تفاوت اصلی بین synteny و collinearity در این است که synteny هم‌محلی فیزیکی مکان‌های ژنتیکی روی کروموزوم یکسان در گونه‌ها است، در حالی که هم خطی، هم‌محلی فیزیکی مکان‌های ژنتیکی روی کروموزوم یکسان در گونه‌های مختلف است که حفظ می‌کنند. همان سفارش.
Synteny و collinearity دو اصطلاحی هستند که در ژنومیک به جای یکدیگر استفاده می شوند. هر دو اصطلاح الگوهای محلی سازی ژن را بر روی کروموزوم ها در گونه های مختلف توصیف می کنند. این ترتیبات ژنی مرتبط در میان گونه‌ها اطلاعات ارزشمندی هنگام استنباط اصل و نسب مشترک ژن‌ها هستند. سینتنی به هم‌محل‌سازی فیزیکی مکان‌های ژنتیکی در یک کروموزوم در گونه‌ها اشاره دارد.هم خطی به هم‌محلی فیزیکی مکان‌های ژنتیکی روی کروموزوم یکسان در گونه‌های مختلف با حفظ نظم یکسان اشاره دارد. بنابراین، شکلی از synteny است.
Synteny چیست؟
در گونه های مختلف، مجموعه ای از ژن ها در یک کروموزوم قرار دارند. و این هم‌محلی فیزیکی ژن‌ها در یک کروموزوم در گونه‌های مختلف به عنوان synteny شناخته می‌شود. همچنین این ژن ها در یک کروموزوم بسیار نزدیک به یکدیگر یافت می شوند. ترتیب ژن ها ممکن است لزوماً یکسان نباشد. اما، مکان یابی ژن ها در نزدیکی یکدیگر در یک کروموزوم مشابه در synteny صورت می گیرد. بنابراین، synteny عمدتاً الگوی توزیع ژن ها را در یک کروموزوم توصیف می کند. این الگوهای هم‌محلی‌سازی ژن نشان‌دهنده روابط بین گونه‌های مختلف و تکامل آنها است. با این حال، synteny می تواند به دلیل بازآرایی های کروموزومی مانند جابجایی، وارونگی و همجوشی کروموزوم، و غیره، تکرار، از دست دادن و نوترکیبی همولوگ نابرابر مختل شود.
شکل 01: Synteny
اعتقاد بر این است که همه ژن های مرتبط ترکیبی هستند. با این حال، همه ژن‌های مصنوعی لزوماً به هم مرتبط نیستند. آنها دارای توالی کروموزومی مشترک هستند. انسان دارای ژن های سنتنی بسیاری با پستانداران دیگر است. علاوه بر این، بسیاری از غلات دارای ژن سنتنی هستند.
Colinearity چیست؟
هم خطی شکل خاص تری از synteny است که در آن مجموعه ای از ژن ها بر روی کروموزوم یکسان گونه های مختلف به ترتیب مشابه گونه های اجدادی قرار دارند. بنابراین، اگر انحراف از همخطی بودن وجود داشته باشد، ویژگی فیلوژنتیکی قابل اعتمادتری خواهد بود زیرا همخطی بودن اصل و نسب مشترک ژن ها را توضیح می دهد.
شکل 02: هم خطی
تجزیه و تحلیل هم خطی چندراهی اطلاعات بسیار قابل اعتمادتری در مورد گونه های مرتبط و فیلوژنی آنها ارائه می دهد.
شباهت های بین Synteny و Colinearity چیست؟
- هم در synteny و هم هم خطی، مجموعه ای از جایگاه ها در دو گونه مختلف در یک کروموزوم قرار دارند.
- این عبارات هم محلی سازی فیزیکی مکان های ژنتیکی روی یک کروموزوم را توصیف می کنند.
- هم خطی شکل خاصی از synteny است.
- گاهی اوقات هر دو اصطلاح در ژنومیک به جای یکدیگر استفاده می شوند.
- اگر دو ناحیه دارای هم خطی باشند، واضح است که همزمان هستند.
- آنها در استنباط فیلوژنی مفید هستند.
تفاوت بین Synteny و Colinearity چیست؟
Synteny و collinearity دو اصطلاحی هستند که در ژنومیک به جای یکدیگر استفاده می شوند. Synteny به هم‌محلی فیزیکی مجموعه‌ای از ژن‌ها در یک کروموزوم در گونه‌های مختلف اشاره دارد. هم خطی شکلی از synteny است که در آن مجموعه ای از ژن ها به یک ترتیب در بین گونه های مختلف به طور مشترک محلی سازی می شوند. بنابراین، این تفاوت کلیدی بین synteny و collinearity است.
خلاصه - Synteny در مقابل Colinearity
اصطلاح synteny و collinearity به مجموعه ای از ژن ها اشاره دارد که در یک کروموزوم در گونه های مختلف قرار دارند. در واقع، این ژن‌ها در یک کروموزوم در گونه‌های مختلف همزمان قرار می‌گیرند. Synteny هم‌محلی فیزیکی ژن‌های مجموعه‌ای را در یک کروموزوم در گونه‌های مختلف توصیف می‌کند، در حالی که همخطی شکل خاصی از synteny است که در آن مجموعه ژن‌ها به همان ترتیب هم‌محل می‌شوند.بنابراین، این تفاوت بین synteny و collinearity را خلاصه می کند.
