی مناطق مشابه در DNA، RNA یا پروتئین کمک می کند که به دلیل رابطه عملکردی، ساختاری یا تکاملی بین توالی ها ایجاد شده است. از این رو، شباهت و هویت دو اصطلاح کلیدی در زمینه هم ترازی دنباله هستند. تفاوت اصلی بین این دو اصطلاح این است که شباهت شباهت بین دو دنباله در مقایسه است در حالی که هویت تعداد کاراکترهایی است که دقیقاً بین دو دنباله مختلف مطابقت دارند. بنابراین، این خلاصه ای از تفاوت بین شباهت و هویت در هم ترازی دنباله است.
