تفاوت کلیدی بین قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1 این است که قطعه کلنو بخش بزرگی از DNA پلیمراز 1 است که فاقد فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3 است در حالی که DNA پلیمراز آنزیمی از E. coli است که هر سه آن را دارد. دامنه هایی از جمله فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3.
DNA پلیمراز یکی از آنزیم های کلیدی است که در همانندسازی DNA در موجودات زنده نقش دارد. اشکال مختلفی از آنزیم DNA پلیمراز بر اساس اندازه و شکل در یوکاریوت ها و پروکاریوت ها یافت می شود. DNA پلیمراز 1، 2 و 3 فقط در موجودات پروکاریوتی یافت می شود و نقش های متفاوتی در همانندسازی DNA ایفا می کنند. DNA پلیمراز 1 دارای سه حوزه با فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3، فعالیت اگزونوکلئاز 3 تا 5 و فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3 است. قطعه کلنو یک محصول پروتئولیتیک DNA پلیمراز 1 است. دارای فعالیت های 5 تا 3 'پلیمراز و 3' تا 5' اگزونوکلئاز DNA پلیمراز 1 دست نخورده است، اما فاقد فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3 است.
کلنو فرگمنت چیست؟
قطعه کلنو بخش بزرگی از DNA پلیمراز 1 است. برخلاف DNA پلیمراز 1، فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3 در قطعه کلنو دیده نمی شود زیرا فاقد دامنه اگزونوکلئاز 5 تا 3 است. قطعات کلنو با هضم DNA پلیمراز 1 با پروتئازی به نام سوبتیلیسین که یک آنزیم هضم کننده پروتئین است، تولید می شود. در برخی کاربردها، فعالیت اگزونوکلئاز 3 تا 5 قطعه کلنو نامطلوب می شود. می توان با وارد کردن جهش در ژنی که قطعه کلنو را کد می کند، آن را حذف کرد. آنزیم حاصل که فقط دارای فعالیت پلیمراز 5 تا 3 است به عنوان قطعه exo-Klenow شناخته می شود.از نظر مورفولوژیکی، قطعه کلنو شبیه دست راست انسان است. دارای دامنه N ترمینال 3'-5' exonuclease و دامنه C ترمینال پلیمراز است که با حدود 30 A از هم جدا شده اند.
شکل 01: قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1
قطعه کلنو یک ابزار مهم در تکنیک های بیولوژیکی مولکولی است. قطعات Klenow کاربردهای متعددی دارند. آنها در شبیه سازی انتهایی به منظور تولید قطعات بلانت بسیار مهم هستند. تکه های کلنو می توانند برآمدگی های 3 اینچی را از بین ببرند یا برآمدگی های 5 اینچی را پر کنند تا انتهای صاف تشکیل دهند. علاوه بر این، قطعات کلنو برای سنتز DNA دو رشته ای از تک رشته ها استفاده می شود. علاوه بر این، از آنها برای تهیه پروب های نشاندار شده رادیواکتیو با استفاده از فعالیت DNA پلیمراز وابسته به DNA 5 تا 3 استفاده می شود.
DNA پلیمراز 1 چیست؟
DNA پلیمراز 1 (Pol 1) آنزیمی است که در پروکاریوت ها یافت می شود و برای تکثیر DNA باکتریایی مورد نیاز است. این اولین نوع DNA پلیمراز است که توسط آرتور کورنبرگ در سال 1956 کشف شد. Pol 1 فراوان ترین پلیمراز در E.coli است. توسط ژن polA کدگذاری شده و از 928 اسید آمینه تشکیل شده است. از سه دامنه تشکیل شده است. هر سه دامنه عملکردهای مجزایی را انجام می دهند. دو دامنه فعالیت اگزونوکلئازی 5 تا 3 و فعالیت اگزونوکلئازی 3 تا 5 را انجام می دهند. به دلیل این فعالیت که Pol 1 دارد، به عنوان آنزیم ترمیم کننده DNA به جای آنزیم تکثیر کننده DNA محبوب است. دامنه سوم توانایی کاتالیز کردن پلیمریزاسیون های متعدد (5' تا 3') را قبل از انتشار DNA الگو و اتصال قطعات اوکازاکی با پر کردن DNA جدید و حذف پرایمرهای RNA دارد.
شکل 02: DNA پلیمراز
Pol 1 جدا شده از E Coli به طور گسترده در کاربردهای مولکولی استفاده شد. با این حال، هنگامی که Taq Polymerase کشف شد، جایگزین E Coli Pol 1 در فناوری PCR شد. Taq پلیمراز نوعی DNA پلیمراز مقاوم در برابر حرارت است که متعلق به Pol 1 است.
شباهت های بین قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1 چیست؟
- قطعه کلنو بخش بزرگی از DNA پلیمراز 1 است.
- آنها دارای فعالیت DNA پلیمراز وابسته به DNA 5 تا 3 و فعالیت اگزونوکلئازی 3' تا 5 هستند که واسطه تصحیح می شوند.
- آنها برای اهداف متعدد استفاده می شوند.
تفاوت بین قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1 چیست؟
تفاوت کلیدی بین قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1 این است که قطعه کلنو فاقد فعالیت اگزونوکلئاز 5 تا 3 است در حالی که DNA پلیمراز 1 دارای فعالیت اگزونوکلئازی 5 تا 3 است. بنابراین، قطعه کلنو دارای دو دامنه است، در حالی که DNA پلیمراز 1 دارای هر سه دامنه است.
اینفوگرافیک زیر جزئیات بیشتری از تفاوت بین قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1 را نشان می دهد.
خلاصه - قطعه کلنو در مقابل DNA پلیمراز 1
DNA پلیمراز 1 آنزیمی از E. coli است که دارای سه دامنه به عنوان دامنه پلیمریزاسیون 5 تا 3، دامنه اگزونوکلئاز 3 تا 5 و دامنه اگزونوکلئاز 5 تا 3 است. قطعه کلنو بخش بزرگی از DNA پلیمراز است. فاقد یک دامنه DNA پلیمراز 1 است که دامنه اگزونوکلئاز 5 تا 3 است. تفاوت اصلی بین قطعه کلنو و DNA پلیمراز 1 در این است که قطعات کلنو دامنه اگزونوکلئاز 5 تا 3 ندارند در حالی که DNA پلیمراز 1 دارای دامنه اگزونوکلئاز 5 تا 3 است.
