تفاوت اصلی بین استخراج DNA گیاهی و حیوانی در این است که در استخراج DNA گیاهی، لازم است دیواره سلولی با آسیاب کردن بافت در یخ خشک یا نیتروژن مایع شکسته شود تا در حین استخراج DNA حیوانات، محتویات سلولی آزاد شود. ، انجام این مرحله ضروری نیست زیرا سلول های حیوانی دیواره سلولی ندارند.
DNA ژنومی ماده ژنتیکی سلول های گیاهی و جانوری است. DNA ژنومی برای هر گیاه یا حیوان منحصر به فرد است. استخراج DNA از DNA با کیفیت خوب، پیش نیاز تحقیقات مولکولی است. DNA موجودات برای شناسایی، تشخیص بیماری‌ها، تشخیص ژن‌ها و توالی‌های خاص، اهداف پزشکی قانونی، آزمایش پدری، تعیین توالی ژنوم و توسعه داروها و غیره استخراج می‌شود.روش استخراج DNA بسته به نوع سلول متفاوت است - سلول حیوانی یا گیاهی.
استخراج DNA گیاهی چیست؟
DNA در سلول های گیاهی برای مطالعات مولکولی مختلف استخراج می شود. استخراج DNA ژنومی دست نخورده و خالص مورد نیاز است. از این رو، انواع مختلفی از پروتکل های استخراج DNA وجود دارد که با پروتکل های استخراج DNA از سلول های حیوانی متفاوت است. این به این دلیل است که سلول های گیاهی دارای دیواره سلولی هستند که باید شکسته شود تا محتویات سلولی خارج شود.
استخراج معمولاً با آسیاب کردن بافت های گیاه در یخ خشک یا نیتروژن مایع با استفاده از هاون و هاون انجام می شود. سپس غشای سلولی مختل می شود و محتوای سلولی به یک بافر استخراج خارج می شود. این معمولا با استفاده از مواد شوینده انجام می شود. بافر SDS (سدیم دودسیل سولفات) یا CTAB (ستیل تری متیل آمونیوم بروماید). DNA آزاد شده با استفاده از یک عامل کیلیت مانند EDTA از نوکلئازهای درون زا محافظت می شود. علاوه بر این، پروتئین ها با استفاده از کلروفرم یا فنل از DNA جدا می شوند.
شکل 01: استخراج DNA گیاهی
گیاهان پلی ساکاریدها و پلی فنل ها از جمله فلاونوئیدها و سایر متابولیت های ثانویه را سنتز می کنند. این ترکیبات با استخراج DNA ژنومی خالص تداخل دارند. از این رو، بیشتر پروتکل‌های استخراج DNA گیاهی شامل مرحله دیگری مانند تکنیک گرادیان چگالی کلرید سزیم برای حذف این ترکیبات می‌شود.
اکثر پروتکل های استخراج DNA استفاده از نمونه های برگ تازه را برای استخراج DNA توصیه می کنند. برخی از روش ها شامل مواد شیمیایی خطرناک مانند نیتروژن مایع و فنل نمی شوند. پروتکل CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) یک پروتکل محبوب استخراج DNA گیاهی است که استخراج DNA ژنومی گیاهی با کیفیت بالا را تسهیل می کند. این یک روش ساده، ایمن، قابل اعتماد و مقرون به صرفه برای استخراج DNA گیاهی است.اکثر روش‌های دیگر، نسخه‌های اصلاح‌شده روش CTAB هستند.
استخراج DNA حیوانی چیست؟
استخراج DNA حیوانی استخراج DNA ژنومی از سلول های حیوانی برای تجزیه و تحلیل مولکولی است. برخلاف استخراج DNA گیاهی، تجزیه دیواره سلولی برای سلول های حیوانی ضروری نیست، زیرا آنها فاقد دیواره سلولی هستند. سلول های خونی رایج ترین نوع سلول های حیوانی هستند که برای اهداف مختلف استفاده می شوند.
شکل 02: استخراج DNA
روش فنل-کلروفرم یکی از بهترین انتخاب ها برای سلول های خونی است. بازده و کیفیت DNA هنگام استخراج DNA از این روش بالا است. این یک پروتکل استخراج DNA مایع- مایع است و این روش مولکول‌های DNA را بر اساس حلالیت آنها در محلول‌های غیرقابل اختلاط جدا می‌کند.فنل، کلروفرم و ایزوآمیل الکل سه ماده اصلی این روش هستند.
شباهت بین استخراج DNA گیاهی و حیوانی چیست؟
- در طول استخراج DNA گیاهی و حیوانی، غشای سلولی باید مختل شود.
- DNA باید از نوکلئازهای درون زا محافظت شود.
- علاوه بر این، باید از برش DNA جلوگیری کرد.
- کیت های تجاری برای استخراج DNA گیاهی و DNA حیوانات موجود است.
- بیشتر روش های استخراج DNA گیاهی و جانوری نیاز به اصلاح و استانداردسازی مداوم دارند.
تفاوت بین استخراج DNA گیاهی و حیوانی چیست؟
تفاوت اصلی بین استخراج DNA گیاهی و حیوانی در این است که استخراج DNA گیاهی به آسیاب کردن بافت گیاه در یخ خشک یا نیتروژن مایع برای شکستن دیواره سلولی نیاز دارد در حالی که استخراج DNA حیوانات به این مرحله نیاز ندارد زیرا آنها حیوانی هستند. سلول ها دیواره سلولی ندارند.روش CTAB یکی از بهترین روش ها برای استخراج DNA گیاهی است در حالی که روش فنل-کلروفرم یکی از بهترین روش ها برای استخراج DNA حیوانات است.
در زیر اینفوگرافیک تفاوت‌های بین استخراج DNA گیاهی و حیوانی را نشان می‌دهد.
خلاصه - استخراج DNA گیاهی در مقابل حیوانی
روش های مختلفی برای استخراج DNA از انواع سلول های مختلف موجود است. بنابراین، پروتکل های استخراج DNA گیاهی با پروتکل های استخراج DNA سلول های حیوانی متفاوت است. استخراج DNA گیاهی به اختلال در دیواره سلولی، غشای سلولی و غشای هسته ای نیاز دارد در حالی که استخراج DNA حیوانی به تجزیه غشای سلولی و غشای هسته ای نیاز دارد. مهمتر از آن، استخراج DNA سلول حیوانی نیازی به برهم زدن دیواره سلولی با آسیاب کردن در یخ خشک یا نیتروژن مایع ندارد.بنابراین، این تفاوت کلیدی بین استخراج DNA گیاهی و حیوانی است.
