تفاوت کلیدی بین T4 DNA لیگاز و E. coli DNA لیگاز این است که T4 DNA لیگاز آنزیمی است که از باکتریوفاژ T4 جدا شده است در حالی که E. coli DNA لیگاز آنزیمی است که از باکتری E. coli جدا شده است..
DNA لیگاز نوع خاصی از آنزیم است که اتصال رشته های DNA به یکدیگر را از طریق تشکیل یک پیوند فسفودی استر تسهیل می کند. با ترمیم شکستگی های تک رشته ای و شکستگی های دو رشته ای در DNA موجودات زنده نقش مهمی ایفا می کند. علاوه بر این، DNA لیگاز هم در ترمیم DNA و هم در همانندسازی DNA استفاده می شود. جدای از کاربردهای فوق، DNA لیگاز در آزمایشات زیست شناسی مولکولی مانند فناوری DNA نوترکیب نیز کاربرد گسترده ای دارد. T4 DNA لیگاز و E. coli DNA لیگاز دو نوع آنزیم DNA لیگاز هستند.
T4 DNA Ligase چیست؟
لیگاز T4 یک آنزیم اتصال DNA است که از باکتریوفاژ T4 جدا شده است. باکتریوفاژ T4 ویروسی است که اشریشیا کلی را آلوده می کند. آنزیم لیگاز T4 رایج ترین DNA لیگاز مورد استفاده در تحقیقات آزمایشگاهی بیولوژیکی مولکولی است. به طور معمول، لیگاز T4 اتصال دو رشته منسجم یا بدون انتهای DNA دو رشته ای را بین گروه های فسفات 5 و هیدروکسیل 3 نوکلئوتیدهای مجاور کاتالیز می کند. همچنین می تواند اتصال RNA را به یک رشته DNA یا RNA در یک مولکول دوبلکس کاتالیز کند. با این حال، این آنزیم به اسیدهای نوکلئیک تک رشته ای نمی پیوندد. علاوه بر این، می‌تواند DNA انتهایی را با کارایی بسیار بیشتر از DNA لیگاز E.coli پیوند دهد.
شکل 01: T4 DNA لیگاز
این آنزیم به عنوان کوفاکتور به ATP نیاز دارد. برخی از آزمایش‌های تحقیقاتی مهندسی ژنتیک قبلاً آنزیم‌های DNA لیگاز فعال‌تری نسبت به نوع وحشی T4 DNA لیگاز تولید کرده‌اند. در یکی از رویکردها، آنها یک مولکول آنزیم همجوشی را با ترکیب T4 DNA لیگاز به مولکول p50 یا NF-kB ایجاد کردند. این آنزیم لیگاز T4 جدید 160٪ در بستن های انتهایی برای اهداف شبیه سازی فعال تر از نوع وحشی T4 DNA لیگاز بود. علاوه بر این، دمای بهینه برای لیگاز DNA T4 برای کاتالیز دقیق تر واکنش بستن 16 درجه سانتی گراد است.
E Coli DNA Ligase چیست؟
E. coli DNA لیگاز آنزیمی است که از باکتری E. coli جدا شده است. ژن مسئول ساخت DNA لیگاز E. coli ژن لیگ است. E. coli DNA، لیگاز و همچنین بیشتر DNA لیگازهای پروکاریوت ها، از انرژی بدست آمده توسط NAD (نیکوتین آدنین دی نوکلئوتید) برای ایجاد پیوند فسفودی استر استفاده می کنند.
شکل 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA لیگاز یک آنزیم بستن است که می تواند با کاتالیز کردن تشکیل پیوندهای فسفودی استر بین قطعات DNA دو رشته ای حاوی انتهای فسفات 5 و انتهای هیدروکسیل 3 به قطعات DNA بپیوندد. علاوه بر این، DNA با انتهای بی‌نقص را به جز در شرایط خاص مانند تراکم مولکولی با پلی اتیلن گلیکول پیوند نمی‌دهد. همچنین نمی تواند به طور موثر RNA را به DNA بپیوندد. علاوه بر این، فعالیت E. coli DNA لیگاز را می توان با حضور DNA پلیمراز 1 در غلظت مناسب افزایش داد. با این حال، زمانی که غلظت آنزیم DNA پلیمراز 1 بیشتر باشد، اثرات نامطلوبی بر فعالیت DNA لیگاز E. coli دارد.
شباهت بین T4 DNA Ligase و E Coli DNA Ligase چیست؟
- T4 DNA لیگاز و E-coli DNA لیگاز دو نوع آنزیم DNA لیگاز هستند.
- هر دو پروتئینی هستند که از اسیدهای آمینه تشکیل شده اند.
- این آنزیم ها تشکیل پیوند فسفودی استر را بین پایانه های 5 اینچ فسفات و 3' هیدروکسیل در DNA دوبلکس کاتالیز می کنند.
- آنها کاربردهای گسترده ای در آزمایشات زیست شناسی مولکولی مانند فناوری DNA نوترکیب دارند.
تفاوت بین T4 DNA Ligase و E Coli DNA Ligase چیست؟
T4 DNA لیگاز آنزیمی است که از باکتریوفاژ T4 جدا شده است در حالی که E. coli DNA لیگاز آنزیمی است که از باکتری E. coli جدا شده است. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین T4 DNA لیگاز و E. coli DNA لیگاز است. علاوه بر این، منبع انرژی برای لیگاز DNA T4 ATP است. از سوی دیگر، منبع انرژی برای E.coli DNA لیگاز NAD است.
اینفوگرافیک زیر تفاوت بین T4 DNA لیگاز و E coli DNA لیگاز را به صورت جدولی برای مقایسه کنار هم نشان می دهد.
خلاصه - T4 DNA Ligase در مقابل E Coli DNA Ligase
T4 DNA لیگاز و E. coli DNA لیگاز دو آنزیم هستند که تشکیل یک پیوند فسفودی استر را بین انتهای 5' فسفات و 3' هیدروکسیل در DNA دوبلکس کاتالیز می کنند. لیگاز T4 آنزیمی است که از باکتریوفاژ T4 جدا شده است در حالی که E. coli DNA لیگاز آنزیمی است که از باکتری E. coli جدا شده است. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین T4 DNA لیگاز و E coli DNA لیگاز است.
