تفاوت اساسی بین ایزواسکیزومرها و نئواسکیزومرها در این است که ایزواسکیزومرها آنزیم های محدودکننده ای هستند که توالی شناسایی یکسانی دارند و DNA را در موقعیت های یکسانی می شکافند، در حالی که نئواسکیزومرها آنزیم های محدود کننده ای هستند که توالی شناسایی یکسانی دارند اما DNA را در موقعیت های مختلف می شکافند..
آنزیم های محدود کننده یا اندونوکلئازهای محدود کننده آنزیم هایی هستند که DNA را به قطعات در یا نزدیک مکان های شناسایی خاص می شکافند. آنها DNA را در مکان های محدود قطع می کنند. آنزیمهای محدودکننده معمولاً بر اساس ساختار به پنج گروه طبقهبندی میشوند، اینکه آیا سوبسترای DNA خود را در محل تشخیص خود برش میدهند و آیا مکانهای شناسایی و برش از یکدیگر جدا هستند.بیش از 3600 اندونوکلئاز محدود کننده قبلاً شناسایی شده است. تقریباً 800 آنزیم محدود کننده به صورت تجاری در دسترس هستند. ایزواسکیزومرها و نئواسکیزومرها دو نوع آنزیم محدودکننده هستند که بر اساس محل تشخیص و ویژگی شکاف هستند.
ایزواسکیزومرها چیست؟
ایزواسکیزومرها آنزیمهای محدودکنندهای هستند که توالی شناسایی یکسانی دارند و DNA را در موقعیتهای مشابهی میشکافند. این آنزیم های محدود کننده دارای ویژگی یکسانی هستند. اولین آنزیم محدود کشف شده که یک توالی معین را تشخیص می دهد به عنوان یک نمونه اولیه شناخته می شود، در حالی که تمام آنزیم های محدود کننده شناسایی شده بعدی که همان توالی را تشخیص می دهند ایزوسکیزومر نامیده می شوند. با این حال، ایزواسکیزومرها ممکن است در ترجیحات مکان، شرایط واکنش، حساسیت متیلاسیون و فعالیت ستاره متفاوت باشند. ایزواسکیزومرها از سویه های مختلف باکتری جدا می شوند. بنابراین، آنها ممکن است به شرایط واکنش متفاوتی نیاز داشته باشند. در برخی موارد، تنها یکی از یک جفت ایزوسکیزومر میتواند هر دو شکل متیله و غیر متیله مکانهای محدودیت را تشخیص دهد.از طرف دیگر، آنزیم محدود کننده دیگر فقط می تواند شکل غیر متیله محل محدودیت را تشخیص دهد. این ویژگی خاص ایزوسکیزومرها به شناسایی حالت متیلاسیون محل محدودیت کمک می کند و در عین حال آن را از حالت باکتریایی جدا می کند.
برای مثال، AgeI و BshT1 5'-A↓CCGGT را در یک الگو تشخیص می دهند و می شکنند. HpaII و MSPI جفت دیگری از ایزواسکیزومرها هستند. هر دوی آنها توالی 5'-C↓CGG-3' را زمانی که متیله نشده است تشخیص می دهند. اما وقتی C دوم دنباله متیله می شود، فقط MSPI می تواند این دنباله را تشخیص دهد در حالی که HpaII نمی تواند آن را تشخیص دهد.
Neoschizomers چیست؟
Neoschizomers آنزیم های محدود کننده ای هستند که توالی شناسایی یکسانی دارند اما DNA را در موقعیت های مختلف می شکافند. در برخی از کاربردهای بیولوژیکی مولکولی خاص، این یک ویژگی بسیار مفید است. نئوشیزومرها زیر مجموعه ای از ایزواسکیزومرها هستند. نمونه های شناخته شده برای نئوشیزومرها عبارتند از SmaI (5'-CCC↓GGG-3') و XmaI (5'-C↓CCGGG-3'). هر دو توالی 5'-CCCGGG-3' را تشخیص می دهند اما آنها را در موقعیت متفاوتی می شکنند.بنابراین، این دو آنزیم محدود کننده انواع مختلفی از انتهای تولید می کنند. در این مورد، SmaI انتهای صاف و XmaI انتهای بیرون زده 5 اینچ تولید می کند.
شکل 01: نئوشیزومرها
یک مثال دیگر جفت آنزیم های محدود کننده MaeII و Tail است. نمونه اولیه MaeII (A↓CGT) قطعات DNA را با پسوند 2 پایه 5 تولید می کند، و Neoschizomer Tail (ACGT↓) قطعات DNA را با پسوند 4-base3 تولید می کند.
شباهتهای بین ایزواسکیزومرها و نئوشیزومرها چیست؟
- ایزواسکیزومرها و نئوشیزومرها دو نوع آنزیم محدودکننده هستند.
- آنها عمدتاً در پروکاریوت ها یافت می شوند.
- آنها بخشی از سیستم تغییر محدودیت (RM) هستند که در باکتری ها و باستانی ها یافت می شوند.
- هر دو مولکول پروتئین هستند.
- هر دو DNA را به قطعات تقسیم می کنند.
تفاوت بین Isoschizomers و Neoschizomers چیست؟
ایزواسکیزومرها آنزیمهای محدودکنندهای هستند که توالی شناسایی یکسانی دارند و DNA را در موقعیتهای یکسانی میشکافند، در حالی که نئوشیزومرها آنزیمهای محدودکنندهای هستند که توالی شناسایی یکسانی دارند اما DNA را در موقعیتهای متفاوتی میشکافند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین ایزواسکیزومرها و نئوشیزومرها است. علاوه بر این، ایزواسکیزومرها دارای ویژگی های یکسانی هستند در حالی که نئوشیزومرها دارای ویژگی های متفاوت هستند.
اینفوگرافیک زیر تفاوتهای بین ایزواسکیزومرها و نئوشیزومرها را به شکل جدولی برای مقایسه کنار هم فهرست میکند.
خلاصه - Isoschizomers در مقابل Neoschizomers
آنزیم های محدود کننده آنزیم های برش DNA هستند. به آنها قیچی مولکولی نیز می گویند. انواع مختلفی از آنزیم های محدود کننده وجود دارد.بر اساس محل تشخیص و ویژگی شکاف، آنزیم های محدود کننده دو نوع ایزوسکیزومر و نئواسکیزومر هستند. ایزواسکیزومرها توالی شناسایی یکسانی دارند و DNA را در موقعیت های یکسانی می شکافند در حالی که نئواسکیزومرها توالی تشخیص یکسانی دارند اما DNA را در موقعیت های مختلف می شکافند. بنابراین، این تفاوت اصلی بین ایزواسکیزومرها و نئوشیزومرها است.