تفاوت کلیدی بین توالی حفظ شده و اجماع در این است که توالی حفظ شده به دنباله های مشابهی از اسیدهای نوکلئیک یا اسیدهای آمینه اشاره دارد که در گونه های مختلف یا یکسان در طول نسل ها رخ می دهند در حالی که توالی اجماع یک توالی نوکلئوتیدی یا توالی اسید آمینه است که معمولاً با آن مواجه می شویم. در یک ناحیه به شدت حفاظت شده از DNA یا RNA یا پروتئین.
جانداران دارای ویژگی های مشابه و همچنین متفاوتی هستند. هنگام مطالعه روابط بین موجودات و طبقه بندی آنها، ژنوم یا ترکیب ژنتیکی موجودات بسیار مهم است. توالی های نوکلئوتیدی یا آمینو اسیدی وجود دارند که در بین موجودات مختلف مشترک هستند.یک توالی حفظ شده یک توالی اسید نوکلئیک یا اسید آمینه است که در بین گونه ها سازگار است. بنابراین، آنها هنگام تولید درختان فیلوژنتیک از نظر فیلوژنتیکی مهم هستند. در توالی های حفاظت شده، توالی های نوکلئوتیدی خاصی وجود دارند که بیشتر یافت می شوند. آنها به عنوان توالی اجماع شناخته می شوند.
توالی حفظ شده چیست؟
توالی حفظ شده یک توالی اسید نوکلئیک یا توالی اسید آمینه است که در بین گونه ها مشابه است. بنابراین، در تمام گونه ها در طول تکامل سازگار است. به طور کلی، این توالی ها توسط انتخاب طبیعی حفظ می شوند. آنها در پشت درخت فیلوژنتیک بدون تغییر باقی می مانند. از این رو، توالی های حفاظت شده در ساخت درختان فیلوژنتیک مهم هستند. اعتقاد بر این است که توالی های بسیار حفاظت شده اغلب دارای ارزش عملکردی مهمی هستند. آنها در شناسایی بیماری های ژنتیکی نیز مفید هستند. با این حال، توالی های حفظ شده ممکن است توالی های اسید نوکلئیک کد کننده یا غیر کد کننده باشند. علاوه بر این، توالی های حفظ شده سرعت جهش کمتری را نشان می دهند.از این رو، آنها تغییرات بسیار کمی را در ترکیب خود نشان می دهند. گاهی اوقات، آنها تغییراتی را در طول نسل ها نشان نمی دهند.
شکل 01: دنباله حفظ شده
اجزای RNA ریبوزوم ها در همه حوزه های زندگی وجود دارند، توالی های هومئوباکس در یوکاریوت ها، و tmRNA در باکتری ها چندین نمونه از توالی های بسیار حفاظت شده هستند. شناسایی توالی های حفاظت شده زمانی که رویکردهای بیوانفورماتیک، به ویژه ابزار تراز توالی، استفاده می شود، آسان است. علاوه بر این، هم ترازی چند توالی تجسم توالی های حفظ شده را تسهیل می کند.
توالی اجماع چیست؟
توالی اجماع دنباله ای است که معمولاً در یک ناحیه حفاظت شده معین از DNA یا RNA یافت می شود. این یک توالی نوکلئوتیدی بسیار خاص است.به عنوان مثال، یک توالی اجماع در -10 به عنوان TATAAT (جعبه Pribnow) در پروموترهای E. coli وجود دارد که توالی های بسیار حفاظت شده هستند. به طور مشابه، توالی اجماع دیگری وجود دارد: TTGACA در پروموترهای E. coli در -35 نیز. توالی های اجماع به عنوان "جعبه" نیز شناخته می شوند.
شکل 02: توالی اجماع
علاوه بر DNA و RNA، پروتئین ها دارای توالی اجماع اسیدهای آمینه نیز هستند. محل های اتصال پروتئین اغلب با توالی های اجماع نشان داده می شوند. آنزیم های محدود کننده نیز دارای توالی اجماع هستند. علاوه بر این، مکان‌های اتصال نیز توالی‌های اجماع هستند. مشابه توالی‌های حفظ‌شده، توالی‌های اجماع را می‌توان با ابزارهای بیوانفورماتیک محاسبه و تجسم کرد.
شباهت های بین توالی حفظ شده و اجماع چیست؟
- توالی های حفاظت شده و توافقی توالی اسیدهای نوکلئیک یا اسیدهای آمینه هستند که در بین گونه ها مشترک هستند.
- هم توالی های حفاظت شده و هم اجماع را می توان با ابزارهای بیوانفورماتیک تجسم کرد.
- آنها به طور گسترده در زیست شناسی مولکولی استفاده می شوند.
تفاوت بین توالی حفظ شده و اجماع چیست؟
توالی حفظ شده یک توالی اسید نوکلئیک یا اسید آمینه است که در بین گونه ها سازگار است در حالی که توالی های اجماع بسیار خاص هستند و معمولاً بازها یا اسیدهای آمینه در یک منطقه حفاظت شده خاص یافت می شوند. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین توالی حفظ شده و اجماع است. علاوه بر این، تفاوت دیگر بین توالی حفظ شده و اجماع این است که توالی های حفظ شده از نظر فیلوژنتیکی مهم هستند در حالی که توالی های اجماع اغلب محل اتصال پروتئین، محل اتصال، محل برش آنزیم محدود کننده و غیره هستند.
خلاصه - توالی حفظ شده در مقابل اجماع
توالی های حفاظت شده توالی اسیدهای نوکلئیک یا پروتئین هایی هستند که در بین گونه های زنده مشابه هستند. یک پروموتر، محل اتصال ریبوزوم، منشاء همانندسازی و توالی اسید آمینه پروتئین هیستون چندین نمونه از توالی های حفاظت شده هستند. در مقابل، توالی‌های اجماع، بازها یا اسیدهای آمینه خاصی هستند که معمولاً در یک توالی حفاظت‌شده مشخص یافت می‌شوند. جعبه -10، جعبه -35 پروموتر E. coli، محل‌های اتصال پروتئین، محل‌های اتصال و مکان‌های شناسایی آنزیم‌های محدود چند نمونه از توالی‌های اجماع هستند. بنابراین، این خلاصه تفاوت بین توالی حفظ شده و اجماع است.
