تفاوت اصلی بین GFP و EGFP این است که GFP یک پروتئین نوع وحشی است که در شبیه سازی مولکولی سلول های غیر پستانداران گنجانده شده است در حالی که EGFP یک نوع بهبود یافته یا مهندسی شده از GFP است که می تواند در سلول های پستانداران استفاده شود..
شبیه سازی مولکولی یک تکنیک پیشرفته است که دانشمندان به شدت از آن در بیان پروتئین ها از طریق فناوری نوترکیب استفاده می کنند. در فناوری DNA نوترکیب، تبدیل ناقل نوترکیب با موفقیت به ارگانیسم میزبان ضروری است. از این رو، در طول فرآیند تبدیل، باید شناسایی و تأیید شود که آیا ژن مورد نظر به میزبان تبدیل شده است یا خیر. برای ارزیابی این موضوع، زیست شناسان مولکولی چندین تکنیک را اتخاذ می کنند.یکی از این تکنیک ها ژن گزارشگر است. این ژن های گزارشگر به عنوان نشانگرهای قابل انتخاب برای انتخاب ترانسفورماتورهای صحیح عمل می کنند. بنابراین، پروتئین فلورسنت سبز (GFP) و پروتئین فلورسنت سبز تقویت شده (EGFP) دو پروتئین گزارشگر هستند که در شبیه سازی مولکولی استفاده می شوند.
GFP چیست؟
GFP یک پروتئین نوع وحشی است که حاوی ۲۳۸ باقیمانده اسید آمینه و چندین ناحیه قابل انتخاب از توالی اسیدهای آمینه است که آن را از سایر پروتئین های فلورسنت متمایز می کند. علاوه بر این، این پروتئین نوع وحشی در اصل جدا از Aequorea Victoria بود. یک نوع چتر دریایی با این حال، در پدیده‌های طبیعی، چتر دریایی در پاسخ به محرک‌های خاصی توانست فلورسانس رنگ سبز تولید کند.
پیش از این، این مفهوم دانشمندان را شگفت زده کرد و آنها تصمیم گرفتند از آن در فناوری DNA نوترکیب خود استفاده کنند. در نتیجه، دانشمندان از این شکل جهش یافته از ژن نوع وحشی به عنوان یک ژن گزارشگر در مطالعات بیان ژن خود استفاده کردند. ژن نوع وحشی GFP قادر به تولید پروتئینی است که در دمای اتاق یا زیر نور UV فلورسانس می دهد.بنابراین، هنگامی که در ترانسفورمنت ها قرار می گیرد، فلورسانس را بیان می کند و تولید می کند. اگر فلورسانس پس از فرآیند تبدیل ایجاد شود، موفقیت فرآیند تبدیل را تأیید می کند. به عبارت ساده، انتشار فلورسانس انتقال موفقیت آمیز ناقل حامل ژن مورد نظر را به میزبان سیگنال می دهد.
شکل 01: GFP
به همین دلیل، GFP به عنوان یک نشانگر in vivo بیان ژن عمل می کند. در حال حاضر، تکنیک های مهندسی ژنتیک برای تولید GFP استفاده می شود. همچنین، بسیاری از نسخه های بهبود یافته GFP مانند EGFP در دسترس هستند. از این رو، این امکان استفاده موثر از GFP را در شبیه سازی مولکولی و مطالعات بیان ژن فراهم می کند.
EGFP چیست؟
پروتئین فلورسنت سبز تقویت شده یا EGFP یک نسخه بهبود یافته از GFP است.به عبارت ساده، ما می توانیم EGFP را به عنوان یک نسخه مهندسی شده از نوع وحشی GFP تعریف کنیم. هنگامی که ژن نوع وحشی GFP جهش می یابد، اثرات مفیدی ایجاد می کند. از این رو، ژن جهش یافته GFP اجازه بیان کاراکترهای جدید را می دهد و در نتیجه می توانیم GFP پیشرفته را با ویژگی های بهبود یافته تولید کنیم. علاوه بر این، می‌توانیم جهش‌ها را با موفقیت در ژن GFP نوع وحشی با استفاده از تابش یا روش‌های شیمیایی معرفی کنیم. این ژن‌های جهش‌یافته سپس EGFP را تولید می‌کنند که ویژگی‌های مفیدتری دارد.
شکل 02: EGFP
ویژگی های بهبود یافته EGFP به شرح زیر است؛
- قابلیت انتشار سیگنال های فلورسانس قوی تر.
- حساسیت بالایی دارد.
- می توان آن را به جای پروکاریوت ها و سایر یوکاریوت های سطح پایین تر روی سلول های پستانداران استفاده کرد.
- همچنین خلوص محصول را افزایش می دهد.
بنابراین، در مقایسه با GFP، EGFP انتخاب ارجح برای مطالعات بیان ژن است. با این حال، این محصول در مقایسه با GFP گران‌تر است.
شباهت‌های بین GFP و EGFP چیست؟
- GFP و EGFP دو پروتئینی هستند که توانایی انتشار رنگ سبز را دارند
- بنابراین، هر دو به عنوان پروتئین گزارشگر در مطالعات بیان ژن عمل می کنند.
- همچنین، می توان هر دو را با استفاده از فناوری DNA نوترکیب سنتز کرد.
- علاوه بر این، جهش بیشتر این دو نوع برای سنتز اشکال بهبود یافته آسان است.
تفاوت بین GFP و EGFP چیست؟
ژن گزارشگر ژنی است که به ژن مورد نظر در فناوری DNA نوترکیب متصل می شود. این سیگنال تبدیل موفقیت آمیز بردار نوترکیب را به میزبان می دهد.در اینجا، GFP و EGFP دو نوع پروتئین فلورسنت سبز هستند که به عنوان پروتئین گزارشگر عمل می کنند. با این حال، تفاوت اصلی بین GFP و EGFP این است که GFP یک نوع وحشی است در حالی که EGFP یک نسخه مهندسی شده از GFP است. علاوه بر این، EGFP ویژگی های مفیدتری نسبت به GFP دارد. به عنوان مثال، EGFP نور فلورسنت قوی تری تولید می کند و نسبت به GFP حساس تر است. تفاوت دیگر بین GFP و EGFP سیستم هایی است که می توانیم از آنها استفاده کنیم. سیستم های غیر پستانداران از GFP استفاده می کنند در حالی که سیستم های پستانداران از EGFP استفاده می کنند.
اینفوگرافیک زیر تفاوت بین GFP و EGFP را به صورت جدولی نشان می دهد.
خلاصه - GFP در مقابل EGFP
GFP و EGFP پروتئین های گزارشگر در شبیه سازی مولکولی و مطالعات بیان ژن هستند. GFP پروتئینی از نوع وحشی است که یک پروتئین فلورسنت سبز است.این پروتئین در ابتدا جدا از چتر دریایی Aequorea victoria بود. در مقابل، EFGP یک شکل تقویت شده از پروتئین GFP است. این یک جهش یافته از نوع وحشی با ویژگی های بهبود یافته است. از این رو، EFGP قدرت سیگنال و حساسیت بالاتری دارد. بنابراین، می‌توانیم از آن بر روی ناقل‌های پستانداران استفاده کنیم. در مقابل، استفاده از GFP عمدتاً فقط بر روی ناقلان غیر پستانداران است. در کل، این تفاوت بین GFP و EGFP است.
